Contig 009650:  Sequence
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clone5'-sequence3'-sequence
Seq.lengthcontigBestHitEvaluedescriptionlengthcontigBestHitEvaluedescription
JMFF012D20Sequence489009650 (2)ref|NP_001267966.1|1e-40NDR1/HIN1-like protein [Vitis vinifera] gb|ABU43058.1| NDR1/HIN1-like protein [V792009650 (2)emb|CDP04987.1|6e-87unnamed protein product [Coffea canephora]

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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF012D20-                                      ATTGTAAACTATACTCCTTATATTATTATATCC
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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consensus             CAGGCCACCTCCTCGGCTACTTGGCTTCTTGCAAGCTTGGCAAATATGTCTCAGATAACA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF012D20-           GACATTAGTAAGTCTCCAAAACACTGTGCCAAGAGAGACTTGAGCATTATTCAAAAGTTG
rJMFF012D20+          GACATTAGTAAGTCTCCAAAACACTGTGCCAAGAGAGACTTGAGCATTATTCAAAAGTTG
                      ____________________________________________________________
consensus             GACATTAGTAAGTCTCCAAAACACTGTGCCAAGAGAGACTTGAGCATTATTCAAAAGTTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF012D20-           AGATTCAAGAACAAGATCTTCTTCACCATCTTTACATTGCTACTCTCTATTCTCTCAATC
rJMFF012D20+          AGATTCAAGAACAAGATCTTCTTCACCATCTTTACATTGCTACTCTCTATTCTCTCAATC
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF012D20-           ATAACCCTTGTCTGGCTCACTCTCCACCCCTCCAAGCCACACTTCTCCCTCACACAAGCC
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF012D20-           CTCCTCTCCAAGAATCCCAACACAAAAGTGGGTATCTACTACGATGAGATTCAAGTTTAT
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF012D20-           GCATCCTACAAGGGGCAGCAGATCACTCTCTATACTTCTCTCCCACCATTCTATCAAGGC
rJMFF012D20+          GCATCCTACAAGGGGCAGCAGATCACTCTCTATACTTCTCTCCCACCATTCTATCAAGGC
                      ____________________________________________________________
consensus             GCATCCTACAAGGGGCAGCAGATCACTCTCTATACTTCTCTCCCACCATTCTATCAAGGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF012D20-           CACGAGGAATCTAACCTTCTCTCGGCTTACCTCGTG                        
rJMFF012D20+          CACGAGGAATCTAACCTTCTCTCGGCTTACCTCGTGGCTGGGAATGGCCTCACCGTGGCT
                      ____________________________________________________________
consensus             CACGAGGAATCTAACCTTCTCTCGGCTTACCTCGTGGCTGGGAATGGCCTCACCGTGGCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF012D20+          CCTTCGTTTAGCTATGAAGTCCAGCGCGATCAGAGCGCTGGAAGGTTAGTTTTGATGCTT
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF012D20+          AAGGTGAATGGGAATTTGAGATGGAAGGTGGGGACTTGGGTTTCTGGGAAATACAGGTTT
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF012D20+          AATGTAAACTGTGTTGCCATGATGCCTTTTGGAGTTTCCATGCCATCTGGTCCCTTGATT
                      ____________________________________________________________
consensus             AATGTAAACTGTGTTGCCATGATGCCTTTTGGAGTTTCCATGCCATCTGGTCCCTTGATT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF012D20+          TCTAAGCAGGGAACTCAGTGCTCCACTTCAATTTGAACAAATTAAGATAGTTATACTAAT
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consensus             TCTAAGCAGGGAACTCAGTGCTCCACTTCAATTTGAACAAATTAAGATAGTTATACTAAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF012D20+          ACTTGCTATCTACCATGCATCTTAATTCTTATAGTATGTAGTTTATCATATCATCAGTCT
                      ____________________________________________________________
consensus             ACTTGCTATCTACCATGCATCTTAATTCTTATAGTATGTAGTTTATCATATCATCAGTCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF012D20+          TTCCTAAATAATTAATTTTATTTCTTGACTCTTATATTGTAAATCAGATTATATATAGAA
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consensus             TTCCTAAATAATTAATTTTATTTCTTGACTCTTATATTGTAAATCAGATTATATATAGAA