Contig 004646:  Sequence
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF045C08+                                                                      A
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consensus                                                                        A
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF045C08+           AGGCGTGGGGATCCCAGACAACGAAGCTGTGGCCGCCTCTGCTCCAAGAAACAACACGAT
                      ____________________________________________________________
consensus             AGGCGTGGGGATCCCAGACAACGAAGCTGTGGCCGCCTCTGCTCCAAGAAACAACACGAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF045C08+           TAGTACCAGGATCATCCACCATATCATAAGTCGGGATCAGGAANGGCGGAGGCCCGAGGT
                      ____________________________________________________________
consensus             TAGTACCAGGATCATCCACCATATCATAAGTCGGGATCAGGAANGGCGGAGGCCCGAGGT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF016J12+                                                                      C
JMFF045C08+           CANGGAGCCCCTCCGTCGGCNGCGGCGGCGGAATCNCCNCCGGGTNTCCGCCGCCGCCGC
                      ____________________________________________________________
consensus             CANGGAGCCCCTCCGTCGGCNGCGGCGGCGGAATCNCCNCCGGGTNTCCGCCGCCGCCGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF016J12+           CCCCCGCCGACGAACTCGATCCCGCCGGATACTCCTCCTTAACATGGTAAACTAAATCCA
JMFF045C08+           CCCCCGCCGACGAACTCGATCCCGCCGGATACTCCTCCTTAACATGGTAAACTAAATCCA
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consensus             CCCCCGCCGACGAACTCGATCCCGCCGGATACTCCTCCTTAACATGGTAAACTAAATCCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF016J12+           TCGCCACTACTACTACCGCAAAAGCTTTATACTTTTCTTGTGAAGAAAAAGCAACTAACA
JMFF045C08+           TCGCCACTACTACTACCGCAAAAGCTTTATACTTTTCTTGTGAAGAAAAAGCAACTAACA
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consensus             TCGCCACTACTACTACCGCAAAAGCTTTATACTTTTCTTGTGAAGAAAAAGCAACTAACA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF016J12+           GGTATACTAGCAGTCAAAAGAGATTGTTGACCGTGGATTGGAGGAACAAAATATCAAC  
JMFF045C08+           GGTATACTAGCAGTCAAAAGAGATTGTTGACCGTGGATTGGAGGAACAAAATACCAACCG
                      ____________________________________________________________
consensus             GGTATACTAGCAGTCAAAAGAGATTGTTGACCGTGGATTGGAGGAACAAAATATCAACCG