Contig 010361:  Sequence
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS091D02+                                                         AGGTACCTAGTCCG
                      ____________________________________________________________
consensus                                                           AGGTACCTAGTCCG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS091D02+           GGCTAAACGGTGGCCGGACAGGATATATCAAATCCGTTGACCTAGTCAGGGTTGCTGCTG
                      ____________________________________________________________
consensus             GGCTAAACGGTGGCCGGACAGGATATATCAAATCCGTTGACCTAGTCAGGGTTGCTGCTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS091D02+           GCCAAAAGTAGCCGAGTCCCTTCTGGGCTCTGGGTGGTGCGGGATATATGATGGGGGTTG
                      ____________________________________________________________
consensus             GCCAAAAGTAGCCGAGTCCCTTCTGGGCTCTGGGTGGTGCGGGATATATGATGGGGGTTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS091D02+           CATTTGTTCGCGTCTCCCTGTTATTCCCTTATACACTGCAATGATTTTGTGCTGTATTGG
                      ____________________________________________________________
consensus             CATTTGTTCGCGTCTCCCTGTTATTCCCTTATACACTGCAATGATTTTGTGCTGTATTGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS091D02+           ATTAGGAAATGTGGTGTTTTCTTGTCTTGTCACGTTTCCATTTTGCAGGTCTTGTTTGAC
                      ____________________________________________________________
consensus             ATTAGGAAATGTGGTGTTTTCTTGTCTTGTCACGTTTCCATTTTGCAGGTCTTGTTTGAC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS091D02+           TTCTGAGGTATTGCTGGTCTTAGGCTTATTTGGTTTCGCCCTTGTGGGTTTCTTAAAATA
JMFN012L06-                                                                    ATA
                      ____________________________________________________________
consensus             TTCTGAGGTATTGCTGGTCTTAGGCTTATTTGGTTTCGCCCTTGTGGGTTTCTTAAAATA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS091D02+           GACCACGCCTCAATGTTGGTGCAAGCGGTAAGAAATTGCATCCTAGCCCGGGCTGAACGG
JMFN012L06-           GACCAGGCCTCAACGTTGGTGCAAGCGGTAAGAAATTGCACCCTGGCCCGGGCTGAACGG
                      ____________________________________________________________
consensus             GACCAGGCCTCAATGTTGGTGCAAGCGGTAAGAAATTGCATCCTGGCCCGGGCTGAACGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS091D02+           TGGCCGGGTAGGGGTTTATCAAATTCGTTGGCGGTAGTCCAGGCTTGCTGCTGGCC    
JMFN012L06-           TGGCCGGGTAGGGGTTTTTCAAATCCGTTTGCGGTAGTCCAGGCTTGCTGCTGGCCCATA
                      ____________________________________________________________
consensus             TGGCCGGGTAGGGGTTTTTCAAATTCGTTTGCGGTAGTCCAGGCTTGCTGCTGGCCCATA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN012L06-           GTAACTAATCCCGTTAGGGTTGGTTCTGGTTCGTTGCTGGTGCTGATCGGGGGTTGATGC
                      ____________________________________________________________
consensus             GTAACTAATCCCGTTAGGGTTGGTTCTGGTTCGTTGCTGGTGCTGATCGGGGGTTGATGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN012L06-           TATTGGCTGCCGTTTATGTTGCATTGGCCTGTGTGTCGGAGTTTAGGCCTGTGATCCGTT
                      ____________________________________________________________
consensus             TATTGGCTGCCGTTTATGTTGCATTGGCCTGTGTGTCGGAGTTTAGGCCTGTGATCCGTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN012L06-           CTGTATTAGTCATGTTTGACTGAGGCCTATGTGCCGATATTTCTGTATGGGTAAAAAACT
                      ____________________________________________________________
consensus             CTGTATTAGTCATGTTTGACTGAGGCCTATGTGCCGATATTTCTGTATGGGTAAAAAACT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN012L06-           TTATATTTAGCCGGGAGCATGTGTATTGTTGCTTTTAACAGGGCAGTCAATAGCACCCCA
                      ____________________________________________________________
consensus             TTATATTTAGCCGGGAGCATGTGTATTGTTGCTTTTAACAGGGCAGTCAATAGCACCCCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN012L06-           GGAGATGTTGCGGTTGTGGTTGCAGCCCGGTCGGATTGCATCATAGTGCTGGGACGCTAT
                      ____________________________________________________________
consensus             GGAGATGTTGCGGTTGTGGTTGCAGCCCGGTCGGATTGCATCATAGTGCTGGGACGCTAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN012L06-           GGTGTAGCTGGCAGGGAGGTGCTATGGCGCGTGACAAGCAAGGTGGCTGTTCCCCTTGTC
                      ____________________________________________________________
consensus             GGTGTAGCTGGCAGGGAGGTGCTATGGCGCGTGACAAGCAAGGTGGCTGTTCCCCTTGTC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN012L06-           ATCCATCTACACGGTTATATGGTGGGCTGTGGCGCTGATGATCTACATTTGCATTTACAT
                      ____________________________________________________________
consensus             ATCCATCTACACGGTTATATGGTGGGCTGTGGCGCTGATGATCTACATTTGCATTTACAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN012L06-           CCTTTCGAGCAGCTGTGCAGTCTACCTTTTATTAGTAGCTTTTATTAGTATTTTATCCTA
                      ____________________________________________________________
consensus             CCTTTCGAGCAGCTGTGCAGTCTACCTTTTATTAGTAGCTTTTATTAGTATTTTATCCTA