Contig 000366:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

clone5'-sequence3'-sequence
Seq.lengthcontigBestHitEvaluedescriptionlengthcontigBestHitEvaluedescription
JMFN019E05Sequence627000366 (2)ref|XP_009798951.1|4e-10PREDICTED: vegetative cell wall protein gp1-like [Nicotiana sylvestris]
JMFN043O09Sequence633000366 (2)

Alignment

This contig is upended


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JMFN019E05+ ACGGGGGAGACTACTCGGGGGGTATCTTTGATT
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consensus ACGGGGGAGACTACTCGGGGGGTATCTTTGATT
 
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JMFN019E05+ GTGGGTTATGGAGCGCAAAAGGCCCTCGCTTTATTGCGGAAGTTAGGGTCACTGAACTTT
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consensus GTGGGTTATGGAGCGCAAAAGGCCCTCGCTTTATTGCGGAAGTTAGGGTCACTGAACTTT
 
. : . : . : . : . : . :
JMFN019E05+ TTGAAAGCTTTGTGAAAGCATTCATCTGAAAGTTGTAAAATGATCTTGCAACAGTCTCTT
JMFN043O09+ GAAAGTTGTAAAATGATCTGCAACCAGTCTCTT
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consensus TTGAAAGCTTTGTGAAAGCATTCATCTGAAAGTTGTAAAATGATCTTGCACCAGTCTCTT
 
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JMFN019E05+ TTTATGAGGATTTGATTCCCAGAAGCAGACTGTTTCAGGTCTTCTACGCATACGTCGTCT
JMFN043O09+ TTTATGAGGATTTGATTCCCAGAAGCAGACTGTTTCAGGTCTTCTACGCATACGTCGTCT
                      ____________________________________________________________
consensus TTTATGAGGATTTGATTCCCAGAAGCAGACTGTTTCAGGTCTTCTACGCATACGTCGTCT
 
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JMFN019E05+ CCCTTTACCAGTGCCATCGAGCAGTCACTTGTTTGGTTTGTAGAGACGGGCGGCGGTATT
JMFN043O09+ CCCTTTACCAGTGCCATCGAGCAGTCACTTGTTTGGTTTGTAGAGACGGGCGGCGGTATT
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consensus CCCTTTACCAGTGCCATCGAGCAGTCACTTGTTTGGTTTGTAGAGACGGGCGGCGGTATT
 
. : . : . : . : . : . :
JMFN019E05+ GGAGGCTCGCTATTCCCTGGAGGTGGTGATGCCGGCAGCGATGGCTTTAGTGGGCTGTCT
JMFN043O09+ GGAGGCTCGCTATTCCCTGGAGGTGGTGATGCCGGCAGCGATGGCTTTAGTGGGCTGTCT
                      ____________________________________________________________
consensus GGAGGCTCGCTATTCCCTGGAGGTGGTGATGCCGGCAGCGATGGCTTTAGTGGGCTGTCT
 
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JMFN019E05+ TCAACTGCTGCCGATGGTGACGGTGGCAGTATCGGCAGCGATGGCTTTAGTGGGCTGTCT
JMFN043O09+ TCAACTGCTGCCGATGGTGACGGTGGCAGTATCGGCAGCGATGGCTTTAGTGGGCTGTCT
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consensus TCAACTGCTGCCGATGGTGACGGTGGCAGTATCGGCAGCGATGGCTTTAGTGGGCTGTCT
 
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JMFN019E05+ TCAACTGCTGCCGATGGTGACGGTGGCAGTATCGGCTTTACAGTAATGGTTTCCGTTGGA
JMFN043O09+ TCAACTGCTGCCGATGGTGACGGTGGCAGTATCGGCTTTACAGTAATGGTTTCCGTTGGA
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consensus TCAACTGCTGCCGATGGTGACGGTGGCAGTATCGGCTTTACAGTAATGGTTTCCGTTGGA
 
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JMFN019E05+ GGTGGATGGCTATGGGGTTGGCGAAGGCGGTACTGGTTGCTAGTATGTTTGTGGTTCCTG
JMFN043O09+ GGTGGGTGGCTATGGGGTTGGCGAAGGCGGTACTGGTTGCTAGTATGTTTGTGGTTCCTG
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consensus GGTGGGTGGCTATGGGGTTGGCGAAGGCGGTACTGGTTGCTAGTATGTTTGTGGTTCCTG
 
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JMFN019E05+ GTTGCGGAGCGCAGTGGTGGATGCCGGTGGCGGTGGTTCCTGGTTGCGGAGGGTAGCGGT
JMFN043O09+ GTTGCGGAGCGCAGTGGTGGATGCCGGTGGCGGTGGTTCCTGGTTGCGGAGGGTAGCGGT
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consensus GTTGCGGAGCGCAGTGGTGGATGCCGGTGGCGGTGGTTCCTGGTTGCGGAGGGTAGCGGT
 
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JMFN019E05+ GGTATTGACGGTGGATGCTGGTGGTTCCTGGGTGCGGAACGCAGCCGTGGATGC
JMFN043O09+ GGTATTGACGGTGGATGCTGGTGGTTCCTGGGTGCGGAACGCAGCCGTGGATGCCCGTGG
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consensus GGTATTGACGGTGGATGCTGGTGGTTCCTGGGTGCGGAACGCAGCCGTGGATGCCCGTGG
 
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JMFN043O09+ TTCCTGGTTGCGGAGCGCAGCCGTGGATGCCCGTGGTTCCTGGTTGTGGAGCGCAGCCGT
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consensus TTCCTGGTTGCGGAGCGCAGCCGTGGATGCCCGTGGTTCCTGGTTGTGGAGCGCAGCCGT
 
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JMFN043O09+ GGATGCTGGTGATTCTTGGTGGCGGAGCTCAGCCGTGGATGCCGGTGGTTCCTGGTTGCG
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consensus GGATGCTGGTGATTCTTGGTGGCGGAGCTCAGCCGTGGATGCCGGTGGTTCCTGGTTGCG