Contig 012398:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

Alignment

This contig is upended


                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF040P11+                                 AGTGAAAGTAGAATGTCTCGTGCCTGGTGGTAGTAGT
                      ____________________________________________________________
consensus                                    AGTGAAAGTAGAATGTCTCGTGCCTGGTGGTAGTAGT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF040P11+          TGAAGCCGTATGGCAATTTTAACAATGTTGCAGAAGAATATGGTAGTGGATGGTGGAAAA
                      ____________________________________________________________
consensus             TGAAGCCGTATGGCAATTTTAACAATGTTGCAGAAGAATATGGTAGTGGATGGTGGAAAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF035I02+                                                      CCACTACATGGGAATT
rJMFF040P11+          ATGAGCAACGGTTATGGTGGGTTTGGTAGCTACGGTGCTTATGGCCACTACATGGGGAAT
                      ____________________________________________________________
consensus             ATGAGCAACGGTTATGGTGGGTTTGGTAGCTACGGTGCTTATGGCCACTACATGGGGATT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF035I02+          TACGGCATGAGCTCTGCAGGATTTTATGGTGGCTATGGTGGATATGGGTATGGATTTGGA
rJMFF040P11+          TACGGCATGAGCTCTGCAGGATTTTATGGTGGCTATGGTGGATATGGGTATGGATTTGGA
                      ____________________________________________________________
consensus             TACGGCATGAGCTCTGCAGGATTTTATGGTGGCTATGGTGGATATGGGTATGGATTTGGA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF035I02+          TTTGGTGGTGCTATGTATGGTGCTGCAGGATATGGGGGCGACAACTATGGGGCTCCTGGT
rJMFF040P11+          TTTGGTGGTGCTATGTATGGTGCTGCAGGATATGGAGGCGACAACTATGGGGCTCCTGGT
                      ____________________________________________________________
consensus             TTTGGTGGTGCTATGTATGGTGCTGCAGGATATGGGGGCGACAACTATGGGGCTCCTGGT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF035I02+          AATTATGGTGGTGCTAAAGGATATGGCAGTGGTGTTGGCATTGGGTATGATGGCAGCGAA
rJMFF040P11+          AATTATGGTGGTGCTAAAGGATATGGCAGTGGTGTTGGCATTGGGTATGATGGCAGCGAA
                      ____________________________________________________________
consensus             AATTATGGTGGTGCTAAAGGATATGGCAGTGGTGTTGGCATTGGGTATGATGGCAGCGAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF035I02+          AGCCATGGGAACGTNGGCAATGCTTCTGGGTATGGTGCACCCAAGGGCCATGGCAGTGGC
rJMFF040P11+          AGCCATGGGAACGTTGGCAATGCTTCTGGGTATGGTGCACCCAAGGGCCATGGCAGTGGC
                      ____________________________________________________________
consensus             AGCCATGGGAACGTTGGCAATGCTTCTGGGTATGGTGCACCCAAGGGCCATGGCAGTGGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF035I02+          AATGGCAGGGGATATGGAAACAATGGCGCTGCAGCTGGAGCTGGAAGGTTCCATCCTTAT
rJMFF040P11+          AATGGCAGGGGATATGGAAACAATGGCGCTGCAGCTGGAGCTGGAAGGTTCCATCCTTAT
                      ____________________________________________________________
consensus             AATGGCAGGGGATATGGAAACAATGGCGCTGCAGCTGGAGCTGGAAGGTTCCATCCTTAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF035I02+          AGGAAGTGAGACCTTTTAGTTATTGAGATGAAGTTTAACTTTGTTTTGACTAACCACTGG
rJMFF040P11+          AGGAAGTGAGACCTTTTAGTTATTGAGATGAAGTTTAACTTTGTTTTGACTAACCACTGG
                      ____________________________________________________________
consensus             AGGAAGTGAGACCTTTTAGTTATTGAGATGAAGTTTAACTTTGTTTTGACTAACCACTGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF035I02+          GTAGATGTATTAGTATGTGATTTATGAGGAAAGTACCACTCACTGTACACTCCCTCCCTT
rJMFF040P11+          GTAGATGTATTAGTATGTGATTTATGAGGAAAGTACCACTCACTGTACACTCCCTCCCTT
                      ____________________________________________________________
consensus             GTAGATGTATTAGTATGTGATTTATGAGGAAAGTACCACTCACTGTACACTCCCTCCCTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF035I02+          AGAACCTAATAATTTCATTAGTTTTGGGGGAAGAGTAGAAATTAGCATACTTTGATGCAT
rJMFF040P11+          AGAACCTAATAATTTCATTAGTTTTGGGGGAAGAGTAGAAATTAGCATACTTTGATGCAT
                      ____________________________________________________________
consensus             AGAACCTAATAATTTCATTAGTTTTGGGGGAAGAGTAGAAATTAGCATACTTTGATGCAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF035I02+          ATTATATTGTAGACAAATTTTCCTTCTGCAGGATTGTTAGGTATTGCCAGTTACTGATCA
rJMFF040P11+          ATTATATTGTAGACAAATTTTCCTTCTGCAGGGTTGTTAGGTATTGCCAGTTACTGATCA
                      ____________________________________________________________
consensus             ATTATATTGTAGACAAATTTTCCTTCTGCAGGGTTGTTAGGTATTGCCAGTTACTGATCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF035I02+          TAAGATATTTTCATAGGTATATACATATTGGTGTCTTCACTCTTCTCTAGATCCAAATCA
rJMFF040P11+          TAAGATATTTTCATAGGTATATACATATTGGTGTCTTCACTCTTCTCTAGATCCAAATCA
                      ____________________________________________________________
consensus             TAAGATATTTTCATAGGTATATACATATTGGTGTCTTCACTCTTCTCTAGATCCAAATCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF035I02+          TGTA                                                        
rJMFF040P11+          TGTATTTACAGGTGATTGGGAAAATCTCTTAACATTTGATGAATGATATTTGGTTGATCA
                      ____________________________________________________________
consensus             TGTATTTACAGGTGATTGGGAAAATCTCTTAACATTTGATGAATGATATTTGGTTGATCA