Contig 012596:  Sequence
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JMSF020J09-                                                   GGGAAGTGGGCTATAGGGGC
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consensus                                                     GGGAAGTGGGCTATAGGGGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF020J09-           GCAAGTTCTTGAAGCGCCGCTGCGTCCCCAACTGCCAGTTCGCCCCCTACTTCCGCTCCG
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF020J09-           ACGACCCCAAGAAATTCGCCAAAGTTCACAAGGTGTTCGGCGCCAGCAATGTGAGCAAGA
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF020J09-           CCGAGGTCCGCCTCAGGGACCCCGTCTACGGCTGCATTGGCGCCATCGCCTCCCTCCAGC
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF020J09-           GCCGCATGGCCGAGCTCCAGAATGATCTCCTCCTCGCCAGAGCCCGCCTCGCTTTCTACG
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF020J09-           CCACCGCCAATCCCCCCACCGCCGCTTCCTCCTCTTCCTCCTCCTTTAATTATGATCATC
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consensus             CCACCGCCAATCCCCCCACCGCCGCTTCCTCCTCTTCCTCCTCCTTTAATTATGATCATC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF020J09-           TCAACGCCAATCTGCCCTCTTCTTACCTGGATTTTCCGCCCTCCGGTGGCTTCTCCGGCA
rJMSF020J09+          TCAACGCCAATCTGCCCTCTTCTTACCTGGATTTTCCGCCCTCCGGTGGCTTCTCCGGCA
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consensus             TCAACGCCAATCTGCCCTCTTCTTACCTGGATTTTCCGCCCTCCGGTGGCTTCTCCGGCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF020J09-           CCTATGATCATCACCAGAATTCTCTGATTCTTGATCACACTGGATCACTCAATCCATTTG
rJMSF020J09+          CCTATGATCATCACCAGAATTCTCTGATTCTTGATCACACTGGATCACTCAATCCATTTG
                      ____________________________________________________________
consensus             CCTATGATCATCACCAGAATTCTCTGATTCTTGATCACACTGGATCACTCAATCCATTTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF020J09-           GCCAATTCCCATTCCCTTAATCAATTAATATCATCTTTATCCCTCCATGTAGTAATATTT
rJMSF020J09+          GCCAATTCCCATTCCCTTAATCAATTAATATCATCTTTATCCCTCCATGTAGTAATATTT
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consensus             GCCAATTCCCATTCCCTTAATCAATTAATATCATCTTTATCCCTCCATGTAGTAATATTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF020J09-           TGTCCGCTCAGTTAG                                             
rJMSF020J09+          TGTCCGCTCAGTTAGTTTTTGAGTGACAAACTGTGGGCAGGTAATAATCTGGAGGGCCAT
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consensus             TGTCCGCTCAGTTAGTTTTTGAGTGACAAACTGTGGGCAGGTAATAATCTGGAGGGCCAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF020J09+          GGCCAGAATGGCATTGGGACTTCATGCTACTTAGTTTAATGTAATTAATTATTTATTATT
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consensus             GGCCAGAATGGCATTGGGACTTCATGCTACTTAGTTTAATGTAATTAATTATTTATTATT