Contig 005972:  Sequence
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JMFS001G09+                     TTTTAAAGTTGTTTTAGATTAAAAAAAAGGATAAGGTACAAATAAGCCAC
                      ____________________________________________________________
consensus                       TTTTAAAGTTGTTTTAGATTAAAAAAAAGGATAAGGTACAAATAAGCCAC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS001G09+           CGAACTATTTAGGAAATAGCAATTAAGTCATCGAACTCAAATAACCTCCAAATAAGTCAC
                      ____________________________________________________________
consensus             CGAACTATTTAGGAAATAGCAATTAAGTCATCGAACTCAAATAACCTCCAAATAAGTCAC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS001G09+           TGAATCTGGAAAAAAAGAGCAATTAACATTTTTAACAGGTTAACTTCTAGTTTTTGCTGA
                      ____________________________________________________________
consensus             TGAATCTGGAAAAAAAGAGCAATTAACATTTTTAACAGGTTAACTTCTAGTTTTTGCTGA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS001G09+           TTGGATTGCTACATATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATT
JMFS110E01+                           TTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATT
                      ____________________________________________________________
consensus             TTGGATTGCTACATATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS001G09+           ATGGATTATTTGTATGTAAATTCTCAAATTACCATTGGGTTATTATTTTAATTACCATTT
JMFS110E01+           ATGGATTATTTGTATGTAAATTCTCAAATTACCATTGGGTTATTATTTTAATTACCATTT
                      ____________________________________________________________
consensus             ATGGATTATTTGTATGTAAATTCTCAAATTACCATTGGGTTATTATTTTAATTACCATTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS001G09+           TACCCAGAAATTAAAATTAATTAATTAAGACCATTTTCATCGTTAATCTAGAATGGGGTT
JMFS110E01+           TACCCAGAAATTAAAATTAATTAATTAAGACCATTTTCATCGTTAATCTAGAATGGGGTT
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consensus             TACCCAGAAATTAAAATTAATTAATTAAGACCATTTTCATCGTTAATCTAGAATGGGGTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS001G09+           TCTTCAGATCAATCCCGCCGGTACAACGACGGCAATAATGGTGCTATTGCTTTTGGCGAC
JMFS110E01+           TCTTCAGATCAATCCCGCCGGTACAACGACGGCAATAATGGTGCTATTGCTTTTGGCGAC
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consensus             TCTTCAGATCAATCCCGCCGGTACAACGACGGCAATAATGGTGCTATTGCTTTTGGCGAC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS001G09+           GGTGCACGGCGGATGGCAGCCACAGCCGGCGCAGCTAGGGCAGTGCCTCGTCACCTGTAG
JMFS110E01+           GGTGCACGGCGGATGGCAGCCACAGCCGGCGCAGCTAGGGCAGTGCCTCGTCACCTGTAG
                      ____________________________________________________________
consensus             GGTGCACGGCGGATGGCAGCCACAGCCGGCGCAGCTAGGGCAGTGCCTCGTCACCTGTAG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS001G09+           CCAGACAACCATCGCTTGCACCCTCCAGTGCGGCGGCGCCGTGCTTGACTCCTTGGCGTG
JMFS110E01+           CCAGACAACCATCGCTTGCACCCTCCAGTGCGGCGGCGCCGTGCTTGACTCCTTGGCGTG
                      ____________________________________________________________
consensus             CCAGACAACCATCGCTTGCACCCTCCAGTGCGGCGGCGCCGTGCTTGACTCCTTGGCGTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS001G09+           TATGACTGCTTGCGGCACCAACAGCGTTAGCTGTGGCACCATTGGCTGCTTGAGAGCTTA
JMFS110E01+           TATGACTGCTTGCGGCACCAACAGCGTTAGCTGTGGCACCATTGGCTGCTTGAGAGCTTA
JMFF024E04+                                                            TTGAGAGCTTA
                      ____________________________________________________________
consensus             TATGACTGCTTGCGGCACCAACAGCGTTAGCTGTGGCACCATTGGCTGCTTGAGAGCTTA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS001G09+           AGAATGGGATTGTATTCAAAGACTCCAT                                
JMFS110E01+           AGAATGGGATTGTATTCAAAGACTCCATTGAGTTGGTGGGACAAAA              
JMFF024E04+           ACAATGGGATTGTATTCAAAGACTCCATTGAGTTGGTGGGACAAAATTTATTTGGATGAT
                      ____________________________________________________________
consensus             AGAATGGGATTGTATTCAAAGACTCCATTGAGTTGGTGGGACAAAATTTATTTGGATGAT