Contig 006295:  Sequence
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS117H04+                                              AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAATT
JMFS122H09+                                                               GAAGAATT
                      ____________________________________________________________
consensus                                                AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAATT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS117H04+           TTGGGAGATTTGGAGATGAGAATTAAGGTGGTGGGAATGATGAATGATGATTAAGGTGGT
JMFS122H09+           TTGGGAGATTTGGAGATGAGAATTAAGGTGGTGGGAATGATGAATGATGATTAAGGTGGT
                      ____________________________________________________________
consensus             TTGGGAGATTTGGAGATGAGAATTAAGGTGGTGGGAATGATGAATGATGATTAAGGTGGT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS117H04+           GGAAGAGAAGAGAAGATGAGAGTATGTGTTTGTTTTCTTGTGTGTTGTGTTGATCTGGAC
JMFS122H09+           GGAAGAGAAGAGAAGATGAGAGTATGGGTTTGTTTTCTTGTGTGTTGTGTTGATCTGTAC
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consensus             GGAAGAGAAGAGAAGATGAGAGTATGTGTTTGTTTTCTTGTGTGTTGTGTTGATCTGTAC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS117H04+           AAGTCTGATTGATTAATTGCGGATTTTACTGAGGGAAAAGACTGAGTAAAAAGAATTTGG
JMFS122H09+           AAGTCTGATTGATTAATTGCGGATTTTACTGAGGGAAAAGACTGAGTAAAAAGAATTTGG
                      ____________________________________________________________
consensus             AAGTCTGATTGATTAATTGCGGATTTTACTGAGGGAAAAGACTGAGTAAAAAGAATTTGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS117H04+           GTGTAAAAAGCTATATTGGTGGGGATGGTTTTGTGAGTTTGAACTGCAATGCAATATACC
JMFS122H09+           GTGTAAAAAGCTATATTGGTGGGGATGGTTTTGTGAGTTTGAACTGCAATGCAATATACC
                      ____________________________________________________________
consensus             GTGTAAAAAGCTATATTGGTGGGGATGGTTTTGTGAGTTTGAACTGCAATGCAATATACC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS117H04+           TTAATCTCTTTATGTTTTTTACTACTTAAACTTATTCACTTTTAATTTACTCACTTATTC
JMFS122H09+           TTAATCTCTTTATGTTTTTTACTACTTAAACTTATTCCCTTTTAATTTACTCCCTTATTC
                      ____________________________________________________________
consensus             TTAATCTCTTTATGTTTTTTACTACTTAAACTTATTCCCTTTTAATTTACTCCCTTATTC