| clone | 5'-sequence | 3'-sequence | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Seq. | length | contig | BestHit | Evalue | description | length | contig | BestHit | Evalue | description | |
| JMFF008A06 | Sequence | 484 | 012491 (22) | ||||||||
| JMFF010D20 | Sequence | 563 | 012491 (22) | ref|XP_009624198.1| | 2e-56 | PREDICTED: glycine-rich RNA-binding protein 2, mitochondrial-like [Nicotiana to | 726 | 012491 (22) | gb|KJB39955.1| | 2e-07 | hypothetical protein B456_007G039400 [Gossypium raimondii] |
| JMFF011D09 | Sequence | 534 | 012491 (22) | ref|XP_009624198.1| | 1e-56 | PREDICTED: glycine-rich RNA-binding protein 2, mitochondrial-like [Nicotiana to | 649 | 012491 (22) | |||
| JMFF016L21 | Sequence | 571 | 012491 (22) | ref|XP_009624198.1| | 2e-56 | PREDICTED: glycine-rich RNA-binding protein 2, mitochondrial-like [Nicotiana to | 724 | 012491 (22) | gb|KJB39955.1| | 2e-07 | hypothetical protein B456_007G039400 [Gossypium raimondii] |
| JMFF026E06 | Sequence | 537 | 012491 (22) | ref|XP_009624198.1| | 1e-56 | PREDICTED: glycine-rich RNA-binding protein 2, mitochondrial-like [Nicotiana to | 663 | 012491 (22) | |||
| JMFF026E21 | Sequence | 538 | 012491 (22) | ref|XP_009624198.1| | 1e-56 | PREDICTED: glycine-rich RNA-binding protein 2, mitochondrial-like [Nicotiana to | 111 | 012491 (22) | |||
| JMFF026E22 | Sequence | 457 | 012491 (22) | ref|XP_009624198.1| | 1e-56 | PREDICTED: glycine-rich RNA-binding protein 2, mitochondrial-like [Nicotiana to | |||||
| JMFF035F12 | Sequence | 532 | 012491 (22) | ref|XP_009624198.1| | 1e-56 | PREDICTED: glycine-rich RNA-binding protein 2, mitochondrial-like [Nicotiana to | 746 | 012491 (22) | |||
| JMFF045G15 | Sequence | 628 | 012491 (22) | ref|XP_009624198.1| | 5e-56 | PREDICTED: glycine-rich RNA-binding protein 2, mitochondrial-like [Nicotiana to | 426 | 012491 (22) | |||
| JMFF051I20 | Sequence | 550 | 012491 (22) | ref|XP_009624198.1| | 3e-55 | PREDICTED: glycine-rich RNA-binding protein 2, mitochondrial-like [Nicotiana to | 530 | 012491 (22) | |||
| JMSF008I09 | Sequence | 412 | 012491 (22) | ref|XP_009624198.1| | 3e-55 | PREDICTED: glycine-rich RNA-binding protein 2, mitochondrial-like [Nicotiana to | 769 | 012491 (22) | gb|KJB39955.1| | 2e-13 | hypothetical protein B456_007G039400 [Gossypium raimondii] |
| JMSF051P01 | Sequence | 704 | 012491 (22) | ref|XP_009624198.1| | 6e-56 | PREDICTED: glycine-rich RNA-binding protein 2, mitochondrial-like [Nicotiana to | 743 | 012491 (22) | gb|KJB39955.1| | 9e-08 | hypothetical protein B456_007G039400 [Gossypium raimondii] |
This contig is upended
. : . : . : . : . : . :
JMFF045G15- ACTTAAACCTCCTTCGATCGAAAACCTCTCTACTAGGGTTTTACAGAAATCGTC
JMFF051I20- ACTTAAACCTCCTTCGATCGAAAACCTCTCTACTAGGGTTTTACAGAAATCGTC
JMFF016L21- ACTTGAACCTCCTTCGATCGAAAACCTCTCTACTAGGGTTTTACAGAAATCGTC
JMFF026E06- ACTTAAACCTCCTTCGATCGAAAACCTCTCTACTAGGGTTTTACAGAAATCGTC
JMFF011D09- ACTTAAACCTCCTTCGATCGAAAACCTCTCTACTAGGGTTTTACAGAAATCGTC
JMFF026E22- ACTTAAACCTCCTTCGATCGAAAACCTCTCTACTAGGGTTTTACAGAAATCGTC
JMFF026E21- ACTTAAACCTCCTTCGATCGAAAACCTCTCTACTAGGGTTTTACAGAAATCGTC
JMFF035F12- CTTAAACCTCCTTCGATCGAAAACCTCTCTACTAGGGTTTTACAGAAATCGTC
JMFF010D20- ACTTAAACCTCCTTCGATCGAAAACCTCTCTACTAGGGTTTTACAGAAATCGTC
JMSF008I09- ACTTAAACCTCCTTCGATCGAAAACCTCTCTACTAGGGTTTTACAGAAATCGTC
JMSF051P01- GCACTTAAACCTCCTTCGATCGAAAACCTCTCTACTAGGGTTTTACAGAAATCGTC
____________________________________________________________
consensus GCACTTAAACCTCCTTCGATCGAAAACCTCTCTACTAGGGTTTTACAGAAATCGTC
. : . : . : . : . : . :
JMFF045G15- TAAGAATGGCTTTCTTTAGTAAAGCTGGGAATGTACTCCGACAGGTGGTTAACAAGCCGC
JMFF051I20- TAAGAATGGCTTTCTTTAGTAAAGCTGGGAATGTACTCCGACAGGTGGTTAACAAGCCGC
JMFF016L21- TAAGAATGGCTTTCTTTAGTAAAGCTGGGAATGTACTCCGACAGGTGGTTAACAAGCCGC
JMFF026E06- TAAGAATGGCTTTCTTTAGTAAAGCTGGGAATGTACTCCGACAGGTGGTTAACAAGCCGC
JMFF011D09- TAAGAATGGCTTTCTTTAGTAAAGCTGGGAATGTACTCCGACAGGTGGTTAACAAGCCGC
JMFF026E22- TAAGAATGGCTTTCTTTAGTAAAGCTGGGAATGTACTCCGACAGGTGGTTAACAAGCCGC
JMFF026E21- TAAGAATGGCTTTCTTTAGTAAAGCTGGGAATGTACTCCGACAGGTGGTTAACAAGCCGC
JMFF035F12- TAAGAATGGCTTTCTTTAGTAAAGCTGGGAATGTACTCCGACAGGTGGTTAACAAGCCGC
JMFF010D20- TAAGAATGGCTTTCTTTAGTAAAGCTGGGAATGTACTCCGACAGGTGGTTAACAAGCCGC
JMSF008I09- TAAGAATGGCTTTCTTTAGTAAAGCTGGGAATGTACTCCGACAGGTGGTTAACAAGCCGC
JMSF051P01- TAAGAATGGCTTTCTTTAGTAAAGCTGGGAATGTACTCCGACAGGTGGTTAACAAGCCGC
____________________________________________________________
consensus TAAGAATGGCTTTCTTTAGTAAAGCTGGGAATGTACTCCGACAGGTGGTTAACAAGCCGC
. : . : . : . : . : . :
JMFF045G15- AAATCAGCCATGAGATCTCTGCATCCACACCCTCAGTTTTCCAAATCCTGCGATTTATGT
JMFF051I20- AAATCAGCCATGGGATCTCTGCATCCACACCCTCAGTTTTCCAAATCCTGCGATTTATGT
JMFF016L21- AAATCAGCCATGAGATCTCTGCATCCACACCCTCAGTTTTCCAAATCCTGCGATTTATGT
JMFF026E06- AAATCAGCCATGAGATCTCTGCATCCACACCCTCAGTTTTCCAAATCCTGCGATTTATGT
JMFF011D09- AAATCAGCCATGAGATCTCTGCATCCACACCCTCAGTTTTCCAAATCCTGCGATTTATGT
JMFF026E22- AAATCAGCCATGAGATCTCTGCATCCACACCCTCAGTTTTCCAAATCCTGCGATTTATGT
JMFF026E21- AAATCAGCCATGAGATCTCTGCATCCACACCCTCAGTTTTCCAAATCCTGCGATTTATGT
JMFF035F12- AAATCAGCCATGAGATCTCTGCATCCACACCCTCAGTTTTCCAAATCCTGCGATTTATGT
JMFF010D20- AAATCAGCCATGAGATCTCTGCATCCACACCCTCAGTTTTCCAAATCCTGCGATTTATGT
JMSF008I09- AAATCAGCCATGAGATCTCTGCATCCACACCCTCAGTTTTCCAAATCCTGCGATTTATGT
JMSF051P01- AAATCAGCCATGAGATCTCTGCATCCACACCCTCAGTTTTCCAAATCCTGCGATTTATGT
____________________________________________________________
consensus AAATCAGCCATGAGATCTCTGCATCCACACCCTCAGTTTTCCAAATCCTGCGATTTATGT
. : . : . : . : . : . :
JMFF045G15- CATCTTCAAAAGTTTTTGTAGGAGGAATCTCTTGGAGTACAAGTGATGCAAGTCTTCAAG
JMFF051I20- CATCTTCAAAAGTTTTTGTAGGAGGAATCTCTTGGAGTACAAGTGATGCAAGTCTTCAAG
JMFF016L21- CATCTTCAAAAGTTTTTGTAGGAGGAATCTCTTGGAGTACAAGTGATGCAAGTCTTCAAG
JMFF026E06- CATCTTCAAAAGTTTTTGTAGGAGGAATCTCTTGGAGTACAAGTGATGCAAGTCTTCAAG
JMFF011D09- CATCTTCAAAAGTTTTTGTAGGAGGAATCTCTTGGAGTACAAGTGATGCAAGTCTTCAAG
JMFF026E22- CATCTTCAAAAGTTTTTGTAGGAGGAATCTCTTGGAGTACAAGTGATGCAAGTCTTCAAG
JMFF026E21- CATCTTCAAAAGTTTTTGTAGGAGGAATCTCTTGGAGTACAAGTGATGCAAGTCTTCAAG
JMFF035F12- CATCTTCAAAAGTTTTTGTAGGAGGAATCTCTTGGAGTACAAGTGATGCAAGTCTTCAAG
JMFF010D20- CATCTTCAAAAGTTTTTGTAGGAGGAATCTCTTGGAGTACAAGTGATGCAAGTCTTCAAG
JMSF008I09- CATCTTCAAAAGTTTTTGTAGGAGGAATCTCTTGGAGTACAAGTGATGCAAGTCTTCAAG
JMSF051P01- CATCTTCAAAAGTTTTTGTAGGAGGAATCTCTTGGAGTACAAGTGATGCAAGTCTTCAAG
____________________________________________________________
consensus CATCTTCAAAAGTTTTTGTAGGAGGAATCTCTTGGAGTACAAGTGATGCAAGTCTTCAAG
. : . : . : . : . : . :
JMFF045G15- ATGCCTTCCGTAAATATGGAGATGTCATTGAAGCAAGGATTATTACAGATCGTGAGACAG
JMFF051I20- ATGCCTTCCGTAAATATGGAGATGTCATTGAAGCAAGGATTATTACAGATCGTGAGACAG
JMFF016L21- ATGCCTTCCGTAAATATGGAGATGTCATTGAAGCAAGGATTATTACAGATCGTGAGACAG
JMFF026E06- ATGCCTTCCGTAAATATGGAGATGTCATTGAAGCAAGGATTATTACAGATCGTGAGACAG
JMFF011D09- ATGCCTTCCGTAAATATGGAGATGTCATTGAAGCAAGGATTATTACAGATCGTGAGACAG
JMFF026E22- ATGCCTTCCGTAAATATGGAGATGTCATTGAAGCAAGGATTATTACAGATCGTGAGACAG
JMFF026E21- ATGCCTTCCGTAAATATGGAGATGTCATTGAAGCAAGGATTATTACAGATCGTGAGACAG
JMFF035F12- ATGCCTTCCGTAAATATGGAGATGTCATTGAAGCAAGGATTATTACAGATCGTGAGACAG
JMFF010D20- ATGCCTTCCGTAAATATGGAGATGTCATTGAAGCAAGGATTATTACAGATCGTGAGACAG
JMSF008I09- ATGCCTTCCGTAAATATGGAGATGTCATTGAAGCAAGGATTATTACAGATCGTGAGACAG
JMSF051P01- ATGCCTTCCGTAAATATGGAGATGTCATTGAAGCAAGGATTATTACAGATCGTGAGACAG
rJMSF008I09+ AG
____________________________________________________________
consensus ATGCCTTCCGTAAATATGGAGATGTCATTGAAGCAAGGATTATTACAGATCGTGAGACAG
. : . : . : . : . : . :
JMFF045G15- GCAGATCCAGGGGGTTTGGCTTTGTTACCTTTGGCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
JMFF051I20- GCAGATCCAGGGGGTTTGGCTTTGTTACCTTTGGCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
JMFF016L21- GCAGATCCAGGGGGTTTGGCTTTGTTACCTTTGGCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
JMFF026E06- GCAGATCCAGGGGGTTTGGCTTTGTTACCTTTGGCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
JMFF011D09- GCAGATCCAGGGGGTTTGGCTTTGTTACCTTTGGCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
JMFF026E22- GCAGATCCAGGGGGTTTGGCTTTGTTACCTTTGGCAGNCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
JMFF026E21- GCAGATCCAGGGGGTTTGGCTTTGTTACCTTTGGCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
JMFF035F12- GCAGATCCAGGGGGTTTGGCTTTGTTACCTTTGGCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
JMFF010D20- GCAGATCCAGGGGGTTTGGCTTTGTTACCTTTGGCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
JMSF008I09- GCAGATCCAGGGGGTTTGGCTTTGTTACCTTTGGCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
JMSF051P01- GCAGATCCAGGGGGTTTGGCTTTGTTACCTTTGGCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
rJMFF010D20+ CTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
rJMFF016L21+ TGAGGATGCTAGTGCGGCAA
rJMSF008I09+ GCAGATCCAGGGGGNTTGGCTTTGTTACCTTNGNCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
rJMSF051P01+ GGCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
rJMFF035F12+ TAGTGCGGCAA
____________________________________________________________
consensus GCAGATCCAGGGGGTTTGGCTTTGTTACCTTTGGCAGTCCTGAGGATGCTAGTGCGGCAA
. : . : . : . : . : . :
JMFF045G15- TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
JMFF051I20- TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
JMFF016L21- TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
JMFF026E06- TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
JMFF011D09- TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
JMFF026E22- TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
JMFF026E21- TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
JMFF035F12- TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
JMFF010D20- TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
JMSF008I09- TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCA
JMSF051P01- TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
rJMFF010D20+ TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
rJMFF016L21+ TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
rJMSF008I09+ TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
rJMSF051P01+ TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
rJMFF035F12+ TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGNCCGCTCAATAAGGGTAANCTTTGCAAATG
____________________________________________________________
consensus TCCAGGCATTGGATGGCCAGATGCTTGATGGCCGCTCAATAAGGGTAAACTTTGCAAATG
. : . : . : . : . : . :
JMFF045G15- AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
JMFF051I20- AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
JMFF016L21- AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGAGGGATATGGTGGTGGCAGA
JMFF026E06- AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
JMFF011D09- AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGAGGGATATGGTGGTGGCAGA
JMFF026E22- AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGAGG
JMFF026E21- AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGAGGGATATGGTGGTGGCAGA
JMFF035F12- AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
JMFF010D20- AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
JMSF051P01- AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
rJMFF010D20+ AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
rJMFF016L21+ AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
rJMSF008I09+ AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
rJMSF051P01+ AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
rJMFF035F12+ AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
rJMFF011D09+ TGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
rJMFF026E06+ TCTGGTGGCGGAGGGATATGGTGGTGGCAGA
____________________________________________________________
consensus AAAGGCCACCACGAAGCTTTGATGGTGGGTCTGGTGGCGGA-GGATATGGTGGTGGCAGA
. : . : . : . : . : . :
JMFF045G15- TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AGGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
JMFF051I20- TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AGGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
JMFF016L21- TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AGGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
JMFF026E06- TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AAGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
JMFF011D09- TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-ANGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGNGGCAGTTATGGTA
JMFF026E21- TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-ANGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
JMFF035F12- TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-ANGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
JMFF010D20- TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGGAAGGTGGTGGTGGCTATGGGTGGTGGCAGTTATGGTA
JMSF051P01- TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AGGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
rJMFF010D20+ TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AGGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
rJMFF016L21+ TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AGGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
rJMSF008I09+ TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AGGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
rJMSF051P01+ TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AGGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
rJMFF035F12+ TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AGGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
rJMFF011D09+ TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AGGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
rJMFF026E06+ TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AGGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
____________________________________________________________
consensus TATGGAGGTGGCGGCGGCTATGG-AGGTGGTGGTGGCTAT-GGTGGTGGCAGTTATGGTA
. : . : . : . : . : . :
JMFF045G15- GTGGTCAAGGTGGGTATGGTGGCAGTGGGAATTTTGGTGGTC-AGGTGGCGAAGGTAGCT
JMFF051I20- GTGGTCAAGGTGGGTATGG
JMFF016L21- GTGGTCAAGGTGGGTATGGTGGCAGTGGG
JMFF026E06- GTGGTC
JMFF011D09- GT
JMFF026E21- GTGGTC
JMFF035F12- G
JMFF010D20- GTGGTCAAGGTGGGTATGGTGGCAGTGGGA
JMSF051P01- GTGGTCAAGGTGGGTATGGTGGCAGTGGGAATTTTGGTGGTCAAGGTGGCGAAGGTAGCT
rJMFF010D20+ GTGGTCAAGGTGGGTATGGTGGCAGTGGGAATTTTGGTGGTCAAGGTGGCGAAGGTAGCT
rJMFF016L21+ GTGGTCAAGGTGGGTATGGTGGCAGTGGGAATTTTGGTGGTCAAGGTGGCGAAGGTAGCT
rJMSF008I09+ GTGGTCAAGGTGGGTATGGTGGCAGTGGGAATTTTGGTGGTCAAGGTGGCGAAGGTAGCT
rJMSF051P01+ GTGGTCAAGGTGGGTATGGTGGCAGTGGGAATTTTGGTGGTCAAGGTGGCGAAGGTAGCT
rJMFF035F12+ GTGGTCAAGGTGGGTATGGTGGCAGTGGGAATTTTGGTGGTCAAGGTGGCGAAGGTAGCT
rJMFF011D09+ GTGGTCAAGGTGGGTATGGTGGCAGTGGGAATTTTGGTGGTCAAGGTGGCGAAGGTAGCT
rJMFF026E06+ GTGGTCAAGGTGGGTATGGTGGCAGTGGGAATTTTGGTGGTCAAGGTGGCGAAGGTAGCT
____________________________________________________________
consensus GTGGTCAAGGTGGGTATGGTGGCAGTGGGAATTTTGGTGGTCAAGGTGGCGAAGGTAGCT
. : . : . : . : . : . :
JMFF045G15- ATGNGTGCAATAATTATGGTAGTGGTGGCAGCGTGGGT
JMSF051P01- ATGGTGCAAATAATTATGGTAGTGGTGGCAGCGTGGGTTATGGCGGTGACAACCAGAACT
rJMFF010D20+ ATGGTGCAAATAATTATGGTAGTGGTGGCAGCGTGGGTTATGGCGGTGACAACCAGAACT
rJMFF016L21+ ATGGTGCAAATAATTATGGTAGTGGTGGCAGCGTGGGTTATGGCGGTGACAACCAGAACT
rJMSF008I09+ ATGGTGCAAATAATTATGGTAGTGGTGGCAGCGTGGGTTATGGCGGTGACAACCAGAACT
rJMSF051P01+ ATGGTGCAAATAATTATGGTAGTGGTGGCAGCGTGGGTTATGGCGGTGACAACCAGAACT
rJMFF035F12+ ATGGTGCAAATAATTATGGTAGTGGTGGCAGCGTGGGTTATGGCGGTGACAACCAGAACT
rJMFF011D09+ ATGGTGCAAATAATTATGGTAGTGGTGGCAGCGTGGGTTATGGCGGTGACAACCAGAACT
rJMFF026E06+ ATGGTGCAAATAATTATGGTAGTGGTGGCAGCGTGGGTTATGGCGGTGACAACCAGAACT
rJMFF008A06+ GTGGTGGCAGCGTGGGTTATGGCGGTGACAACCAGAACT
rJMFF051I20+ TAATTATGGTAGTGGTGGCAGCGTGGGTTATGGCGGTGACAACCAGAACT
____________________________________________________________
consensus ATGGTGCAAATAATTATGGTAGTGGTGGCAGCGTGGGTTATGGCGGTGACAACCAGAACT
. : . : . : . : . : . :
JMSF051P01- TTGGTGCTGCTGGCGGGGACTTCCCCAGTGCTGGCAATACTTTTGCGAGTA
rJMFF010D20+ TTGGTGCTGCTGGCGGGGACTTCCCCAGTGCTGGCAATACTTTTGCGAGTAGTGGGTTTG
rJMFF016L21+ TTGGTGCTGCTGGCGGGGACTTCCCCAGTGCTGGCAATACTTTTGCGAGTAGTGGGTTTG
rJMSF008I09+ TTGGTGCTGCTGGCGGGGACTTCCCCAGTGCTGGCAATACTTTTGCGAGTAGTGGGTTTG
rJMSF051P01+ TTGGTGCTGCTGGCGGGGACTTCCCCAGTGCTGGCAATACTTTTGCGAGTAGTGGGTTTG
rJMFF035F12+ TTGGTGCTGCTGGCGGGGACTTCCCCAGTGCTGGCAATACTTTTGCGAGTAGTGGGTTTG
rJMFF011D09+ TTGGTGCTGCTGGCGGGGACTTCCCCAGTGCTGGCAATACTTTTGCGAGTAGTGGGTTTG
rJMFF026E06+ TTGGTGCTGCTGGCGGGGACTTCCCCAGTGCTGGCAATACTTTTGCGAGTAGTGGGTTTG
rJMFF008A06+ TTGGTGCTGCTGGCGGGGACTTCCCCAGTGCTGGCAATACTTTTGCGAGTAGTGGGTTTG
rJMFF045G15+ TGCTGGCAATACTTTTGCGAGTAGTGGGTTTG
rJMFF051I20+ TTGGTGCTGCTGGCGGGGACTTCCCCAGTGCTGGCAATACTTTTGCGAGTAGTGGGTTTG
____________________________________________________________
consensus TTGGTGCTGCTGGCGGGGACTTCCCCAGTGCTGGCAATACTTTTGCGAGTAGTGGGTTTG
. : . : . : . : . : . :
rJMFF010D20+ AGGGAAATACAGGTTTTGGGTACGGCAGCAACAATCAATATGGAGACAATGCGAGCAGCA
rJMFF016L21+ AGGGAAATACAGGTTTTGGGTACGGCAGCAACAATCAATATGGAGACAATGCGAGCAGCA
rJMSF008I09+ AGGGAAATACAGGTTTTGGGTACGGCAGCAACAATCAATATGGAGACAATGCGAGCAGCA
rJMSF051P01+ AGGGAAATACAGGTTTTGGGTACGGCAGCAACAATCAATATGGAGACAATGCGAGCAGCA
rJMFF035F12+ AGGGAAATACAGGTTTTGGGTACGGCAGCAACAATCAATATGGAGACAATGCGAGCAGCA
rJMFF011D09+ AGGGAAATACAGGTTTTGGGTACGGCAGCAACAATCAATATGGAGACAATGCGAGCAGCA
rJMFF026E06+ AGGGAAATACAGGTTTTGGGTACGGCAGCAACAATCAATATGGAGACAATGCGAGCAGCA
rJMFF008A06+ AGGGAAATACAGGTTTTGGGTACGGCAGCAACAATCAATATGGAGACAATGCGAGCAGCA
rJMFF045G15+ AGGGAAATACAGGTTTTGGGTACGGCAGCAACAATCAATATGGAGACAATGCGAGCAGCA
rJMFF051I20+ AGGGAAATACAGGTTTTGGGTACGGCAGCAACAATCAATATGGAGACAATGCGAGCAGCA
____________________________________________________________
consensus AGGGAAATACAGGTTTTGGGTACGGCAGCAACAATCAATATGGAGACAATGCGAGCAGCA
. : . : . : . : . : . :
rJMFF010D20+ ACACAGATGAAGCTGGGGGAGATGATAGCCATCCGGAACAGGGGAGCTTTAGAGACGACG
rJMFF016L21+ ACACAGATGAAGCTGGGGGAGATGATAGCCATCCGGAACAGGGGAGCTTTAGAGACGACG
rJMSF008I09+ ACACAGATGAAGCTGGGGGAGATGATAGCCATCCGGAACAGGGGAGCTTTAGAGACGACG
rJMSF051P01+ ACACAGATGAAGCTGGGGGAGATGATAGCCATCCGGAACAGGGGAGCTTTAGAGACGACG
rJMFF035F12+ ACACAGATGAAGCTGGGGGAGATGATAGCCATCCGGAACAGGGGAGCTTTAGAGACGACG
rJMFF011D09+ ACACAGATGAAGCTGGGGGAGATGATAGCCATCCGGAACAGGGGAGCTTTAGAGACGACG
rJMFF026E06+ ACACAGATGAAGCTGGGGGAGATGATAGCCATCCGGAACAGGGGAGCTTTAGAGACGACG
rJMFF008A06+ ACACAGATGAAGCTGGGGGAGATGATAGCCATCCGGAACAGGGGAGCTTTAGAGACGACG
rJMFF045G15+ ACCCAGATGAAGCTGGGGGAGATGATAGCCATCCGGAACAGGGGAGCTTTAGAGACGACG
rJMFF051I20+ ACACAGATGAAGCTGGGGGAGATGATAGCCATCCGGAACAGGGGAGCTTTAGAGACGACG
____________________________________________________________
consensus ACACAGATGAAGCTGGGGGAGATGATAGCCATCCGGAACAGGGGAGCTTTAGAGACGACG
. : . : . : . : . : . :
rJMFF010D20+ ATGATCAACCCGATGACTATGCCAAACGAGCCTAGGATGATTTGATTGCTTGACAATATT
rJMFF016L21+ ATGATCAACCCGATGACTATGCCAAACGAGCCTAGGATGATTTGATTGCTTGACAATATT
rJMSF008I09+ ATGATCAACCCGATGACTATGCCAAACGAGCCTAGGATGATTTGATTGCTTGACAATATT
rJMSF051P01+ ATGATCAACCCGATGACTATGCCAAACGAGCCTAGGATGATTTGATTGCTTGACAATATT
rJMFF035F12+ ATGATCAACCCGATGACTATGCCAAACGAGCCTAGGATGATTTGATTGCTTGACAATATT
rJMFF011D09+ ATGATCAACCCGATGACTATGCCAAACGAGCCTAGGATGATTTGATTGCTTGACAATATT
rJMFF026E21+ TAGGATGATTTGATTGNTTGANAATATT
rJMFF026E06+ ATGATCAACCCGATGACTATGCCAAACGAGCCTAGGATGATTTGATTGCTTGACAATATT
rJMFF008A06+ ATGATCAACCCGATGACTATGCCAAACGAGCCTAGGATGATTTGATTGCTTGACAATATT
rJMFF045G15+ ATGATCAACCCGATGACTATGCCAAACGAGCCTAGGATGATTTGATTGCTTGACAATATT
rJMFF051I20+ ATGATCAACCCGATGACTATGCCAAACGAGCCTAGGATGATTTGATTGCTTGACAATATT
____________________________________________________________
consensus ATGATCAACCCGATGACTATGCCAAACGAGCCTAGGATGATTTGATTGCTTGACAATATT
. : . : . : . : . : . :
rJMFF010D20+ TTGTGCTGCAGATGCAAAGATAATGGAAGATGCCCTCTTCCCTATCCCTTTTTCTTCAGA
rJMFF016L21+ TTGTGCTGCAGATGCAAAGATAATGGAAGATGCCCTCTTCCCTATCCCTTTTTCTTCAGA
rJMSF008I09+ TTGTGCTGCAGATGCAAAGATAATGGAAGATGCCCTCTTCCCTATCCCTTTTTCTTCAGA
rJMSF051P01+ TTGTGCTGCAGATGCAAAGATAATGGAACATGCCCTCTTCCCTATCCCTTTTTCTTCAGA
rJMFF035F12+ TTGTGCTGCAGATGCAAAGATAATGGAAGATGCCCTCTTCCCTATCCCTTTTTCTTCAGA
rJMFF011D09+ TTGTGCTGCAGATGCAAAGATAATGGAAGATGCCCTCTTCCCTATCCCTTTTTCTTCAGA
rJMFF026E21+ TTNTGCTGCAGATGCAAAGATGATGGAAGATGCCCTGTTCCNTATCCCTTNTTATTCAGA
rJMFF026E06+ TTGTGCTGCAGATGCAAAGATGATGGAAGATGCCCTCTTCCCTATCCCTTTTTCTTCAGA
rJMFF008A06+ TTGTGCTGCAGATGCAAAGATAATGGAAGATGCCCTCTTCCCTATCCCTTTTTCTTCAGA
rJMFF045G15+ TTGTGCTGCAGATGCAAAGATAATGGAAGATGCCCTCTTCCCTATCCCTTTTTTTTCAGA
rJMFF051I20+ TTGTGCTGCAGATGCAAAGATAATGGAAGATGCCCTCTTCCCTATCCCTTTTTCTTCAGA
____________________________________________________________
consensus TTGTGCTGCAGATGCAAAGATAATGGAAGATGCCCTCTTCCCTATCCCTTTTTCTTCAGA
. : . : . : . : . : . :
rJMFF010D20+ ACTGCCCTTGGTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCATTGACTAAATTTGGCTATGTAAACTGTA
rJMFF016L21+ ACTGCCCTTGGTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCATTGACTAAATTTGGCTATGTAAACTGTA
rJMSF008I09+ ACTGCCCTTGGTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCATTGACTAAATTTGGCTATGTAAACTGTA
rJMSF051P01+ ACTGCCCTTGG-TTTTTTTTCTTCTTTTCTCATTGACTAAATTTGGCTATGTAAACTGTA
rJMFF035F12+ ACTGCCCTTGGTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCATTGACTAAATTTGGCTATGTAAACTGTA
rJMFF011D09+ ACTGCCCTTGGTTTTTTTTTCTTCTTTTCTGATTGACTAAATTTGGCTATGTAAACTGTA
rJMFF026E21+ ACTGCCCTTGGTTTTTTTT
rJMFF026E06+ ACTGCCCTTGGTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCATTGACTAAATTTGGCTATGTAAACTGTA
rJMFF008A06+ ACTGCCCTTGGTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCATTGACTAAATTTGGCTATGTAAACTGTA
rJMFF045G15+ ACTGCCCTTGGTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCATTGACTAAATTTGGCTATGTAAACTGTA
rJMFF051I20+ ACTGCCCTTGGTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCATTGACTAAATTTGGCTATGTAAACTGTA
____________________________________________________________
consensus ACTGCCCTTGGTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCATTGACTAAATTTGGCTATGTAAACTGTA
. : . : . : . : . : . :
rJMFF010D20+ TTTGAGGTTTTGAAACCCTCTTGTTCTAAACATCTGCCCAATTAAAGA
rJMFF016L21+ TTTGAGGTTTTGAAACCCTCTTGTTCTAAACATCTGCCCAATTAAAG
rJMSF008I09+ TTTGAGGTTTTGAAACCCTCTTGTTCTAAACATCTGCCCAATTAAAGATG
rJMSF051P01+ TTTGAGGTTTTGAAACCCTCTTGTTCTAAACATCTGCCCAATTAAAGATGTATCT
rJMFF035F12+ TTTGAGGTTTTGAAACCCTCTTGTTCTAAACATCTGCCCAATTAAAGATGTATCTTGTTT
rJMFF011D09+ TTTGAGGTTTTGAAACCCTCTTGTTCTAAACATCTGCCCAATTAAAGATGTATCTTGTTT
rJMFF026E06+ TTTGAGGTTTTGAAACCCTCTTGTTCTAAACATCTGCCCAATTAAAGATGTATCTTGTTT
rJMFF008A06+ TTTGAGGTTTTGAAACCCTCTTGTTCTAAACATCTGCCCAATTAAAGATGTATCTTGTTT
rJMFF045G15+ TTTGAGGTTTTGAAACCCTCTTGTTTTAAACATCTGCCCAATTAAAGATGTATCTTGTTT
rJMFF051I20+ TTTGAGGTTTTGAAACCCTCTTGTTCTAAACATCTGCCCAATTAAAGATGTATCTTGTTT
____________________________________________________________
consensus TTTGAGGTTTTGAAACCCTCTTGTTCTAAACATCTGCCCAATTAAAGATGTATCTTGTTT
. : . : . : . : . : . :
rJMFF035F12+ AGAGTTATA
rJMFF011D09+ AGAGTTATA
rJMFF026E06+ AGAGTTATA
rJMFF008A06+ AGAGTTATA
rJMFF045G15+ AGAGTTATATGAAGATTGAAGATGCCTTTCAACT
rJMFF051I20+ AGAGTTATATGAAGATTGAAGATGCCTTTCAACTAAAAAAAAAAAAAAACTCTCCAGGGT
____________________________________________________________
consensus AGAGTTATATGAAGATTGAAGATGCCTTTCAACTAAAAAAAAAAAAAAACTCTCCAGGGT