Contig 010015: Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show
Alignment
This contig is upended
. : . : . : . : . : . :
rJMSF024M21+ CTTTTTAAGANTACTNTCAATTCCNTTATANGAGTTCATTANTTTGAAATTAT
rJMSF043I17+ TACTTTCAATTCCTTTATATGAGTTCATTATTTTGAAATTAT
____________________________________________________________
consensus CTTTTTAAGANTACTTTCAATTCCTTTATATGAGTTCATTATTTTGAAATTAT
. : . : . : . : . : . :
rJMSF024M21+ AAAAGTGGTATTACTAAGTAGTTATTTTTATAGGCNACTGATGATCTTACAATCTGATGC
rJMSF043I17+ AAAAGTGGTATTACTAAGTAGTTATTTTTATAGGCAACTGATGATCTTACAATCTGATGC
rJMSF032H23+ TGATGC
____________________________________________________________
consensus AAAAGTGGTATTACTAAGTAGTTATTTTTATAGGCAACTGATGATCTTACAATCTGATGC
. : . : . : . : . : . :
rJMSF024M21+ CAAAATGATTAGCAGTTTCTGATTCTTAAATTAATAATTGACTTTGGATTGTCTTGCNTT
rJMSF043I17+ CAAAATGATTAGCAGTTTCTGATTCTTAAATTAATAATTGACTTTGGATTGTCTTGCTTT
rJMSF032H23+ CAAAATGATTAGCNGNTTCNGATTCTTAAATTAATAATTGACTTTGGATTGTCTTGCTTT
____________________________________________________________
consensus CAAAATGATTAGCAGTTTCTGATTCTTAAATTAATAATTGACTTTGGATTGTCTTGCTTT
. : . : . : . : . : . :
rJMSF024M21+ AGGGATTTAAGTTCAAATTGCATTGCTTTAGGACNGTCAGTATTTCTTTATGTAATTCAG
rJMSF043I17+ AGGGATTTAAGTTCAAATTGCATTGCTTTAGGACNGTCAGTATTTCTTTATGTAATTCAG
rJMSF032H23+ AGGGA-TTAAGTTCAAATTGCATTGCTTTAGGACAGTCAGTATTTCTTTATGTAATTCAG
____________________________________________________________
consensus AGGGATTTAAGTTCAAATTGCATTGCTTTAGGACAGTCAGTATTTCTTTATGTAATTCAG
. : . : . : . : . : . :
rJMSF024M21+ NAAAAAAAAAATTGAAATGAAATCAAAAATCTTTATATCTGTAAATTATTTAAAATGTTA
rJMSF043I17+ TAAAAAAAAAATTGAAATGAAATCAAAAATCTTTATATCTGTAAATTATTTAAAATGTTA
rJMSF032H23+ TAAAAAAAAAATTGAAATGAAATCAAAAATCTTTATATCTGTAAATTATTTAAAATGTTA
____________________________________________________________
consensus TAAAAAAAAAATTGAAATGAAATCAAAAATCTTTATATCTGTAAATTATTTAAAATGTTA
. : . : . : . : . : . :
rJMSF024M21+ ATCTCAAAACAGCAAAACTTTCATAAATGGTTGTTTTTCCTTTAGCTGAATTTTTGTAAA
rJMSF043I17+ ATCTCAAAACAGCAAAACTTTCATAAATGGTTGTTTTTCCTTTAGCTGAATTTTTGTAAA
rJMSF032H23+ ATCTCAAAACAGCAAAACTTTCATAAATGGTTGTTTTTCCTTTAGCTGAATTTTTGTAAA
____________________________________________________________
consensus ATCTCAAAACAGCAAAACTTTCATAAATGGTTGTTTTTCCTTTAGCTGAATTTTTGTAAA
. : . : . : . : . : . :
rJMSF024M21+ AAAATAATTTTAGCTAATTTGCTTTGAAACTTAATAATATTTAGTCAATTTTAGTTTATT
rJMSF043I17+ AAAATAATTTTAGCTAATTTGATTTGAAACTTAATAATATTTAGTCAATTTTAGTTTATT
rJMSF032H23+ AAAATAATTTTAGCTAATTTGATTTGAAACTTAATAATATTTAGTCAATTTTAGTTTATT
____________________________________________________________
consensus AAAATAATTTTAGCTAATTTGATTTGAAACTTAATAATATTTAGTCAATTTTAGTTTATT
. : . : . : . : . : . :
rJMSF024M21+ TTAGATAAGAATTGGTGTGCTTGGATGTTTGATGGGAGATTTTACCTTTCCTAAATGATT
rJMSF043I17+ TTAGATAAGAATTGGTGTGCTTGGATGTTTGATGGGAGATTTTACCTTTCCTAAATGATT
rJMSF032H23+ TTAGATAAGAATTGGTGTGCTTGGATGTNTGATGGGAGATTTTACCTTTCCTAAATGATT
____________________________________________________________
consensus TTAGATAAGAATTGGTGTGCTTGGATGTTTGATGGGAGATTTTACCTTTCCTAAATGATT
. : . : . : . : . : . :
rJMSF024M21+ TGGTATTTAATCAGTTGTTTTAGGTACATTATATTTAAGTACAAATGATTCTATTAAAAA
rJMSF043I17+ TGGTATTTAATCAGTTGTTTTAGGTACATTATATTTAAGTACAAATGATTCTATTAAAAA
rJMSF032H23+ TGGTATTTAATCAGTTGTTTTAGGTACATTATATTTAAGTACAAATGATTCTATTAAAAA
____________________________________________________________
consensus TGGTATTTAATCAGTTGTTTTAGGTACATTATATTTAAGTACAAATGATTCTATTAAAAA
. : . : . : . : . : . :
rJMSF024M21+ TGTTAAGAAAAAACAATAAACAAATTACAACTACAAAAGACTTGGTAAGAATACAAAAAT
rJMSF043I17+ TGTTAAGAAAAAACAATAAACAAATTACAACTACAAAAGACTTGGTAAGAATACAAAAAT
rJMSF032H23+ TGTTAAGAAAAAACAATAAACAAATTACAACTACAAAAGACTTGGTAAGAATACAAAAAT
____________________________________________________________
consensus TGTTAAGAAAAAACAATAAACAAATTACAACTACAAAAGACTTGGTAAGAATACAAAAAT
. : . : . : . : . : . :
rJMSF024M21+ GTTTAGACTACATTTTAATCCAATTTGATGTTCTACTTTGTTTTGTTGCTACTGTTTGGN
rJMSF043I17+ GTTTAGACTACATTTTAATCCAATTTGATGTTCTACTTTGTTTTGTTGCTACTGTTTGGT
rJMSF032H23+ GTTTAGACTACATTTTAATCCAATTTGATGTTCTACTTTGTTTTGTTGCTACTGTTTGGT
____________________________________________________________
consensus GTTTAGACTACATTTTAATCCAATTTGATGTTCTACTTTGTTTTGTTGCTACTGTTTGGT
. : . : . : . : . : . :
rJMSF024M21+ TGATNGTGGTTTTAGCTGATGCCTTGAAAACTGATATCCTTTATTGCTGG
rJMSF043I17+ TGATTGTGGTTTTAGCTGATGCCTTGAAAACTGATATCCTTTATTGCTGG
rJMSF032H23+ TGATTGTGGTTTTAGCTGATGCCTTGAAAACTGATATCCTTTATTGCTGGTTCTTGATAT
____________________________________________________________
consensus TGATTGTGGTTTTAGCTGATGCCTTGAAAACTGATATCCTTTATTGCTGGTTCTTGATAT