Contig 009724:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

clone5'-sequence3'-sequence
Seq.lengthcontigBestHitEvaluedescriptionlengthcontigBestHitEvaluedescription
JMFF032G15Sequence608009724 (2)ref|XP_004235733.1|1e-39PREDICTED: oleosin 1-like [Solanum lycopersicum]616009724 (2)ref|XP_009767218.1|1e-36PREDICTED: oleosin 1 [Nicotiana sylvestris]

Alignment

This contig is upended


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JMFF032G15- CTAGCCACTCTTCTCACTTCGATCGTCTCTCAGC
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consensus CTAGCCACTCTTCTCACTTCGATCGTCTCTCAGC
 
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JMFF032G15- TCCCTCCTAACAACTCTTTCTTCTTTAGCTCATCACAAATGGCCGACCTGCAATCCATCC
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consensus TCCCTCCTAACAACTCTTTCTTCTTTAGCTCATCACAAATGGCCGACCTGCAATCCATCC
 
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JMFF032G15- CCGCCCAAAATCAAAGACTCCCGCCGCGCGCAATGATCGCCTCCGGCGTCCCCGCCGCCT
rJMFF032G15+ GGCGTCCCCGCCGCCT
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consensus CCGCCCAAAATCAAAGACTCCCGCCGCGCGCAATGATCGCCTCCGGCGTCCCCGCCGCCT
 
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JMFF032G15- CCTTCCTCCGCAGATTTCAGGACCATGCATACGCTCCCAACTCATCTCAGCTCTTCGGTT
rJMFF032G15+ CCTTCCTCCGCAGATTTCAGGACCATGCATACGCTCCCAACTCATCTCAGCTCTTCGGTT
                      ____________________________________________________________
consensus CCTTCCTCCGCAGATTTCAGGACCATGCATACGCTCCCAACTCATCTCAGCTCTTCGGTT
 
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JMFF032G15- TCTTCACCTTGGTCGTCTCCGGCGGGATTCTCCTCTTCCTCACCGGCTTAACCCTCACCG
rJMFF032G15+ TCTTCACCTTGGTCGTCTCCGGCGGGATTCTCCTCTTCCTCACCGGCTTAACCCTCACCG
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consensus TCTTCACCTTGGTCGTCTCCGGCGGGATTCTCCTCTTCCTCACCGGCTTAACCCTCACCG
 
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JMFF032G15- CCACTATCCTTGGCTTGATCTTCTTCACGCCGTTGATCCTCATCTCCAGCCCCCTCTGGA
rJMFF032G15+ CCACTATCCTTGGCTTGATCTTCTTCACGCCGTTGATCCTCATCTCCAGCCCCCTCTGGA
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consensus CCACTATCCTTGGCTTGATCTTCTTCACGCCGTTGATCCTCATCTCCAGCCCCCTCTGGA
 
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JMFF032G15- TCCCCATCGGCACCGTCCTCTTCATCGCCATCGCCGGCCTCCTCTCCGTCTGCACCTTCG
rJMFF032G15+ TCCCCATCGGCACCGTCCTCTTCATCGCCATCGCCGGCCTCCTCTCCGTCTGCACCTTCG
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consensus TCCCCATCGGCACCGTCCTCTTCATCGCCATCGCCGGCCTCCTCTCCGTCTGCACCTTCG
 
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JMFF032G15- GCATCGCCGTCATCCTCACCCTCTCCTGGCTCTACCGCTACTACCGCGGCTTCCACCCGC
rJMFF032G15+ GCATCGCCGTCATCCTCACCCTCTCCTGGCTCTACCGCTACTACCGCGGCTTCCACCCGC
                      ____________________________________________________________
consensus GCATCGCCGTCATCCTCACCCTCTCCTGGCTCTACCGCTACTACCGCGGCTTCCACCCGC
 
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JMFF032G15- CCGGCTCCGACCGCTTCGACTACGCCCGGAGCAGGATCGTCGACACCGCCAACCACGTCA
rJMFF032G15+ CCGGCTCCGACCGCTTCGACTACGCCCGGAGCAGGATCGTCGACACCGCCAACCACGTCA
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consensus CCGGCTCCGACCGCTTCGACTACGCCCGGAGCAGGATCGTCGACACCGCCAACCACGTCA
 
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JMFF032G15- AGGACTACGCCGGCGGCTACCTTCACGGGGGTAATAAGGTCAAGGACGCGGCTCCCGGCG
rJMFF032G15+ AGGACTACGCCGGCGGCTACCTTCACGGGGGTAATAAGGTCAAGGACGCGGCTCCCGGCG
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consensus AGGACTACGCCGGCGGCTACCTTCACGGGGGTAATAAGGTCAAGGACGCGGCTCCCGGCG
 
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JMFF032G15- CCTGAACCGGCGGCACTAGCTAGCTAGCTTCAAG
rJMFF032G15+ CCTGAACCGGCGGCACTAGCTAGCTAGCTTCAAGACCGATCAGACCGGCGCGGTCGGGGG
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consensus CCTGAACCGGCGGCACTAGCTAGCTAGCTTCAAGACCGATCAGACCGGCGCGGTCGGGGG
 
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rJMFF032G15+ ATATGATAATGCGTACCGAACCGGGTTCCGTTTTTCTTCTTTGATATTAATTTTAATCAA
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consensus ATATGATAATGCGTACCGAACCGGGTTCCGTTTTTCTTCTTTGATATTAATTTTAATCAA
 
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rJMFF032G15+ TCAGGCACTATGAATACACATAAGAAACTTTGTGATGACTGATGAATATATATTTCCAGG
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consensus TCAGGCACTATGAATACACATAAGAAACTTTGTGATGACTGATGAATATATATTTCCAGG