Contig 003430:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

Alignment

This contig is upended


                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS089C01+                                                              TCTCATCAC
                      ____________________________________________________________
consensus                                                                TCTCATCAC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS089C01+           CCGGCTCACACTAGGATCATCCAATATAGACAGCACCAGCTGCTCCACCTCCACCTTAAT
JMFS089C08+                                   TATAGACAGCACCAGCTGCTCCACCTCCACCTTAAT
                      ____________________________________________________________
consensus             CCGGCTCACACTAGGATCATCCAATATAGACAGCACCAGCTGCTCCACCTCCACCTTAAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS089C01+           AACCCAATGCGGCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTCGATACACCCCCGCCGCTGGTGCGC
JMFS089C08+           AACCCAATGCGGCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTCGATACACCCCCGCCGCTGGTGCGC
                      ____________________________________________________________
consensus             AACCCAATGCGGCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTCGATACACCCCCGCCGCTGGTGCGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS089C01+           CTGGGCCCGCTTGAGGGCCGCCACGAGAGCGTTAGACAACGACGGCTGGCCGTGGAGGAG
JMFS089C08+           CTGGGCCCGCTTGAGGGCCGCCACGAGAGCGTTAGACAACGACGGCTGGCCGTGGAGGAG
                      ____________________________________________________________
consensus             CTGGGCCCGCTTGAGGGCCGCCACGAGAGCGTTAGACAACGACGGCTGGCCGTGGAGGAG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS089C01+           CGGCGCCGGGGAGGCCGGAAGCCGGTTGAGGGCCACATTAAAGCAGAGCTCTAGAGCCCG
JMFS089C08+           CGGCGCCGGGGAGGCCGGAAGCCGGTTGAGGGCCACATTAAAGCAGAGCTCTAGAGCCCG
                      ____________________________________________________________
consensus             CGGCGCCGGGGAGGCCGGAAGCCGGTTGAGGGCCACATTAAAGCAGAGCTCTAGAGCCCG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS089C01+           GCACTGAAGCGGATGCGATGAGGAAGAAGAGTTAACAATGGAGGAGGGCTGGGATTTGAG
JMFS089C08+           GCACTGAAGCGGATGCGATGAGGAAGAAGAGTTAACAATGGAGGAGGGCTGGGATTTGAG
                      ____________________________________________________________
consensus             GCACTGAAGCGGATGCGATGAGGAAGAAGAGTTAACAATGGAGGAGGGCTGGGATTTGAG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS089C01+           GCAAGCCCGTTTGAGAAGACTGAATCTAGAGCTCAAAAGGGTGGCCGCCACGTGGAGGGG
JMFS089C08+           GCAAGCCCGTTTGAGAAGACTGAATCTAGAGCTCAAAAGGGTGGCCGCCACGTGGAGGGG
                      ____________________________________________________________
consensus             GCAAGCCCGTTTGAGAAGACTGAATCTAGAGCTCAAAAGGGTGGCCGCCACGTGGAGGGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS089C01+           GGTGATTTGTGCATGGCCCCGTCTCCTCGCTAAGCTTAGAGAGTGCTTCAGCACTGAAGC
JMFS089C08+           GGTGATTTGTGCATGGCCCCGTCTCCTCGCTAAGCTTAGAGAGTGCTTCAGCACTGAAGC
                      ____________________________________________________________
consensus             GGTGATTTGTGCATGGCCCCGTCTCCTCGCTAAGCTTAGAGAGTGCTTCAGCACTGAAGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS089C01+           AGCCTCTGTGGTGAGGGTCTGTTGCACCGCCGCGCAAGCTCCCGTTCGCATAACTTAGCC
JMFS089C08+           AGCCTCTGTGGTGAGGGTCTGTTGCACCGCCGCGCAAGCTCCCGTTCGCATAACTTAGCC
                      ____________________________________________________________
consensus             AGCCTCTGTGGTGAGGGTCTGTTGCACCGCCGCGCAAGCTCCCGTTCGCATAACTTAGCC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS089C01+           CCACGCCCCACCTCCCAACACCCCCCCGCTCTGAATCGCTACTGTAACCTATCTTTCTCC
JMFS089C08+           CCACGCCCCACCTCCCAACACCCCCCCGCTCTGAATCGCTACTGTAACCTATCTTTCTCC
                      ____________________________________________________________
consensus             CCACGCCCCACCTCCCAACACCCCCCCGCTCTGAATCGCTACTGTAACCTATCTTTCTCC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS089C01+           GATCTTCTGTGTCTTTATACAATTCTATGAACCTCACAACCACCCAAAGCCCACGCTGCT
JMFS089C08+           GATCTTCTGTGTCTTTATACAATTCTATGAACCTCACAACCACCCAAAGCCCACGCTGCT
                      ____________________________________________________________
consensus             GATCTTCTGTGTCTTTATACAATTCTATGAACCTCACAACCACCCAAAGCCCACGCTGCT