Contig 004405:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

clone5'-sequence3'-sequence
Seq.lengthcontigBestHitEvaluedescriptionlengthcontigBestHitEvaluedescription
JMSF030P06Sequence632003733 (2)708004405 (2)
JMSF049N09Sequence654003733 (2)702004405 (2)

Alignment

This contig is upended


. : . : . : . : . : . :
rJMSF030P06+ TTTTTTTTTTTTGTTTCTAAAATATTTTTAGCANGACTATTAATTGTGATAATTCACC
rJMSF049N09+ CTAAAATATTTTTAGCAAGACTATTAATTGTGATAATTCACC
                      ____________________________________________________________
consensus TTTTTTTTTTTTGTTTCTAAAATATTTTTAGCAAGACTATTAATTGTGATAATTCACC
 
. : . : . : . : . : . :
rJMSF030P06+ ATCTAATATGTTTTAATCGGACAAATCCATGCCTATTAAGACTAATAATATGTAAATGAG
rJMSF049N09+ ATCTAATATGTTTTAATCGGACAAATCCATGCCTATTAAGACTAATAATATGTAAATGAG
                      ____________________________________________________________
consensus ATCTAATATGTTTTAATCGGACAAATCCATGCCTATTAAGACTAATAATATGTAAATGAG
 
. : . : . : . : . : . :
rJMSF030P06+ CCATTGCGCTCTCATAGGATAGTCAAAGACTTTAAGTTTAGGAGTGAAGAATTGTGATGA
rJMSF049N09+ CCATTGCGCTCTCATAGGATAGTCAAAGACTTTAAGTTTAGGAGTGAAGAATTGTGATGA
                      ____________________________________________________________
consensus CCATTGCGCTCTCATAGGATAGTCAAAGACTTTAAGTTTAGGAGTGAAGAATTGTGATGA
 
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rJMSF030P06+ TTTACCATCTAATATGCACACAAGTTTATTGCACTATGAGTATGTATGTTGGTTTTACCA
rJMSF049N09+ TTTACCATCTAATATGCACACAAGTTTATTGCACTATGAGTATGTATGTTGGTTTTACCA
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consensus TTTACCATCTAATATGCACACAAGTTTATTGCACTATGAGTATGTATGTTGGTTTTACCA
 
. : . : . : . : . : . :
rJMSF030P06+ CTAGGAGCACAATCAATCAGATTGCAAACAAGAATAATGCAAAGATTAATAATAAAGCTA
rJMSF049N09+ CTAGGAGCACAATCAATCAGATTGCAAACAAGAATAATGCAAAGATTAATAATAAAGCTA
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consensus CTAGGAGCACAATCAATCAGATTGCAAACAAGAATAATGCAAAGATTAATAATAAAGCTA
 
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rJMSF030P06+ AGTTACATGGATAAAGTTTGTAAACAATGACCAGGGAATAATGAATAATAAAGCTAAAGA
rJMSF049N09+ AGTTACATGGATAAAGTTTGTAAACAATGACCAGGGAATAATGAATAATAAAGCTAAAGA
                      ____________________________________________________________
consensus AGTTACATGGATAAAGTTTGTAAACAATGACCAGGGAATAATGAATAATAAAGCTAAAGA
 
. : . : . : . : . : . :
rJMSF030P06+ ATATTTTATTATTGCCTTTTTGAAGATGGTAAAATCAAACATCAAACCCTCCTTTCCCAA
rJMSF049N09+ ATATTTTATTATTGCCTTTTTGAAGATGGTAAAATCAAACATCAAACCCTCCTTTCCCAA
                      ____________________________________________________________
consensus ATATTTTATTATTGCCTTTTTGAAGATGGTAAAATCAAACATCAAACCCTCCTTTCCCAA
 
. : . : . : . : . : . :
rJMSF030P06+ AGTATTTATACATGTCTATCCTACTAATAATTAAAGTAATAAATCTCTTTAATTATACTA
rJMSF049N09+ AGTATTTATACATGTCTATCCTACTAATAATTAAAGTAATAAATCTCTTTAATTATACTA
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consensus AGTATTTATACATGTCTATCCTACTAATAATTAAAGTAATAAATCTCTTTAATTATACTA
 
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rJMSF030P06+ CACAAATCTAGGAAAGTAATCCTCGTCATTAAAACACTCATAATTAGGAGAGAAACCCGA
rJMSF049N09+ CACAAATCTAGGAAAGTAATCCTCGTCATTAAAACACTCATAATTAGGAGAGAAACCCGA
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consensus CACAAATCTAGGAAAGTAATCCTCGTCATTAAAACACTCATAATTAGGAGAGAAACCCGA
 
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rJMSF030P06+ AAGATAGATAACATTAACACCATAACCGCCAAACCAAACTCTTGCCCATCTACCTACTTT
rJMSF049N09+ AAGATAGATAACATTAACACCATAACCGCCAAACCAAACTCTTGCCCATCTACCTACTTT
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consensus AAGATAGATAACATTAACACCATAACCGCCAAACCAAACTCTTGCCCATCTACCTACTTT
 
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rJMSF030P06+ CTCCTTAAATCGACTGTGCACTTTGCAGTTGGCTCCGAGTTCGACCACCTAAGTCTAAGC
rJMSF049N09+ CTCCTTAAATCGACTGTGCACTTTGCAGTTGGCTCCGAGTTCGACCACCTAAGTCTAAGC
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consensus CTCCTTAAATCGACTGTGCACTTTGCAGTTGGCTCCGAGTTCGACCACCTAAGTCTAAGC
 
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rJMSF030P06+ ACCGATCCAACTACTCTAACACTCATCAATGTCTATTAAGGACATCGATT
rJMSF049N09+ ACCGATCCAACTACTCTAACACTCATCAATGTCTATTAAGGACATCGATTGTACTAAATT
                      ____________________________________________________________
consensus ACCGATCCAACTACTCTAACACTCATCAATGTCTATTAAGGACATCGATTGTACTAAATT