Contig 005985:  Sequence
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF026N22+                                                 TTGGAAGATGAGAGAAACGGGA
                      ____________________________________________________________
consensus                                                   TTGGAAGATGAGAGAAACGGGA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF026N22+           AGAAGAGGAGCATTCTTAATTTTTTCGTCTGCGTCGAATTGCCACACATCCTCTCCACGG
                      ____________________________________________________________
consensus             AGAAGAGGAGCATTCTTAATTTTTTCGTCTGCGTCGAATTGCCACACATCCTCTCCACGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004A02+                                                              ATAAACCAA
JMFF026N22+           CCGTTGATGGTTCCTCCGCCGGTGACTTCCACGCCGGCAACATGTTCGATGATAAACCAA
                      ____________________________________________________________
consensus             CCGTTGATGGTTCCTCCGCCGGTGACTTCCACGCCGGCAACATGTTCGATGATAAACCAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004A02+           TAGTTTGAAGTGTAGNCGCTAAGGTCGCTGTCGGCCACCATGGTTCCCTTAATTTCAATC
JMFF026N22+           TAGTTTGAAGTGTAGACGCTAAGGTCGCTGTCGGCCACCATGGTTCCCTTAATTTCAATC
                      ____________________________________________________________
consensus             TAGTTTGAAGTGTAGACGCTAAGGTCGCTGTCGGCCACCATGGTTCCCTTAATTTCAATC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004A02+           ACAATGCGTTTAGCAGTGCAGGGTCCTTGGAACACAACCTCTCCTGCGAGGAATGTTCCT
JMFF026N22+           ACAATGCGTTTAGCAGTGCAGGGTCCTTGGAACACAACCTCTCCTGCGAGGAATGTTCCT
                      ____________________________________________________________
consensus             ACAATGCGTTTAGCAGTGCAGGGTCCTTGGAACACAACCTCTCCTGCGAGGAATGTTCCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004A02+           CGTGGAATTACAACCTTAGCCGCCCCCCTAGAATGGCATGCTTTGTTCCACGCTCTGATC
JMFF026N22+           CGTGGAATTACAACCTTAGCCGCCCCCCTAGAATGGCATGCTTTGTTCCACGCTCTGATC
                      ____________________________________________________________
consensus             CGTGGAATTACAACCTTAGCCGCCCCCCTAGAATGGCATGCTTTGTTCCACGCTCTGATC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF004A02+           ATTGCC                                                      
JMFF026N22+           ATTGCCATTGTGCTATCTCCTTTGCCATCGGGTTTGGCCCCAAATTTGGTAACGTCGAAA
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consensus             ATTGCCATTGTGCTATCTCCTTTGCCATCGGGTTTGGCCCCAAATTTGGTAACGTCGAAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF026N22+           ATAGTGTGTGTGTGGCCACGACCACGAGGGATGCATTCCACTCCGGTAGAGAGCAAGGCT
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consensus             ATAGTGTGTGTGTGGCCACGACCACGAGGGATGCATTCCACTCCGGTAGAGAGCAAGGCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF026N22+           ATACCTAATAAGATAACAAAAATTCCAGCCTTGATCTCCATTGTGGCCACATAAATATGT
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consensus             ATACCTAATAAGATAACAAAAATTCCAGCCTTGATCTCCATTGTGGCCACATAAATATGT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF026N22+           TCAACGTACCTAAGACGATAGATATCTTTTCTTCGTCTTTAATGTTTTAGGAAGAAAAGG
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consensus             TCAACGTACCTAAGACGATAGATATCTTTTCTTCGTCTTTAATGTTTTAGGAAGAAAAGG