Contig 000529:  Sequence
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS160B07+                                                                  TGGCC
                      ____________________________________________________________
consensus                                                                    TGGCC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS160B07+           AGCCTACCTGTTAAGGAATCAAGAAGGGTGGATTGCCAGAGCCAGAAGGACCCATAATGG
                      ____________________________________________________________
consensus             AGCCTACCTGTTAAGGAATCAAGAAGGGTGGATTGCCAGAGCCAGAAGGACCCATAATGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS160B07+           CCATAATCNTACCAGGTTCAGCATACCCACTGATCCCTTGAAGCAGCTTCTTGGTTGGGC
                      ____________________________________________________________
consensus             CCATAATCNTACCAGGTTCAGCATACCCACTGATCCCTTGAAGCAGCTTCTTGGTTGGGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS160B07+           CTTGTCCAAAATTTGGAAGCACCACTGTTAAGTCTTCCCACACCAAGTAAGCCACCCCCT
                      ____________________________________________________________
consensus             CTTGTCCAAAATTTGGAAGCACCACTGTTAAGTCTTCCCACACCAAGTAAGCCACCCCCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS139A09+                                 AATATCCCCTCCTCTACCACCCCCACCACCCGCCGCCT
JMFS160B07+           GCNTATGCACCACCCCTCTCTCAATATCCCCTCCTCTACCACCCCCACCACCCGCCGCCT
                      ____________________________________________________________
consensus             GCNTATGCACCACCCCTCTCTCAATATCCCCTCCTCTACCACCCCCACCACCCGCCGCCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS139A09+           CTATCTCCATGACCCCCCCTATGCAAAGCTCAAATCTTTAAGCAACCCAACCACCAATGC
JMFS160B07+           CTATCTCCATGACCCCCCCTATGCAAAGCTCAAATCTTTAAGCAACCCAACCACCAATGC
                      ____________________________________________________________
consensus             CTATCTCCATGACCCCCCCTATGCAAAGCTCAAATCTTTAAGCAACCCAACCACCAATGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS139A09+           CCCTCCAATCTTGATGATGAACACTGCCCAGTTGTATATCACACCTTTGTAGCCCTCAAA
JMFS160B07+           CCCTCCAATCTTGATGATGAACACTGCCCAGTTGTATATCACACCTTTGTAGCCCTCAAA
                      ____________________________________________________________
consensus             CCCTCCAATCTTGATGATGAACACTGCCCAGTTGTATATCACACCTTTGTAGCCCTCAAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS139A09+           AATCAGCAAAAATCCAAAAAGCTCAAGTCTTGCATCTCTGGGTATACATACACATACTCA
JMFS160B07+           AATCAGCAAAAATCCAAAAAGCTCAAGTCTTGCATCTCTGGGTATACATACACATACTCA
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consensus             AATCAGCAAAAATCCAAAAAGCTCAAGTCTTGCATCTCTGGGTATACATACACATACTCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS139A09+           TACACACCAAATATAAGAACATAAAGAGATATGGGGCAAGGTT                 
JMFS160B07+           TACACACCAAATATAAGAACATAAAGAGATATGGGGCAAGGTTTATGGCAATGGGGGATA
                      ____________________________________________________________
consensus             TACACACCAAATATAAGAACATAAAGAGATATGGGGCAAGGTTTATGGCAATGGGGGATA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS160B07+           TGAGTGGAAAGTGATGGGGGGTGGGGAGACTTTAATGTGGGGATGGTGGTGTGTACAGTT
                      ____________________________________________________________
consensus             TGAGTGGAAAGTGATGGGGGGTGGGGAGACTTTAATGTGGGGATGGTGGTGTGTACAGTT