Contig 009120:  Sequence
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JMFN015G19+                    AACATTTGTCTTCTGATCTGGGTGAATTTGTTCGGAACCGCTTCCTGGCGT
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN015G19+           TAGGATTTGACGGAGGAGTGACGGCGGTGACGGAGATGGGGGCGGTGTTGTCCGTTTGTA
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN015G19+           GCGCGGACAGTCCCGTGCCGAGTGCGAGAAGCACGTGAGACGCGGAGGGGTAATACGCCG
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN015G19+           AGGAGATCGGCGGCGGGGACGAGGAATTCGGGCTGCTATGGCACCCGCTGCCGCCGCCGC
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN015G19+           CGCGGTGACCCTGCGGCGGCGGCGGAGGAGGGTGGTGGCGGTGGTGCGGCTGGTACTCAA
JMFN003H17+           CGCGGTGACCNTACGNCGNCGGCGGAGGAGGGTGGTGNCGGTGGTGCGGCTGGTACTCAA
JMFN018C16+           CGCGGTGACCCTGCGGCGGCGGCGGAGAAGGGTGGTGNCGGTGGTNCGGCTGGTACTCAA
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS031D06+                        GTCGTGCGGGGAAAGCACCTCCTCCGGCGGCTCACGGCGGTGGAAAT
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JMFN018C16+           GCGCCGCCACCGCGTCGTGCGGGGAAAGCACCTCCTCCGGCGGCTCACGGCGGTGGAAAT
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS031D06+           TACGGTGACACCCACACGCCGCGCATTTCAGGGAGGTCGGGTCGGCCGGGTTAGCCGTCG
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS031D06+           GCGAAGCCATAAACTCCCCACACCCATCCACCGCATGCC                     
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JMFN003H17+           GCGAAGCCATAAACTCCCCACACCCATCCACCGCATGCCCCCCCAGCGCCGCCGCGTGAT
JMFN018C16+           GCGAAGCCATAAACTCCCCACACCCATCCACCGCATGCCCCCCCAGCGCCGCCGCGTGAT
JMFS143B10+           GCGAAGCCATAAACTCCCCACACCCATCCACCGCATGCCCCCCCAGCGCCGCCGCGTGAT
                      ____________________________________________________________
consensus             GCGAAGCCATAAACTCCCCACACCCATCCACCGCATGCCCCCCCAGCGCCGCCGCGTGAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN015G19+           TCTTCAAACATTCCCTGTAGTGCACCACCACGGGGTGGTGGTGCCCGTTGCTCCCAAACC
JMFN003H17+           TCTTCAAACATTCCCTGTAGTGCACCACCACGGGGTGGTGGTGCCCGTTGCTCCCAAACC
JMFN018C16+           TCTTCAAACATTCCCTGTAGTGCACCACCACGGGGTGGTGGTGCCCGTTGCTCCCAAACC
JMFS143B10+           TCTTCAAACATTCCCTGTAGTGCACCACCACGGGGTGGTGGTGCCCGTTGCTCCCAAACC
                      ____________________________________________________________
consensus             TCTTCAAACATTCCCTGTAGTGCACCACCACGGGGTGGTGGTGCCCGTTGCTCCCAAACC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN015G19+           CACCCCCGTGACGGGGGTGGTTCAGCCGTTTCAGCACCCCGTTGCTGCTGTACGACAACG
JMFN003H17+           CACCCCCGTGACGGGGGTGGTTCAGCCGTTTCAGCACCCCGTTGCTGCTGTACGACAACG
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                      ____________________________________________________________
consensus             CACCCCCGTGACGGGGGTGGTTCAGCCGTTTCAGCACCCCGTTGCTGCTGTACGACAACG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN015G19+           GCTTCGCCGGGTAGATCCGCGCCGCCGCCGTCGGCGTCTCCGTGTCCGCCTCCGGCGTCT
JMFN003H17+           GCTTCGCCGGGTAGATCCGCGCCGCCGCCGTCGGCGTCTCCGTGTCCGCCTCCGGCGTCT
JMFN018C16+           GCTTCGCCGGGTAGATCCGCGCCGCCGCCGTCGGCGTCTCCGTGTCCGCCTCCGGCGTCT
JMFS143B10+           GCTTCGCCGGGTAGATCCGCGCCGCCGCCGTCGGCGTCTCCGTGTCCGCCTCCGGCGTCT
                      ____________________________________________________________
consensus             GCTTCGCCGGGTAGATCCGCGCCGCCGCCGTCGGCGTCTCCGTGTCCGCCTCCGGCGTCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN015G19+           TCACAGTCGCCGCC                                              
JMFN003H17+           TCACAGTCGCCGCCGCCGCCGCCCCGCAGCTGCTACTTATCTCCATCCCTT         
JMFN018C16+           TCACAGTCGCCGCCGCCGCCGCCCCGCAGCTGCTACTTATCTCCATCCCTTAAAAAACCC
JMFS143B10+           TCACAGTCGCCGCCGCCGCCGCCCCGCAGCTGCTACTTATCTCCATCCCTTAAAAAACCC
                      ____________________________________________________________
consensus             TCACAGTCGCCGCCGCCGCCGCCCCGCAGCTGCTACTTATCTCCATCCCTTAAAAAACCC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN018C16+           TCCCACCAGTGGGGCTTCCACTCTTTAAACCTTAAAAACCACTTTTCCCAGTTTCCCCCT
JMFS143B10+           TCCCACCAGTGGGGCTTCCACTCTTTAAACCTTAAAAACCACTTTTCCCAGTTTCCCCCT
                      ____________________________________________________________
consensus             TCCCACCAGTGGGGCTTCCACTCTTTAAACCTTAAAAACCACTTTTCCCAGTTTCCCCCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFN018C16+           ATTCTC                                                      
JMFS143B10+           ATTCTCTTACGAGGTTAATCCGACGAACATAGGGCCAAGATTTCACACAAACATCTTATC
                      ____________________________________________________________
consensus             ATTCTCTTACGAGGTTAATCCGACGAACATAGGGCCAAGATTTCACACAAACATCTTATC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS143B10+           CAAACCCGTGAGGGGCCGATTGAGAGGATGAAGTTTCAGTGATGGGTTTGTTTTGGAATT
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consensus             CAAACCCGTGAGGGGCCGATTGAGAGGATGAAGTTTCAGTGATGGGTTTGTTTTGGAATT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS143B10+           ACGTTTGATGAAAGATAAAACGGTGTTGAGGGATATATGGTTTCTAGTATGCCGGATTAA
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consensus             ACGTTTGATGAAAGATAAAACGGTGTTGAGGGATATATGGTTTCTAGTATGCCGGATTAA