Contig 000409:  Sequence
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS034F07+                                                    GCATCAACATCAATAGGTG
                      ____________________________________________________________
consensus                                                      GCATCAACATCAATAGGTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS032F04+                                          CTCCCATATGCAACTACCGACATGCAGCG
JMFS034F07+           GCCTTATGCCCACCCAGGCTTCTGTCCCTTGCTCCCATATGCAACTACCGACATGCAGCG
                      ____________________________________________________________
consensus             GCCTTATGCCCACCCAGGCTTCTGTCCCTTGCTCCCATATGCAACTACCGACATGCAGCG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS032F04+           GTAGCCCTGTCTGATAGCCATCATAATTACCGTCTAGAAAGCAAGTCACTTCACCTAAAT
JMFS034F07+           GTAGCCCTGTCTGATAGCCATCATAATTACCGTCTAGAAAGCAAGTCACTTCACCTAAAT
                      ____________________________________________________________
consensus             GTAGCCCTGTCTGATAGCCATCATAATTACCGTCTAGAAAGCAAGTCACTTCACCTAAAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS032F04+           CAGCATCTACAGTCATTGTAACGATATGCCACCTCCCATCAGCAATATTACTGGCACCTA
JMFS034F07+           CAGCATCTACAGTCATTGTAACGATATGCCACCTCCCATCAGCAATATTACTGGCACCTA
                      ____________________________________________________________
consensus             CAGCATCTACAGTCATTGTAACGATATGCCACCTCCCATCAGCAATATTACTGGCACCTA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS032F04+           TACTCCACTCCTTTGAAACTGTTGTTTGTCTATCACCCTTGGTAATTAATCTAAGCCCAA
JMFS034F07+           TACTCCACTCCTTTGAAACTGTTGTTTGTCTATCACCCTTGGTAATTAATCTAAGCCCAA
                      ____________________________________________________________
consensus             TACTCCACTCCTTTGAAACTGTTGTTTGTCTATCACCCTTGGTAATTAATCTAAGCCCAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS032F04+           CTTGTCCAGCTTCAATGCCTTGCTCGGATCCAGCAACAAGAAACTCCCAACATATTTTCT
JMFS034F07+           CTTGTCCAGCTTCAATGCCTTGCTCGGATCCAGCAACAAGAAACTCCCAACATATTTTCT
                      ____________________________________________________________
consensus             CTTGTCCAGCTTCAATGCCTTGCTCGGATCCAGCAACAAGAAACTCCCAACATATTTTCT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS032F04+           TCTGTAATTCAGAACCCAATAGACAAACTGGTCCAGACTCCAGCTGCACCATAACGGCAA
JMFS034F07+           TCTGTAATTCAGAACCCAATAGACAAACTGGTCCAGACTCCAGCTGCACCATAACGGCAA
                      ____________________________________________________________
consensus             TCTGTAATTCAGAACCCAATAGACAAACTGGTCCAGACTCCAGCTGCACCATAACGGCAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS032F04+           TAGAAATGCTAATTTTTTGACTGTGACAGACACTGAGATCAATAGGGCCACAGTGCCTGC
JMFS034F07+           TAGAAATGCTAATTTTTTGACTGTGACAGACACTGAGATCAATAGGGCCACAGTGCCTGC
                      ____________________________________________________________
consensus             TAGAAATGCTAATTTTTTGACTGTGACAGACACTGAGATCAATAGGGCCACAGTGCCTGC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS032F04+           CACTGCTAGTTGGTTCATCATCAAGAATACATACAGCACCA                   
JMFS034F07+           CACTGCTAGTTGGTTCATCATCAAGAATACATACAGCACCACTAAGTCCAGTCTGTAGTG
                      ____________________________________________________________
consensus             CACTGCTAGTTGGTTCATCATCAAGAATACATACAGCACCACTAAGTCCAGTCTGTAGTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMFS034F07+           CTCGACGAGATAACTGAGCTGCACGTATACGACGTGCGATGCTTAAACTCTCTCACGAGC
                      ____________________________________________________________
consensus             CTCGACGAGATAACTGAGCTGCACGTATACGACGTGCGATGCTTAAACTCTCTCACGAGC