Contig 011647:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

clone5'-sequence3'-sequence
Seq.lengthcontigBestHitEvaluedescriptionlengthcontigBestHitEvaluedescription
JMFF011L07Sequence499011647 (4)471011647 (4)
JMFF048L06Sequence503011647 (4)327011647 (4)

Alignment

This contig is upended


. : . : . : . : . : . :
rJMFF011L07+ GTCACTCATCACCCCTTTCCAAGG
JMFF011L07- AGG
JMFF048L06- AGG
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consensus GTCACTCATCACCCCTTTCCAAGG
 
. : . : . : . : . : . :
rJMFF011L07+ TTGGTAGTCTATCTTTATTGTGAACATTGAAGTCCTTTCCCTGGAGGCTGGTGGGATGCT
JMFF011L07- TTGGTAGTCTATCTTTATTGTGAACATTGAAGTCCTTTCCCTGGAGGCTGGTGGGATGCT
JMFF048L06- TTGGTAGTCTATCTTTATTGTGAACATTGAAGTCCTTTCCCTGGAGGCTGGTGGGATGCT
                      ____________________________________________________________
consensus TTGGTAGTCTATCTTTATTGTGAACATTGAAGTCCTTTCCCTGGAGGCTGGTGGGATGCT
 
. : . : . : . : . : . :
rJMFF011L07+ TTTCTGAATTCTCTGCACCACACTTTGGCCATTAATGTTTGAAGCATTTTTATCTTAACC
JMFF011L07- TTTCTGAATTCTCTGCACCACACTTTGGCCATTAATGTTTGAAGCATTTTTATCTTAACC
JMFF048L06- TTTCTGAATTCTCTGCACCACACTTTGGCCATTAATGTTTGAAGCATTTTTATCTTAACC
                      ____________________________________________________________
consensus TTTCTGAATTCTCTGCACCACACTTTGGCCATTAATGTTTGAAGCATTTTTATCTTAACC
 
. : . : . : . : . : . :
rJMFF011L07+ CTCTCACATGATCTCACTCCACCCAAGCACTGAACACATATACTGCTAAAGCCTTTTTGT
rJMFF048L06+ CCACCCAAGCACTGAACACATATACTGCTAAAGCCTTTTTGT
JMFF011L07- CTCTCACATGATCTCACTCCACCCAAGCACTGAACACATATACTGCTAAAGCCTTTTTGT
JMFF048L06- CTCTCACATGATCTCACTCCACCCAAGCACTGAACACATATACTGCTAAAGCCTTTTTGT
                      ____________________________________________________________
consensus CTCTCACATGATCTCACTCCACCCAAGCACTGAACACATATACTGCTAAAGCCTTTTTGT
 
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rJMFF011L07+ AACTCGCCTTTCTCAGCCTCACTTCCCACTCATCACTCATCACTCATCACTCATATCAAC
rJMFF048L06+ AACTCGCCTTTCTCAGCCTCACTTCCCACTCATCACTCATCACTCATCACTCATATCAAC
JMFF011L07- AACTCGCCTTTCTCAGCCTCACTTCCCACTCATCACTCATCACTCATCACTCATATCAAC
JMFF048L06- AACTCGCCTTTCTCAGCCTCACTTCCCACTCATCACTCATCACTCATCACTCATATCAAC
                      ____________________________________________________________
consensus AACTCGCCTTTCTCAGCCTCACTTCCCACTCATCACTCATCACTCATCACTCATATCAAC
 
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rJMFF011L07+ AATCAAGCAATGGCTAAAACTGCCGCAACTTTCTCCCATCTCCTCATGCTTCTGTCCTTC
rJMFF048L06+ AATCAAGCAATGGCTAAAACTGCCGCAACTTTCTCCCATCTCCTCATGCTTCTGTCCTTC
JMFF011L07- AATCAAGCAATGGCTAAAACTGCCGCAACTTTCTCCCATCTCCTCATGCTTCTGTCCTTC
JMFF048L06- AATCAAGCAATGGCTAAAACTGCCGCAACTTTCTCCCATCTCCTCATGCTTCTGTCCTTC
                      ____________________________________________________________
consensus AATCAAGCAATGGCTAAAACTGCCGCAACTTTCTCCCATCTCCTCATGCTTCTGTCCTTC
 
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rJMFF011L07+ CTCTCAGGTATATCATATATGTTGTTATTTTTGAATCTCATTAATTTCCAGGCAGATTTT
rJMFF048L06+ CTCTCAGGTATATCATATATGTTGTTATTTTTGAATCTCATTAATTTCCAGGCAGATTTT
JMFF011L07- CTCTCAGGTATATCATATATGTTGTTATTTTTGAATCTCATTAATTTCCAGGCAGATTTT
JMFF048L06- CTCTCAGGTATATCATATATGTTGTTATTTTTGAATCTCATTAATTTCCAGGCAGATTTT
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consensus CTCTCAGGTATATCATATATGTTGTTATTTTTGAATCTCATTAATTTCCAGGCAGATTTT
 
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rJMFF011L07+ TTAATTAATAAGTATACTTGCAAGAGATAGGCAGGGGTCCTTTAATTTGTGCTCTTGCTC
rJMFF048L06+ TTAATTAATAAGTATACTTGCAAGAGATAGGCAGGGGTCCTTTAATTTGTGCTCTTGCTC
JMFF011L07- TTAATTAATAAGTATACTTGCAAGAGATAGGCAGGGGTCCTTTAATTTGTGCTCTTGCTC
JMFF048L06- TTAATTAATAAGTATACTTGCAAGAGATAGGCAGGGGTCCTTTAATTTGTGCTCTTGCTC
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consensus TTAATTAATAAGTATACTTGCAAGAGATAGGCAGGGGTCCTTTAATTTGTGCTCTTGCTC
 
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rJMFF011L07+ GTTAGTTTTTTTGTTCTTTTGGGGCTT
rJMFF048L06+ GTTAGTTTTTTTGTTCTTTTGGGGCTTAGCCCTTCCTTATTTCCC
JMFF011L07- GTTAGTTTTTTTGTTCTTTTGGGGCTTAGCCCTTCCTTATTTCCCAAAAAAAAAA
JMFF048L06- GTTAGTTTTTTTGTTCTTTTGGGGCTTAGCCCTTCCTTATTTCCCAAAAAAAAAAAAAAC
                      ____________________________________________________________
consensus GTTAGTTTTTTTGTTCTTTTGGGGCTTAGCCCTTCCTTATTTCCCAAAAAAAAAAAAAAC