Contig 005734:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

Alignment

This contig is upended


                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS153B05+                                                      GCTTAAGCAGCATTATT
rJMSF032M16-          TTAGATTTCCGGTATAATTAAACCAGAGAATTGAATTACGCTTGCTTAAGCAGCATTATT
                      ____________________________________________________________
consensus             TTAGATTTCCGGTATAATTAAACCAGAGAATTGAATTACGCTTGCTTAAGCAGCATTATT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS153B05+           GCATTGATTTAAAAGCTGTGAAATATCCTCATAGTTGAACAACCTCGCTATGGAAAGGGG
rJMSF032M16-          GNATTGATTTAAAAGCTGTGAAATATCCTCATAGTTGAACAACCTCGCTATGGAAAGGGG
                      ____________________________________________________________
consensus             GCATTGATTTAAAAGCTGTGAAATATCCTCATAGTTGAACAACCTCGCTATGGAAAGGGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS153B05+           AGTTAAGCCTTTGATGTTTGTAGCGTTGACGTCGGCGCCTCTGTTGATCAACACCTCAAC
rJMSF032M16-          AGTTAAGCCTTTGATGTTTGTAGCGTTGACGTCGGCGCCTCTGTTGATCAACACCTCAAC
                      ____________________________________________________________
consensus             AGTTAAGCCTTTGATGTTTGTAGCGTTGACGTCGGCGCCTCTGTTGATCAACACCTCAAC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS153B05+           CGTCTGAGCGCAGCCGCCTTCCACGGCCAGGTGCAGCGGAGTGTGGCCGCCGGCGTCATG
rJMSF032M16-          CGTCTGAGCGCAGCCGCCTTCCACGGCCAGGTGCANCGGANTGTGGCCGCCGGCGTCATG
                      ____________________________________________________________
consensus             CGTCTGAGCGCAGCCGCCTTCCACGGCCAGGTGCAGCGGAGTGTGGCCGCCGGCGTCATG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS153B05+           GCACTCTATGTCCGCCCCGAAATCAACCAGAATCATCACCGCATCTTTCATTCCTTTTAT
rJMSF032M16-          GCACTCTATGTCCGCCCCGAAATCAANCANAATCATCACCGCATCTTTCATTCCTTTTAT
                      ____________________________________________________________
consensus             GCACTCTATGTCCGCCCCGAAATCAACCAGAATCATCACCGCATCTTTCATTCCTTTTAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS153B05+           GGCCGCCACGTGGAGGGCCGTCAGTCCGTATTGATCGCAGAAAGTAGTGATTGCCCCCTT
rJMSF032M16-          GGCCGCCACGTGGAGGGCCGTCAGTCCGTATTGATCNCAAAAAGTANTGATTGCCCCCTT
                      ____________________________________________________________
consensus             GGCCGCCACGTGGAGGGCCGTCAGTCCGTATTGATCGCAGAAAGTAGTGATTGCCCCCTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS153B05+           TTCCAGTAGCGACTCCAGAAGCCGTAGCTCTCCTCGCCTCGCCGCTTGCACCACTTGCTC
rJMSF032M16-          TTCCAGTAGCGACTCCNGAAGCCGNAGCTCTCCTCGCCNCGCCGCTTGNACCANTTGCTC
                      ____________________________________________________________
consensus             TTCCAGTAGCGACTCCAGAAGCCGTAGCTCTCCTCGCCTCGCCGCTTGCACCACTTGCTC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS153B05+           TCC                                                         
rJMSF032M16-          TCCTCTTTCAACAATCTTNACAATCCCCTCGTGTCCCTTATCTCTTGCGACGTCAATAGG
                      ____________________________________________________________
consensus             TCCTCTTTCAACAATCTTNACAATCCCCTCGTGTCCCTTATCTCTTGCGACGTCAATAGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF032M16-          CGAGTGTCCTAGATTGTCGGTCACGGTGGGGTCCGCACCCATCTCAATAANCATCTGTAC
                      ____________________________________________________________
consensus             CGAGTGTCCTAGATTGTCGGTCACGGTGGGGTCCGCACCCATCTCAATAANCATCTGTAC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF032M16-          CATCTGATAATCTCNGTTAACTACAGCTCTGTACAAAGCGGTTCTCCCGTCGATGCTACG
                      ____________________________________________________________
consensus             CATCTGATAATCTCNGTTAACTACAGCTCTGTACAAAGCGGTTCTCCCGTCGATGCTACG