Contig 001520: Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show
Alignment
This contig is upended
. : . : . : . : . : . :
JMCP018G02+ GTAATCTTGAACGTTTAAGCAGGATCAATGGCTTAGA
rJMCP018F06+ GTAATCTTGAACGTTTAAGCAGGATCAATGGCTTAGA
rJMCP018G05+ CGGTAATCTTGAACGTTTAAGCAGGATCAATGGCTTAGA
rJMCP004E11+ GTAATCTTGAACGTTTAAGCAGGATCAATGGCTTAGA
rJMCP004E04+ TAATCTTGAACGTTTAAGCAGGATCAATGGCTTAGA
rJMCP006G07+ GTAATCTTGAACGTTTAAGCAGGATCAATGGCTTAGA
rJMCP012D10+ GTAATCTTGAACGTTTAAGCAGGATCAATGGCTTAGA
rJMCP011H03+ GTAATCTTGAACGTTTAAGCAGGATCAATGGCTTAGA
rJMCP004A10+ GTAATCTTGAACGTTTAAGCAGGATCAtacGCTTAGA
JMCP008E08+ AATCTTGAACGTTTAAGCAGGATCAATGGCTTAGA
____________________________________________________________
consensus CGGTAATCTTGAACGTTTAAGCAGGATCAATGGCTTAGA
. : . : . : . : . : . :
JMCP018G02+ TTTAATCTCACAACCGCATCTGGGTTGCCAATCACATTTAATTCGCGTTCGCACACACTT
rJMCP018F06+ TTTAATCTCACAACCGCATCTGGGTTGCCAATCACATTTAATTCGCGTTCGCACACACTT
rJMCP018G05+ TTTAATCTCACAACCGCATCTGGGTTGCCAATCACATTTAATTCGCGTTCGCACACACTT
rJMCP004E11+ TTTAATCTCACAACCGCATCTGGGTTGCCAATCACATTTAATTCGCGTTCGCACACACTT
rJMCP004E04+ TTTAATCTCACAACCGCATCTGGGTTGCCAATCACATTTAATTCGCGTTCGCACACACTT
rJMCP006G07+ TTTAATCTCACAACCGCATCTGGGTTGCCAATCACATTTAATagcCGTTCGCACACACTT
rJMCP012D10+ TTTAATCTCACAACCGCATCTGGGTTGCCAATCACATTTAATTCGCGTTCGCACACACTT
rJMCP011H03+ TTTAATCTCACAACCGCATCTGGGTTGCCAATCACATTTAATTCGCGTTCGCACACACTT
rJMCP004A10+ TTTAATCTCACAACCGCAagTGGGTTGCCAATCACATTTAATTCGCGTTCGCACACACTT
JMCP008E08+ TTTAATCTCACAACCGCATCTGGGTTGCCAATCACATTTAATTCGCGTTCGCACACACTT
____________________________________________________________
consensus TTTAATCTCACAACCGCATCTGGGTTGCCAATCACATTTAATTCGCGTTCGCACACACTT
. : . : . : . : . : . :
JMCP018G02+ AATTTAATCTAGACCATTAAAAATATTAAATGAATGCACACAATTTGATCTCACGTTCTC
rJMCP018F06+ AATTTAATCTAGACCATTAAAAATATTAAATGAATGCACACAATTTGATCTCACGTTCTC
rJMCP018G05+ AATTTAATCTAGACCATTAAAAATATTAAATGAATGCACACAATTTGATCTCACGTTCTC
rJMCP004E11+ AATTTAATCTAGACCATTAAAAATATTAAATGAATGCACACAATTTGATCTCACGTTCTC
rJMCP004E04+ AATTTAATCTAGACCATTAAAAATATTAAATGAATGCACACAATTTGATCTCACGTTCTC
rJMCP006G07+ AATTTAATCTAGACCATTAAAAATATTAAATGAATGCACACAATTTGATCTCACGTTCTC
rJMCP012D10+ AATTTAATCTAGACCATTAAAAtat-atttactgagggggggtaaaGATCTCACGTTCTC
rJMCP011H03+ AATTTAATCTAGACCATTAAAAATATTAAATGAATGCACACAATTTGATCTCACGTTCTC
rJMCP004A10+ AATTTAATCTAGACCATTAAAAATATTAAtTGAATGCACAgttTTTGATCTCACGTTCTC
JMCP008E08+ AATTTAATCTAGACCATTAAAAATATTAAATGAATGCACACAATTTGATCTCACGTTCTC
____________________________________________________________
consensus AATTTAATCTAGACCATTAAAAATATTAAATGAATGCACACAATTTGATCTCACGTTCTC
. : . : . : . : . : . :
JMCP018G02+ ATTAACAAGAGTTCAATAGTCATAGGACAAAAAGTGAAATTAAATCTTATCAAATATGTA
rJMCP018F06+ ATTAACAAGAGTTCAATAGTCATAGGACAAAAAGTGAAATTAAATCTTATCAAATATGTA
rJMCP018G05+ ATTAACAAGAGTTCAATAGTCATAGGACAAAAAGTGAAATTAAATCTTATCAAATATGTA
rJMCP004E11+ ATTAACAAGAGTTCAATAGTCATAGGACAAAAAGTGAAATTAAATCTTATCAAATATGTA
rJMCP004E04+ ATTAACAAGAGTTCAATAGTCATAGGACAAAAAGTGAAATTAAATCTTATCAAATATGTA
rJMCP006G07+ ATTAACAAGAGTTCAATAGTCATAGGACAAAAAGTGAAATTAAATCTTATCAAATATGTA
rJMCP012D10+ ATTAACAAGTGTTCAATAGTCATAGGACAAAAAGTGAAATTAAATCTTATCAAATATGTA
rJMCP011H03+ ATTAACAAGTGTTCAATAGTCATAGGACAAAAAGTGAAATTAAATCTTATCAAATATGTA
rJMCP004A10+ ATTAAgttGTGTTCAATAGTCATAGGAgttAAtGTGtttTTAAATCTatagtAATATGTA
JMCP008E08+ ATTAACAAGAGTTCAATAGTCATAGGACAAAAAGTGAAATTAAATCTTATCAAATATGTA
____________________________________________________________
consensus ATTAACAAGAGTTCAATAGTCATAGGACAAAAAGTGAAATTAAATCTTATCAAATATGTA
. : . : . : . : . : . :
JMCP018G02+ ATGCATGAAAAATATGACATCTACGGAGTATTTGAAAATGAGAGGTAAAAATTAAATGAA
rJMCP018F06+ ATGCATGAAAAATATGACATCTACGGAGTATTTGAAAATGAGAGGTAAAAAT
rJMCP018G05+ ATGCATGAAAAATATGACATCTACGGAGTATTTGAAAATGAGAGGTAAAAATTAAATGAA
rJMCP004E11+ ATGCATGAAAAATATGACAaCTACGGAGTATTTGAAAATGAGAGGTAAAAtTTAAATGAA
rJMCP004E04+ ATGCATGAAAAATATGACATCTACGGAGTATTTGAAAATGAGAGGTAAAAATTAAATGAA
rJMCP006G07+ ATGCATGAAAAATATGACATCTACGGAGTATTTGAAAATGAGAGGTAAAAATTAAATGAA
rJMCP012D10+ ATGCATGAAAAATATGACATCTACGGAGTATaTGAAAATGAGAGGTAAAtta
rJMCP011H03+ ATGCATGAAAAATAT
rJMCP004A10+ ATGCATGAAAAATATGAgtagaACGGAGTATTTcttAtTGAGAGGTAAtttTTAAATGAA
JMCP008E08+ ATGCATGAAAAATATGACATCTACGGAGTATTTGAAAATGAGAGGTAAAAATTAAATGAA
____________________________________________________________
consensus ATGCATGAAAAATATGACATCTACGGAGTATTTGAAAATGAGAGGTAAAAATTAAATGAA