Contig 013648:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

clone5'-sequence3'-sequence
Seq.lengthcontigBestHitEvaluedescriptionlengthcontigBestHitEvaluedescription
JMFF011E05Sequence382013648 (2)392013648 (2)

Alignment

This contig is upended


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JMFF011E05- GAGCACCAGCATGCAGAACGCTCCCGGAACTG
rJMFF011E05+ GAGCACCAGCATGCAGAACGCTCCCGGAACTG
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consensus GAGCACCAGCATGCAGAACGCTCCCGGAACTG
 
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JMFF011E05- ATAACTAGGAGGAAGAAGAATTGAAGAAGAAAAGAGTTTTGTGCCGGAGGGATTTTCTCC
rJMFF011E05+ ATAACTAGGAGGAAGAAGAATTGAAGAAGAAAAGAGTTTTGTGCCGGAGGGATTTTNTCC
                      ____________________________________________________________
consensus ATAACTAGGAGGAAGAAGAATTGAAGAAGAAAAGAGTTTTGTGCCGGAGGGATTTTCTCC
 
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JMFF011E05- CATGCTTTTGGCTGCTCTGGGGTCGTTGTGGAATCTCCAGCGTGTTCTGTTCGGTCGGAG
rJMFF011E05+ CATGCTTTTGGCTGCTNTGGGGTCGTTGTGGAATNTCCAGCGTGTTNTGTTCGGTCGGAG
                      ____________________________________________________________
consensus CATGCTTTTGGCTGCTCTGGGGTCGTTGTGGAATCTCCAGCGTGTTCTGTTCGGTCGGAG
 
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JMFF011E05- GTGCATCAGCATGCATGTCGTTTTTCCGGCGTATTTAAATTTTATTTTATACGTGACCAT
rJMFF011E05+ GTGCATCAGCATGCATGTCGTTTTTCCGGCGTATTTAAATTTTATTTTATACGTGACCAT
                      ____________________________________________________________
consensus GTGCATCAGCATGCATGTCGTTTTTCCGGCGTATTTAAATTTTATTTTATACGTGACCAT
 
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JMFF011E05- TATGTATATTTGAACTTTTGATTTAATTTATATTTTTGATTTATTTTTTTTTTTAAAATG
rJMFF011E05+ TATGTATATTTGAACTTTTGATTTAATTTATATTTTTGATTTATTTTTTTTTTTAAAATG
                      ____________________________________________________________
consensus TATGTATATTTGAACTTTTGATTTAATTTATATTTTTGATTTATTTTTTTTTTTAAAATG
 
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JMFF011E05- AGTATATTGTTGTAAAATGTTAACTTTGTGACCATATATTCTATTTTCTAGGATCATGGA
rJMFF011E05+ AGTATATTGTTGTAAAATGTTAACTTTGTGACCATATATTCTATTTTCTAGGATCATGGA
                      ____________________________________________________________
consensus AGTATATTGTTGTAAAATGTTAACTTTGTGACCATATATTCTATTTTCTAGGATCATGGA
 
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JMFF011E05- TTGACAATTTAAGGCCTTTTTATGTTGATGTAATGTAATGGTTAATGG
rJMFF011E05+ TTGACAATTTAAGGCCTTTTTATGTTGATGTAATGTAATGGTTAATGGTGTATTCAGATG
                      ____________________________________________________________
consensus TTGACAATTTAAGGCCTTTTTATGTTGATGTAATGTAATGGTTAATGGTGTATTCAGATG