Contig 001527:  Sequence
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clone5'-sequence3'-sequence
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Alignment

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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMCP007B10+          GtGgtgtaTTTTGTATaacTCAAAAAATTGTTAATTTAACTTG-TTTTTTTTTTTAAAAA
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
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JMCP017F05+           GGAACCAAACTCGCCACTTCTTAAGGACTAAAAATAGATACACTAATAACGCATGAACTG
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMCP007B10+          AATCGAatcATcgGGTAATAtacCtacctgacttagcTCAgTtgctTatctTagcCTACT
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rJMCP007B10+          TTTCCAAAATAAAAAT                                            
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