Contig 003614:  Sequence
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JMFS126F12+                                      CAGACTCACGATTCCTCCTCTCCATGTGGGTAA
JMFS090C06+                             CCATCAACTCAGACTCACGATTCCTCCTCTCCATTGTGGTAA
                      ____________________________________________________________
consensus                               CCATCAACTCAGACTCACGATTCCTCCTCTCCATTTTGGTAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS126F12+           TCATCTCTTGAGCATGCCTAGCAGCCCACCTACTCAATATCCGCGAATGGCACCTCCTGG
JMFS090C06+           TCATCTCTTGAGCATGCCTAGCAGCCCACCTACTCAATATCCGCGAATGGCACCTCCTGG
                      ____________________________________________________________
consensus             TCATCTCTTGAGCATGCCTAGCAGCCCACCTACTCAATATCCGCGAATGGCACCTCCTGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS126F12+           CTGCAGATGACTCTCCCACCTCACCCCCCGCTGCAGCAGACCTCCTCCTACTCACAAGCT
JMFS090C06+           CTGCAGATGACTCTCCCACCTCACCCCCCGCTGCAGCAGACCTCCTCCTACTCACAAGCT
                      ____________________________________________________________
consensus             CTGCAGATGACTCTCCCACCTCACCCCCCGCTGCAGCAGACCTCCTCCTACTCACAAGCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS126F12+           GGTCACTCTCGTCATCCTCATCCTCCGTATCCCTCACAGAGCTGCATGACGTAAACGACA
JMFS090C06+           GGTCACTCTCGTCATCCTCATCCTCCGTATCCCTCACAGAGCTGCATGACGTAAACGACA
                      ____________________________________________________________
consensus             GGTCACTCTCGTCATCCTCATCCTCCGTATCCCTCACAGAGCTGCATGACGTAAACGACA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS126F12+           TACAATCATCCAAATGTCCACGCATCAATTCCTCAAGCCCCCTCTCGAATTCAACACGAG
JMFS090C06+           TACAATCATCCAAATGTCCACGCATCAATTCCTCAAGCCCCCTCTCGAATTCAACACGAG
                      ____________________________________________________________
consensus             TACAATCATCCAAATGTCCACGCATCAATTCCTCAAGCCCCCTCTCGAATTCAACACGAG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS126F12+           CATCATCAGCCGTGCTCTCAGGCTTCTGCTGGAGCTGCTGCTGAACATCAGCCATTTCTT
JMFS090C06+           CATCATCAGCCGTGCTCTCAGGCTTCTGCTGGAGCTGCTGCTGAACATCAGCCATTTCTT
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                      ____________________________________________________________
consensus             CATCATCAGCCGTGCTCTCAGGCTTCTGCTGGAGCTGCTGCTGAACATCAGCCATTTCTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS126F12+           GAAGCCACTAACCCAGAACCTAACACCCACAGCACTGCCTAATCAAACAACCCTAAATTG
JMFS090C06+           CAAGCCACTAACCCAGAACCTAACACCCACAGCACTGCCTAATCAAACAACCCTAAATTG
JMSF014G17+           CAAGCCACTAACCCAGAACCTAACACCCACAGCACTGCCTAATCAAACAACCCTAAATTG
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consensus             CAAGCCACTAACCCAGAACCTAACACCCACAGCACTGCCTAATCAAACAACCCTAAATTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS126F12+           CAGAAGAAGGAAAGCACATTCACTAACAACTAAAATGGAGATTTTCCACACCTGACTCCA
JMFS090C06+           CAGAAGAAGGAAAGCACATTCCCTAACAACTAAAATGGAGATTTTCCACACCTGACTCCA
JMSF014G17+           CAGAAGAAGGAAAGCACATTCCCTAACAACTAAAATGGAGATTTTCCACACCTGACTCCA
                      ____________________________________________________________
consensus             CAGAAGAAGGAAAGCACATTCCCTAACAACTAAAATGGAGATTTTCCACACCTGACTCCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS126F12+           TTAATTCCAAACAGAAAAAGCAAAATCAAACCTAACTCTACCTCTAATCCCACTTTAACA
JMFS090C06+           TTAATTCCAAACAGAAAAAGCAAAATCAAACCTAACTCTACCTCTAATCCCACTTTAACA
JMSF014G17+           TTAATTCCAAACAGAAAAAGCAAAATCAAACCTAACTCTACCTCTAATCCCACTTTAACA
                      ____________________________________________________________
consensus             TTAATTCCAAACAGAAAAAGCAAAATCAAACCTAACTCTACCTCTAATCCCACTTTAACA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS126F12+           TCCCCAAATCTCGTATAATTACAACAATAGCAGCGCTTTTTCGATACAATTGTTTCACTC
JMFS090C06+           TCCCCAAATCTCGTATAATTACAACAATAGCAGCGCTTTTTCGATACAATTGTTTCACTC
JMSF014G17+           TCCCCAAATCTCGTATAATTACAACAATAGCAGCGCTTTTTCGATACAATTGTTTCACTC
                      ____________________________________________________________
consensus             TCCCCAAATCTCGTATAATTACAACAATAGCAGCGCTTTTTCGATACAATTGTTTCACTC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS126F12+           AATAGATACATATCACCTCTAAAGTGTAATCTC                           
JMFS090C06+           AATAGATACATATCACCTCTAAAGTGTAATCTC                           
JMSF014G17+           AATAGATACATATCACCTCTAAAGTGTAATCTCTGTCACCAAACTAACTATATATATGTA
                      ____________________________________________________________
consensus             AATAGATACATATCACCTCTAAAGTGTAATCTCTGTCACCAAACTAACTATATATATGTA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF014G17+           AATATGGGTTTTGTGTTTGTTTGTATATATATGGAAAGAGAAAAGTGGGCAAACTTGACT
                      ____________________________________________________________
consensus             AATATGGGTTTTGTGTTTGTTTGTATATATATGGAAAGAGAAAAGTGGGCAAACTTGACT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF014G17+           GGCAGACGGAAAGAGAAAAGGAGAGATGAAGAGACAGTAGGCGATGCCAATTTATGAGAC
                      ____________________________________________________________
consensus             GGCAGACGGAAAGAGAAAAGGAGAGATGAAGAGACAGTAGGCGATGCCAATTTATGAGAC