Contig 006600:  Sequence
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rJMFF029A04+                                                       TTCTTGATTTCTCCA
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consensus                                                          TTCTTGATTTCTCCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF029A04+          ATAACCACTTTCATGGAGAGATTCCACAATCGTTTATAGGAGAGCTACGCTACATAAGGT
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF029A04+          ATTTGAATTTATCCCATAACCAATTGATCGGCAATATTCCATCATGGTTAGGAAATTTAT
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
consensus             CTAATCTTGAGGCACTTGATCTCTCATCCAACCAACTAGTTGGTAAAATTCCTGAACAGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF034E09+          CTCTATGTGGATTTCCACTAACGATACAATGTCAAGGCAGCAATAATGGGTCACCGCCCC
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JMSF034E09-           CTCTATGTGGATTTCCACTAACGATACAATGTCAAGGCAGCAATAATGGGTCACCGCCCC
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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rJMFF029A04+          AAACACTAGCACTAGAAGGAGAGGATTCAGGAAATTTTGGGGGCGGATTTGGGTGGCGAA
JMSF034E09-           AAACACTAGCACTAGAAGGAGAGGATTCAGGAAATTTTGGGGGCGGATTTGGGTGGCGAA
                      ____________________________________________________________
consensus             AAACACTAGCACTAGAAGGAGAGGATTCAGGAAATTTTGGGGGCGGATTTGGGTGGCGAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF034E09+          GTGTTGTTGTAGGATACTGTTGTGGCATGCCATTTGGTATTTTTGTGGGATATCTTGCGT
rJMFF029A04+          GTGTTGTTGTAGGATACTGTTGTGGCATGCCATTTGGTATTTTTGTGGGATATCTTGCGT
JMSF034E09-           GTGTTGTTGTAGGATACTGTTGTGGCATGCCATTTGGTATTTTTGTGGGATATCTTGCGT
                      ____________________________________________________________
consensus             GTGTTGTTGTAGGATACTGTTGTGGCATGCCATTTGGTATTTTTGTGGGATATCTTGCGT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF034E09+          TTTTATATAGAAGACCAAGATTGTTTGTAAGGTTTGCGACTGGAGATAAGAATTGAAAGG
rJMFF029A04+          TTTTATATAGAAGACCAAGATTGTTTGTAAGGTTTGCGACTGGAGATAAGAATTGAAAGG
JMSF034E09-           TTTTATATAGAAGACCAAGATTGTTTGTAAGGTTTGCGACTGGAGATAAGAATTGAAAGG
                      ____________________________________________________________
consensus             TTTTATATAGAAGACCAAGATTGTTTGTAAGGTTTGCGACTGGAGATAAGAATTGAAAGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF034E09+          GCTGCGCTGCAGGTATATGATGAGCTTTGGTTTTCATTTTGATGGAGTATTTCATGTGTG
rJMFF029A04+          GCTGCGCTGCAGGTATATGATGAGCTTTGGTTTTCATTTTGATGGAGTATTTCATGTGTG
JMSF034E09-           GCTGCGCTGCAGGTATATGATGAGCTTTGGTTTTCATTTTGATGGAGTATTTCATGTGTG
                      ____________________________________________________________
consensus             GCTGCGCTGCAGGTATATGATGAGCTTTGGTTTTCATTTTGATGGAGTATTTCATGTGTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF034E09+          TTTAATTAATGCGCTAGTGCAGAGTGCTTTGAGTTTAATTTTCATTTTGAAACTTGCATG
rJMFF029A04+          TTTAATTAATGCGCTAGTGCAGAGTGCTTTGAGTTTAATTTTCATTTTGAAACTTGCATG
JMSF034E09-           TTTAATTAATGCGCTAGTGCAGAGTGCTTTGAGTTTAATTTTCATTTTGAAACTTGCATG
                      ____________________________________________________________
consensus             TTTAATTAATGCGCTAGTGCAGAGTGCTTTGAGTTTAATTTTCATTTTGAAACTTGCATG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF034E09+          TAT                                                         
rJMFF029A04+          TATTGTATTAGCGGTTATTTTAATTTCACCTATTGTACGTTTTAATGAACAAAA      
JMSF034E09-           TATTGTATTAGCGGTTATTTTAATTTCACCTATTGTACGTTTTAATGAACAAAAAAAAAA
                      ____________________________________________________________
consensus             TATTGTATTAGCGGTTATTTTAATTTCACCTATTGTACGTTTTAATGAACAAAAAAAAAA