Contig 011730:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

clone5'-sequence3'-sequence
Seq.lengthcontigBestHitEvaluedescriptionlengthcontigBestHitEvaluedescription
JMFN044M16Sequence574011730 (2)dbj|BAA05077.1|4e-41zinc-finger DNA binding protein [Petunia x hybrida]
JMFS096G05Sequence604011730 (2)ref|XP_009625229.1|1e-47PREDICTED: zinc finger protein ZAT10-like [Nicotiana tomentosiformis]

Alignment

This contig is upended


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JMFS096G05- TTGGAGGCTATGAA
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consensus TTGGAGGCTATGAA
 
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JMFS096G05- ATCTTCGGCCGTGGTCACGCCGCCGGCGCCCTGCGTCGAGGTTGATGATGTTCATGGATT
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consensus ATCTTCGGCCGTGGTCACGCCGCCGGCGCCCTGCGTCGAGGTTGATGATGTTCATGGATT
 
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JMFS096G05- GAAGAAGAAGCGGACTAAGAGGCCTCGCGGTGATGAGAGCCCCGCGCTGCCACCGCCGAC
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consensus GAAGAAGAAGCGGACTAAGAGGCCTCGCGGTGATGAGAGCCCCGCGCTGCCACCGCCGAC
 
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JMFS096G05- TGAGGAGGAGAGGTATTTGGCTTTGTGTTTGATCATGCTGGCCCGCGGCGAGGATCCGAG
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consensus TGAGGAGGAGAGGTATTTGGCTTTGTGTTTGATCATGCTGGCCCGCGGCGAGGATCCGAG
 
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JMFS096G05- TCGTCGTCAGCGTGATGCGCCGGCGGAGGCGAAGGTTGTGAGTAAGGAGAGTGAAACGGT
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consensus TCGTCGTCAGCGTGATGCGCCGGCGGAGGCGAAGGTTGTGAGTAAGGAGAGTGAAACGGT
 
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JMFS096G05- GTCGCTACCGCCGCCGCCGCCGCCTGCGGCGGCGGCGGCGCAGGAAGTGCCGCATCAGGA
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consensus GTCGCTACCGCCGCCGCCGCCGCCTGCGGCGGCGGCGGCGCAGGAAGTGCCGCATCAGGA
 
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JMFS096G05- GCAGTTGTACAAGTGCAGCGTGTGTAATAAGTGTTTTCATTCTTATCAAGCACTTGGTGG
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consensus GCAGTTGTACAAGTGCAGCGTGTGTAATAAGTGTTTTCATTCTTATCAAGCACTTGGTGG
 
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JMFS096G05- GCATAAGGCCAGCCACCGTAAACTGGCTTCCGCCTCCGACGACAACAACAACCACCCCTC
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consensus GCATAAGGCCAGCCACCGTAAACTGGCTTCCGCCTCCGACGACAACAACAACCACCCCTC
 
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JMFS096G05- GACGTCGAATTCCACCGCCGCCGTCGTCAACCCGATCGGTAGGGCTCATGAGTGCAACAT
JMFN044M16+ TCAACCCGATCGGTAGGGCTCATGAGTGCAACAT
                      ____________________________________________________________
consensus GACGTCGAATTCCACCGCCGCCGTCGTCAACCCGATCGGTAGGGCTCATGAGTGCAACAT
 
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JMFS096G05- CTGCCACAAGTCCTTCCCCTCCGGCCAAGCCCTAGGCGGCCACAAGCGCCGCCACTACGA
JMFN044M16+ CTGCCACAAGTCCTTCCCCTCCGGCCAAGCCCTAGGCGGCCACAAGCGCCGCCACTACGA
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consensus CTGCCACAAGTCCTTCCCCTCCGGCCAAGCCCTAGGCGGCCACAAGCGCCGCCACTACGA
 
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JMFS096G05- AGGCAACCTCGGCGGAGCCCCCAACCGCGACGCTGGCTCTGCTCCCAGCG
JMFN044M16+ AGGCAACCTCGGCGGAGCCCCCAACCGCGACGCTGGCTCTGCTCCCAGCGGAAGCGCACT
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consensus AGGCAACCTCGGCGGAGCCCCCAACCGCGACGCTGGCTCTGCTCCCAGCGGAAGCGCACT
 
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JMFN044M16+ CACCTCCTCAGAAGGCGGCGTCTCAAGCCACGCGCCCCGTCCCTTTGACCTCAATCTCCT
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consensus CACCTCCTCAGAAGGCGGCGTCTCAAGCCACGCGCCCCGTCCCTTTGACCTCAATCTCCT
 
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JMFN044M16+ CCCCTCCACCGAACTACAACTCGGGCTCAGCGTTGACTGCTCCATAAAAAGTCAACTCTC
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consensus CCCCTCCACCGAACTACAACTCGGGCTCAGCGTTGACTGCTCCATAAAAAGTCAACTCTC
 
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JMFN044M16+ CGGTGATCAAGAAGTCGAAAGCCCCATGCCCGCCAAGAAACCGCGTCTATCCTTCCCCTT
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consensus CGGTGATCAAGAAGTCGAAAGCCCCATGCCCGCCAAGAAACCGCGTCTATCCTTCCCCTT
 
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JMFN044M16+ CGACTGGGATTTCCGACCAAACAATTCTTGAAAAAAAATCAAAAATCAATTCTTTAATTT
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consensus CGACTGGGATTTCCGACCAAACAATTCTTGAAAAAAAATCAAAAATCAATTCTTTAATTT
 
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JMFN044M16+ TACCCTTAGCCTCCCCAAATCCCAATTAATGATTGATCTCATATACTTTCAATATTAATT
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consensus TACCCTTAGCCTCCCCAAATCCCAATTAATGATTGATCTCATATACTTTCAATATTAATT
 
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JMFN044M16+ AGCAGCACCCTTTTATGTACAAGGAGTTAATTACTCATCATATTGATTCTTAACTCTCTC
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consensus AGCAGCACCCTTTTATGTACAAGGAGTTAATTACTCATCATATTGATTCTTAACTCTCTC
 
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JMFN044M16+ TTAATCTCTTTGTTAATCATTCATTAATTCAATTCTTATTGAAATACTATTCCTTTTTTT
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consensus TTAATCTCTTTGTTAATCATTCATTAATTCAATTCTTATTGAAATACTATTCCTTTTTTT