Contig 009109:  Sequence
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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JMSF026K07+           GTATGGAGATATTAGGAAAGTGCATTGCTGTTTAAAAAGGGTTTCCATTACTCAACAACA
JMSF020E09+           GTATGGAGATATTAGGAAAGTGCATTGCTGTTTAAAAAGGGTTTCCATTACTCAACAACA
JMFS134D05+           GTATGGAGATATTAGGAAAGTGCATTGCTGTTTAAAAAGGGTTTCCATTACTCAACAACA
                      ____________________________________________________________
consensus             GTATGGAGATATTAGGAAAGTGCATTGCTGTTTAAAAAGGGTTTCCATTACTCAACAACA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF038G19+           CACACACAGAAATCTAATTGTAATATAAAATTTAGAAAAGAAAACATACCACACC     
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rJMSF038G19-          CACACACAGANATCNAATTGTAATATANNATTTAGAAAAGAAAACATACCACACC     
rJMSF026K07-          CACNCACANAAGTCTAANTGTGATANAANATTTAGAAAAGAAAACNTACCACACCGTCGA
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF032L11+           TCACGTTTTCACCAATCAAGAGGCTTCACAGTGATGCCATAAGAAAAAG-AAAAAAAAAG
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                      ____________________________________________________________
consensus             TCACGTTTTCACCAATCAAGAGGCTTCACAGTGATGCCATAAGAAAAAG-AAAAAAAAAG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF032L11+           GTCACAAATACGGGTTGAATATGGGAAGCTGTGAGATCAGAGAAGGGTCAAATATGGAGG
JMSF031I08+           GTCACAAATACGGGTTGAATATGGGAAGCTGTGAGATCAGAGAAGGGTCAAATATGGAGG
rJMSF020E09-          GTCACAAATACGGGTTGAATATGGGAAGCTGTGAGATCAGAGAAGGGTCAAATATGGAGG
rJMSF026K07-          GTCACAGATACGGGTTGAATANGGGAAGCTGTGAG                         
JMSF026K07+           GTCACAAATACGGGTTGAATATGGGAAGCTGTGAGATCAGAGAAGGGTCAAATATGGAGG
JMSF020E09+           GTCACAAATACGGGTTGAATATGGGAAGCTGTGAGATCAGAGAAGGGTCAAATATGGAGG
JMFS134D05+           GTCACAAATACGGGTTGAATATGGGAAGCTGTGAGATCAGAGAAGGGTCAAATATGGAGG
                      ____________________________________________________________
consensus             GTCACAAATACGGGTTGAATATGGGAAGCTGTGAGATCAGAGAAGGGTCAAATATGGAGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF032L11+           TCTGAGAGAGAAATAAAGAAGGGTTGA                                 
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rJMSF020E09-          TCTGAGAGAGAAATAANGAAGGGTTGAATAT                             
JMSF026K07+           TCTGAGAGAGAAATAAAGAAGGGTTGAAT                               
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JMFS134D05+           TCTGAGAGAGAAATAAAGAAGGGTTGAATATGGAGATCTGAAAGAGAGAAGGGAGACAAT
                      ____________________________________________________________
consensus             TCTGAGAGAGAAATAAAGAAGGGTTGAATATGGAGATCTGAAAGAGAGAAGGGAGACAAT