Contig 004214: Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show
Alignment
This contig is upended
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rJMSF007L21+ GTGATGA
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consensus GTGATGA
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rJMSF007L21+ TAATCTTAAGCAAAAAGGCTACTTGGATGATGACACTTGTATATGGCAGGGCAATCCAGA
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consensus TAATCTTAAGCAAAAAGGCTACTTGGATGATGACACTTGTATATGGCAGGGCAATCCAGA
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rJMSF007L21+ TTTGTGTAAAATTTTCACATAAAATCTGCCGATTTGCAGCCATGGCTGGTGTCAAATGCT
rJMSF011P12+ TTTTCACATAAAATCTGCCGA-TTGCAGCCATGGCTGGTGTCAAATGCT
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consensus TTTGTGTAAAATTTTCACATAAAATCTGCCGATTTGCAGCCATGGCTGGTGTCAAATGCT
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rJMSF007L21+ TCAATGCCTTAATAGATACAGATTTGAGCCTCAATTTCTTTATGCTTTTTGGGGGGCCAA
rJMSF011P12+ TCAATGCCTTAATAGATACAGATTTGAGCCTCAATTTCTTTATGCTTTTTGGGGGGCCAA
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consensus TCAATGCCTTAATAGATACAGATTTGAGCCTCAATTTCTTTATGCTTTTTGGGGGGCCAA
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rJMSF007L21+ TTGTCTTTGTACATTTGTTTGTGCTTTGCATTTGCAGTGGAAATAATGGACTGGAGCTTT
rJMSF011P12+ TTGTCTTTGTACATTTGTTTGTGCTTTGCATTTGCAGTGGAAATAATGGACTGGAGCTTT
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consensus TTGTCTTTGTACATTTGTTTGTGCTTTGCATTTGCAGTGGAAATAATGGACTGGAGCTTT
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rJMSF007L21+ AAAATTCTTAATCTAGATCAACTTGATTTAGGTTGAACAAGTAAGCCATGCTTTGGTTTC
rJMSF011P12+ AAAATTCTTAATCTAGATCAACTTGATTTAGGTTGAACAAGTAAGCCATGCTTTGGTTTC
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consensus AAAATTCTTAATCTAGATCAACTTGATTTAGGTTGAACAAGTAAGCCATGCTTTGGTTTC
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rJMSF007L21+ TATTTGGGTTTATTCAATGGCCTCGGAGGCTGGTATTTAACACATTGATTTTGTTCCATA
rJMSF011P12+ TATTTGGGTTTATTCAATGGCCTCGGAGGCTGGTATTTAACACATTGATTTTGTTCCATA
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consensus TATTTGGGTTTATTCAATGGCCTCGGAGGCTGGTATTTAACACATTGATTTTGTTCCATA
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rJMSF007L21+ AGTTCCCTAGCAGGCTAGCACTACCATACATGGTGCCATGGTGGTCTTGTTGCTTCTGAG
rJMSF011P12+ AGTTCCCTAGCAGGCTAGCACTACCATACATGGTGCCATGGTGGTCTTGTTGCTTCTGAG
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consensus AGTTCCCTAGCAGGCTAGCACTACCATACATGGTGCCATGGTGGTCTTGTTGCTTCTGAG
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rJMSF007L21+ CAGCTGCAGTATCTTTTCAACTAACCTTCAGCTCGGAAGGCCAAACTCCATCTCTAAGAA
rJMSF011P12+ CAGCTGCAGTATCTTTTCAACTAACCTTCAGCTCGGAAGGCCAAACTCCATCTCTAAGAA
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consensus CAGCTGCAGTATCTTTTCAACTAACCTTCAGCTCGGAAGGCCAAACTCCATCTCTAAGAA
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rJMSF007L21+ GAGGAAAGCGAGACGGAAAAATGGTGCAGTGATGATAAGTCCTTTCAAGAAAAGTAATAA
rJMSF011P12+ GAGGAAAGCGAGACGGAAAAATGGTGCAGTGATGATAAGTCCTTTCAAGAAAAGTAATAA
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consensus GAGGAAAGCGAGACGGAAAAATGGTGCAGTGATGATAAGTCCTTTCAAGAAAAGTAATAA
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rJMSF007L21+ GGCGATGGAGGAAAAATAAACCTGGAACTTGGCTAATAGCTCCAATTTGTGTGTGGCTAA
rJMSF011P12+ GGCGATGGAGGAAAAATAAACCTGGAACTTGGCTAATAGCTCCAATTTGTGTGTGGCTAA
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rJMSF007L21+ TATGGAGTTTATTTTGGATATGGAGTTTGTTGTGAAGTTAGAGGAGCAGATCTTGAAGAT
rJMSF011P12+ TATGGAGTTTATTTTGGATATGGAGTTTGTTGTGAAGTTAGAGGAGCAGATCTTGAAGAT
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consensus TATGGAGTTTATTTTGGATATGGAGTTTGTTGTGAAGTTAGAGGAGCAGATCTTGAAGAT
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rJMSF007L21+ GATACTGTGAAGAACAGTGCAGAAAGCAATGTGTGCTAATGACCAACAGATTGTTGTTAT
rJMSF011P12+ GATACTGTGAAGAACAGTGCAGAAAGCAATGTGTGCTAATGACCAACAGATTGTTGTTAT
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consensus GATACTGTGAAGAACAGTGCAGAAAGCAATGTGTGCTAATGACCAACAGATTGTTGTTAT
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rJMSF007L21+ TTTGTACCCTAATTAAATCACTTGTGAATATT
rJMSF011P12+ TTTGTACCCTAATTAAATCACTTGTGAATATTTAGGTTGTCATTTATAAAACATTTAAGC
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consensus TTTGTACCCTAATTAAATCACTTGTGAATATTTAGGTTGTCATTTATAAAACATTTAAGC
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rJMSF011P12+ CAATTCTTATGAACCATTGCACCTTGTAGTTTGTGGGGGCATTCCATGTTTTGTGAAATT
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consensus CAATTCTTATGAACCATTGCACCTTGTAGTTTGTGGGGGCATTCCATGTTTTGTGAAATT