Contig 010936:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

Alignment

This contig is upended


                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF051B24-                           GGTCTCACAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
                      ____________________________________________________________
consensus                             GGTCTCACAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF051B24-           GATCTAATTCCATACAAATAACTTATAGCTGCAGTTATGGCTGATAAAAGTGACAAGATC
                      ____________________________________________________________
consensus             GATCTAATTCCATACAAATAACTTATAGCTGCAGTTATGGCTGATAAAAGTGACAAGATC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF051B24+                                   TCGCCGCCGCCACCAACGGCGGCGNTAAGTCACAG
JMSF051B24-           AACCCAACAGCCAAGCTTCCCCCCGTCGCCGCCGCCACCAACGGCGGCGCTAAGTCACAG
                      ____________________________________________________________
consensus             AACCCAACAGCCAAGCTTCCCCCCGTCGCCGCCGCCACCAACGGCGGCGCTAAGTCACAG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF051B24+          ACTTACAATGCCCCTCGCCCCATGTACCGCCCCAAACCGCCGTCTCGCCGCCGCGGCAGC
JMSF051B24-           ACTTACAATGCCCCTCGCCCCATGTACCGCCCCAAACCGCCGTCTCGCCGCCGCGGCAGC
                      ____________________________________________________________
consensus             ACTTACAATGCCCCTCGCCCCATGTACCGCCCCAAACCGCCGTCTCGCCGCCGCGGCAGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF051B24+          CGCAGCTGCGTCTGTTGCTGCTGTCTCTGGATCACCTTCCTCGTCATTATTCTCGTCCTC
JMSF051B24-           CGCAGCTGCGTCTGTTGCTGCTGTCTCTGGATCACCTTCCTCGTCATTATTCTCGTCCTC
                      ____________________________________________________________
consensus             CGCAGCTGCGTCTGTTGCTGCTGTCTCTGGATCACCTTCCTCGTCATTATTCTCGTCCTC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF051B24+          CTTGTCGCCGGCGCCGGCGCCATTTTCTGGCTGATCTACCGCCCCCAGCGCCCCGATTTC
JMSF051B24-           CTTGTCGCCGGCGCCGGCGCCATTTTCTGGNTGATCTACCGCCCCCAGCGCCCCGATTTC
                      ____________________________________________________________
consensus             CTTGTCGCCGGCGCCGGCGCCATTTTCTGGCTGATCTACCGCCCCCAGCGCCCCGATTTC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF051B24+          GTGGTCGACTCCCTCCAGCTCTCCCAGCTCGCCCTAACCTCCTCCGCGCTCACCTCCAAG
JMSF051B24-           GTGGTCGACTCCCTCCAGCTCTCCCAGCTCGCCCTAACCTCCTCCGCGCTCACCTCCAAG
                      ____________________________________________________________
consensus             GTGGTCGACTCCCTCCAGCTCTCCCAGCTCGCCCTAACCTCCTCCGCGCTCACCTCCAAG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF051B24+          TTCACCGTCTCCCTCTCCGCCCGCAACCCTAACAAGAAGGTCGAGTTCATCTACGATCCA
JMSF051B24-           TTCACCGTCTCCCTCTCCGCCCGCAACCCTAACAAGAAGGTCGAGTTCATCTACGATCCA
                      ____________________________________________________________
consensus             TTCACCGTCTCCCTCTCCGCCCGCAACCCTAACAAGAAGGTCGAGTTCATCTACGATCCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF051B24+          ATTTCCGTCTCCGTGTTCTCCGGCGACGCCGCCATCGGATCCGGAACGATACCTGGATTC
JMSF051B24-           ATTTCCGTCTCCGTGTTCTCCGGCGACGCCGCCATCGGATCCGGAACGATACCTGGATTC
                      ____________________________________________________________
consensus             ATTTCCGTCTCCGTGTTCTCCGGCGACGCCGCCATCGGATCCGGAACGATACCTGGATTC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF051B24+          GAACACGGCGCCAAGAACACTACCGCGCTGAAAACTAACGTTGCGGCTGCCGGGGAGAGT
JMSF051B24-           GAACACGGCGCCAAGAACACTACCGCGCTGAAAACTAACGTTGCGGCTGCCGGGGAGAGT
                      ____________________________________________________________
consensus             GAACACGGCGCCAAGAACACTACCGCGCTGAAAACTAACGTTGCGGCTGCCGGGGAGAGT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF051B24+          CTCGACGCCGATCAGGTTTCGGCGATGAAATCGGCGATCAAAAACAAGAGCCGT      
JMSF051B24-           CTCGACGCCGATCAGGTTTCGGCGATGAAATCGGCGATCAAAAACAAGAGCCGTTTCCCG
                      ____________________________________________________________
consensus             CTCGACGCCGATCAGGTTTCGGCGATGAAATCGGCGATCAAAAACAAGAGCCGTTTCCCG