Contig 012820:  Sequence
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rJMFF005E15-                                                     ATTATTTAGCAGGAGAA
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consensus                                                        ATTATTTAGCAGGAGAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF005E15-          GGAACTGGATAAAGAGACCCCATATTATCCAGCAGGACATATCTACCAAAGCATTCATCA
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF005E15-          AACTGATCTACATAGTTATCCGCAATGCAATCAGCATCAGATTGAATAGCTATCAGCAAG
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF005E15-          GATGCTCTCGTGCTAGAAACAAGTATCAGGTGAGGAAAATACAACCATGAACCGGCGCTA
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF005E15-          AGGTCCAAACTTAGGGGTTTGGTGTCATATAGCTTATAGAAGGAATGCTATATAGAACCA
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF005E15-          GCATAAGTGCATATCACAGGTTTGTGAGTCAACTGCAACTGCTACAATTAAAAGTGCACT
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF005E15-          TCACCCTCTTTCAGATGAACACCGCTAAGGCTCCAATCATTGCCGTTCAGAAAATTTGGA
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF005E15-          AACAAATGGGAGTTTGTCACCAGCAAACACATACACTAACAATCAACAGCGAAGTACACA
                      ____________________________________________________________
consensus             AACAAATGGGAGTTTGTCACCAGCAAACACATACACTAACAATCAACAGCGAAGTACACA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF005E15-          CAGGAGACACAGCATCAACAGCTGTTGCAAAATCGTGCAATTCAGCAACATTCACTCGTC
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF005E15-          ACGCACATAAAAATAAGTTTCTGCAAATTTGTTCTACCAAGCACTAAACAGACGATATCA
JMFN039H10+                     AAATAAGTTTCTGCAAATTGTTTCTACCAAGCACTAAACAGACGATATCA
JMFF005E15+                                                        AAACAGACGATATCA
                      ____________________________________________________________
consensus             ACGCACATAAAAATAAGTTTCTGCAAATTTTTTCTACCAAGCACTAAACAGACGATATCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF005E15-          TCATCGAATGCCCCCTTCAAGGATAACAACGCTAAAATAGGAACACCATGGGAGAAATTC
JMFN039H10+           TCATCGAATGCCCCCTTCAAGGATAACAACGCTAAAATAGGAACACCAT-GGAGAAATTC
JMFF005E15+           TCATCGAATGCCCCCTTCAAGGATAACAACGCTAAAATAGGAACACCAT-GGAGAAATTC
                      ____________________________________________________________
consensus             TCATCGAATGCCCCCTTCAAGGATAACAACGCTAAAATAGGAACACCAT-GGAGAAATTC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF005E15-          ATCAATGCTTCTTCGCTGTCACTCATCAGCATCA                          
JMFN039H10+           ATCAATGCTTCTTCGCTGTCACTCATCAGCATCAGAACGTGGAGACGGGCTTCGAGACTC
JMFF005E15+           ATCAATGCTTCTTCGCTGTCACTCATCAGCATCAGAACGTGGAGACGGGCTTCGAGACTC
                      ____________________________________________________________
consensus             ATCAATGCTTCTTCGCTGTCACTCATCAGCATCAGAACGTGGAGACGGGCTTCGAGACTC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN039H10+           AGCCCCCCGGCCACGGGGTGACAAACTTCTTGGAGTTGGAGAGCGTACTTTGTCATTGCG
JMFF005E15+           AGCCCCCCGGCCACGGGGTGACAAACTTCTTGGAGTTGGAGAGCGTACTTTGTCATTGCG
                      ____________________________________________________________
consensus             AGCCCCCCGGCCACGGGGTGACAAACTTCTTGGAGTTGGAGAGCGTACTTTGTCATTGCG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN039H10+           TCCATCTGGACTGCCATCCCTAGATTGAGGGGTTCTGCGAGGAGATGGACTCCTCCTTGG
JMFF005E15+           TCCATCTGGACTGCCATCCCTAGATTGAGGGGTTCTGCGAGGAGATGGACTCCTCCTTGG
                      ____________________________________________________________
consensus             TCCATCTGGACTGCCATCCCTAGATTGAGGGGTTCTGCGAGGAGATGGACTCCTCCTTGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN039H10+           ACTTGGGCTACCATCCCTAGGTTGAGGGGTTCTGCGAGGAGATGGACTCCTCGTTGGACT
JMFF005E15+           ACTTGGGCTACCATCCCTAGGTTGAGGGGTTCTGCGAGGAGATGGACTCCTCGTTGGACT
                      ____________________________________________________________
consensus             ACTTGGGCTACCATCCCTAGGTTGAGGGGTTCTGCGAGGAGATGGACTCCTCGTTGGACT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN039H10+           TGGGCTACGCCGAGCAGGAGAGGCACTTCCATAGGAACGACTTCGGCTACGCCTCTCATC
JMFF005E15+           TGGGCTACGCCGAGCAGGAGAGGCACTTCCATAGGAACGACTTCGGCTACGCCTCTCATC
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN039H10+           ATCATATCTACCTCTACCACGATCTTT                                 
JMFF005E15+           ATCATATCTACCTCTACCACGATCTTTATGGTAATCAGGGCTTCCACTGCGGCTTCTGTA
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF005E15+           CCGATGACGATCTCTATCCCTGCCACGGTATCGATCATGCTCAGATCTACCCCGACTTCT
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consensus             CCGATGACGATCTCTATCCCTGCCACGGTATCGATCATGCTCAGATCTACCCCGACTTCT
 
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JMFF005E15+           ACTCCTGCTCCTCTTTAATAATCTCTATCTCTATGATCATCTCTATACCTTGATCTAGGA
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consensus             ACTCCTGCTCCTCTTTAATAATCTCTATCTCTATGATCATCTCTATACCTTGATCTAGGA