Contig 004007:  Sequence
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JMFF020O13-                           ACTCTTCCATCGTAATGCCATAAAGAAACCCTAATACCTAAACC
                      ____________________________________________________________
consensus                             ACTCTTCCATCGTAATGCCATAAAGAAACCCTAATACCTAAACC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF020O13-           CCTCCGGCCGTCTCTTAAAGCCCCACTTTCCAGGCGGAACCTTGGCCGGTCTTCTCTTTC
                      ____________________________________________________________
consensus             CCTCCGGCCGTCTCTTAAAGCCCCACTTTCCAGGCGGAACCTTGGCCGGTCTTCTCTTTC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF020O13-           GGATCCAGCCAAGATGTCGATGTCGAAAACTTCCAAGATGCTTCAATACATCAATTATCG
                      ____________________________________________________________
consensus             GGATCCAGCCAAGATGTCGATGTCGAAAACTTCCAAGATGCTTCAATACATCAATTATCG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF020O13-           GATTCGGGTCACGGTCCAGGACGGCCGTCAGTTGGTCGGAAAATTCATGGCTTTCGATCG
                      ____________________________________________________________
consensus             GATTCGGGTCACGGTCCAGGACGGCCGTCAGTTGGTCGGAAAATTCATGGCTTTCGATCG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF020O13-           CCACATGAACCTCGTTCTCGGAGATTGCGAGGAGTTCCGGAAGCTTCCACTGACTAAGGG
                      ____________________________________________________________
consensus             CCACATGAACCTCGTTCTCGGAGATTGCGAGGAGTTCCGGAAGCTTCCACTGACTAAGGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF020O13-           CTCGAAAGAAGAGCGCGAGGATCGCCGCACTCTCGGCCTTCTCCTCCTCCGTGGCGAAGA
                      ____________________________________________________________
consensus             CTCGAAAGAAGAGCGCGAGGATCGCCGCACTCTCGGCCTTCTCCTCCTCCGTGGCGAAGA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF020O13-           AGTTATCTCCATGACCGTTGAGGGTCCGCCTCCTCCCGATGAATCCCGCGTCAAGGCAAC
rJMFF020O13+                                                       CCGCGTCAAGGCAAN
                      ____________________________________________________________
consensus             AGTTATCTCCATGACCGTTGAGGGTCCGCCTCCTCCCGATGAATCCCGCGTCAAGGCAAC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF020O13-           TGGAGCTGCAAATGGCGTT-CCCGGGCCCGGTATTGGTCGTGGCGCTGGGAGAGGGGTTC
rJMFF020O13+          TGGAGCTGCAAATGGCGTTCCCCGGGCCCGGTATTGGTCGTGGCGCTGGGAGAGGGGTTC
                      ____________________________________________________________
consensus             TGGAGCTGCAAATGGCGTTCCCCGGGCCCGGTATTGGTCGTGGCGCTGGGAGAGGGGTTC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFF020O13-           C                                                           
rJMFF020O13+          NTACCGGGCCGTTGGTTCAGGCCCAGCCCGGACTTTNTGGTCCGGTTCGCGGTGTTGGTG
                      ____________________________________________________________
consensus             CTACCGGGCCGTTGGTTCAGGCCCAGCCCGGACTTTNTGGTCCGGTTCGCGGTGTTGGTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF020O13+          GGCCCGCTCCGGGAATGATGCAACCTCAGATCTCTCGTCCTCCGATAAACTACCCTCAGC
                      ____________________________________________________________
consensus             GGCCCGCTCCGGGAATGATGCAACCTCAGATCTCTCGTCCTCCGATAAACTACCCTCAGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF020O13+          AACCGCCTGTGATGAGGCCACCCGGTGGTGGACCGCCGGTGGCTCCTCCACCGCAGCCCT
                      ____________________________________________________________
consensus             AACCGCCTGTGATGAGGCCACCCGGTGGTGGACCGCCGGTGGCTCCTCCACCGCAGCCCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF020O13+          TGATGGCAGCGCCGCAGCAGTTCCGACCACTTCCTCCAGGGCAATTCCCGCCGCAGTTTG
                      ____________________________________________________________
consensus             TGATGGCAGCGCCGCAGCAGTTCCGACCACTTCCTCCAGGGCAATTCCCGCCGCAGTTTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF020O13+          GGCAGCGGCCTATGATGCCGCCTCCTCCTATGATGAGAGGTCCACCTCCTCCCGGAGCTC
                      ____________________________________________________________
consensus             GGCAGCGGCCTATGATGCCGCCTCCTCCTATGATGAGAGGTCCACCTCCTCCCGGAGCTC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF020O13+          CGCCGAGGCCCAATATGCCTGGTGGTGGCCCACCTGGACAGCCTCCTCGCCCTGGGATGC
                      ____________________________________________________________
consensus             CGCCGAGGCCCAATATGCCTGGTGGTGGCCCACCTGGACAGCCTCCTCGCCCTGGGATGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF020O13+          CGCCTCCACCTCCTGGTGGTCAATTTCCTGTCTTTGGACCTCCCCGTCCGGGAATGCCGC
                      ____________________________________________________________
consensus             CGCCTCCACCTCCTGGTGGTCAATTTCCTGTCTTTGGACCTCCCCGTCCGGGAATGCCGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF020O13+          CCCCACAGAATCAGTAGTTGTGGGATTCAGTATGTACAACCGAATCTTCTATCTTTATTG
                      ____________________________________________________________
consensus             CCCCACAGAATCAGTAGTTGTGGGATTCAGTATGTACAACCGAATCTTCTATCTTTATTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF020O13+          CTTCGAATTCTCCTGTTGATGTTTCTGTTGTATTTGTTTTATTGGTGATAATTAAACCTT
                      ____________________________________________________________
consensus             CTTCGAATTCTCCTGTTGATGTTTCTGTTGTATTTGTTTTATTGGTGATAATTAAACCTT