Alignment Contig 8810

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMFF031F22+ AGAATAAAGCGCCAAAGAATAAGGCGCTTTAATTTGTGGGTGGCGGACTGGCCGTGGACG
JMFF048P10+ AGAATAAAGCGCCAAAGAATAAGGCGCTTTAATTTGTGGGTGGCGGACTGGCCGTGGACG
JMFS079H10+ CCAAAGAATAAGGCGCTTTAATTTGTGGGTGGCGGACTGGCCGTGGACG
JMFS040F01+ TGGCCGTGGACG
JMSF021F22+ GGTGGCGGACTGGCCGTGGACG
____________________________________________________________
consensus AGAATAAAGCGCCAAAGAATAAGGCGCTTTAATTTGTGGGTGGCGGACTGGCCGTGGACG

. : . : . : . : . : . :
JMFF031F22+ GTGGTGGTGGGCAATGGGTTTGAACCTTGTAATGTGGAATGTGTTGGTGGTAGGGGTGGT
JMFF048P10+ GTGGTGGTGGGCAATGGGTTTGAACCTTGTAATGTGGAATGTGTTGGTGGTAGGGGTGGT
JMFS079H10+ GTGGTGGTGGGCAATGGGTTTGAACCTTGTAATGTGGAATGTGTTGGTGGTAGGGGTGGT
JMFS040F01+ GTGGTCGTGGGCAATGGGTTTGAACCTTGTAATGTGGAATGTGTTGGTGGTAGGGGTGGT
JMSF021F22+ GTGGTGGTGGGCAATGGGTTTGAACCTTGTAATGTGGAATGTGTTGGTGGTAGGGGTGGT
____________________________________________________________
consensus GTGGTGGTGGGCAATGGGTTTGAACCTTGTAATGTGGAATGTGTTGGTGGTAGGGGTGGT

. : . : . : . : . : . :
JMFF031F22+ GTTACTGGGCACCTGGTTTTCTTCTGTAAATGCTTCAGTATCCTATGATAAGAATGCTTT
JMFF048P10+ GTTACTGGGCACCTGGTTTTCTTCTGTAAATGCTTCAGTATCCTATGATAAGAATGCTTT
JMFS079H10+ GTTACTGGGCACCTGGTTTTCTTCTGTAAATGCTTCAGTATCCTATGATAAGAATGCTTT
JMFF033M24+ AATGCTTCAGTATCCTATGATAAGAATGCTTT
JMFS072F04+ AATGCTTCAGTATCCTATGATAAGAATGCTTT
JMFF018H13+ AATGCTTCAGTATCCTATGATAAGAATGCTTT
JMFS040F01+ GTTACTGGGCACCTGGTTTTCTTCTGTAAATGCTTCAGTATCCTATGATAAGAATGCTTT
JMSF021F22+ GTTACTGGGCACCTGGTTTTCTTCTGTAAATGCTTCAGTATCCTATGATAAGAATGCTTT
____________________________________________________________
consensus GTTACTGGGCACCTGGTTTTCTTCTGTAAATGCTTCAGTATCCTATGATAAGAATGCTTT

. : . : . : . : . : . :
JMFF031F22+ CATCATCAATGGCCACAGAAAGATCCTTATTTCTGGATCCATTCACTACCCCAGAAGCAC
JMFF048P10+ CATCATCAATGGCCACAGAAAGATCCTTATTTCTGGATCCATTCACTACCCCAGAAGCAC
JMFS079H10+ CATCATCAATGGCCACAGAAAGATCCTTATTTCTGGATCCATTCACTACCCCAGAAGCAC
JMFF033M24+ CATCATCAATGGCCACAGAAAGATCCTTATTTCTGGATCCATTCACTACCCCAGAAGCAC
JMFS072F04+ CATCATCAATGGCCACAGAAAGATCCTTATTTCTGGATCCATTCACTACCCCAGAAGCAC
JMFF018H13+ CATCATCAATGGCCACAGAAAGATCCTTATTTCTGGATCCATTCACTACCCCAGAAGCAC
JMFS040F01+ CATCATCAATGGCCACAGAAAGATCCTTATTTCTGGATCCATTCACTACCCCAGAAGCAC
JMSF021F22+ CATCATCAATGGCCACAGAAAGATCCTTATTTCTGGATCCATTCACTACCCCAGAAGCAC
____________________________________________________________
consensus CATCATCAATGGCCACAGAAAGATCCTTATTTCTGGATCCATTCACTACCCCAGAAGCAC

. : . : . : . : . : . :
JMFF031F22+ ACCTGAGATGTGGCCAGATCTTCTGCAGAAAGCTAAGGAAGGAGGATTGGATGTGATCCA
JMFF048P10+ ACCTGAGATGTGGCCAGATCTTCTGCAGAAAGCTAAGGAAGGAGGATTGGATGTGATCCA
JMFS079H10+ ACCTGAGATGTGGCCAGATCTTCTGCAGAAAGCTAAGGAAGGAGGATTGGATGTGATCCA
JMFF033M24+ ACCTGAGATGTGGCCAGATCTTCTGCAGAAAGCTAAGGAAGGAGGATTGGATGTGATCCA
JMFS072F04+ ACCTGAGATGTGGCCAGATCTTCTGCAGAAAGCTAAGGAAGGAGGATTGGATGTGATCCA
JMFF018H13+ ACCTGAGATGTGGCCAGATCTTCTGCAGAAAGCTAAGGAAGGAGGATTGGATGTGATCCA
JMFS040F01+ ACCTGAGATGTGGCCAGATCTTCTGCAGAAAGCTAAGGAAGGAGGATTGGATGTGATCCA
JMSF021F22+ ACCTGAGATGTGGCCAGATCTTCTGCAGAAAGCTAAGGAAGGAGGATTGGATGTGATCCA
____________________________________________________________
consensus ACCTGAGATGTGGCCAGATCTTCTGCAGAAAGCTAAGGAAGGAGGATTGGATGTGATCCA

. : . : . : . : . : . :
JMFF031F22+ GACTTATATTTTCTGGAATGGGCATGAGCCTCAACCTGGGAAATATTATTTTGAGGACAG
JMFF048P10+ GACTTATATTTTCTGGAATGGGCATGAGCCTCAACCTGGGAAATATTATTTTGAGGACAG
JMFS079H10+ GACTTATATTTTCTGGAATGGGCATGAGCCTCAACCTGGGAAATATTATTTTGAGGACAG
JMFF033M24+ NACTTATATTTTCTGGAATGGGCATGAGCCTCAACCTGGGAAATATTATTTTGAGGACAG
JMFS072F04+ GACTTATATTTTCTGGAATGGGCATGAGCCTCAACCTGGGAAATATTATTTTGAGGACAG
JMFF018H13+ GACTTATATTTTCTGGAATGGGCATGAGCCTCAACCTGGGAAATATTATTTTGAGGACAG
JMFS040F01+ GACTTATATTTTCTGGAATGGGCATGAGCCTCAACCTGGGAAATATTATTTTGAGGACAG
JMSF021F22+ GACTTATATTTTCTGGAATGGGCATGAGCCTCAACCTGGGAAATATTATTTTGAGGACAG
____________________________________________________________
consensus GACTTATATTTTCTGGAATGGGCATGAGCCTCAACCTGGGAAATATTATTTTGAGGACAG

. : . : . : . : . : . :
JMFF031F22+ GTATGATGTTGTGAAGTTCATTAAGCTGGCACAGCAAGCTGGACTTTATGTTCATCTCAG
JMFF048P10+ GTATGATGTTGTGAAGTTCATTAAGCTGGCACAGCAAGCTGGACTTTATGTTCATCTCAG
JMFS079H10+ GTATGATGTTGTGAAGTTCATTAAGCTGGCACAGCAAGCTGGACTTTATGTTCATCTCAG
JMFF033M24+ GTATGATGTTGTGAAGTTCATTAAGCTGGCACAGCAAGCTGGACTTTATGTTCATCTCAN
JMFS072F04+ GTATGATGTTGTGAAGTTCATTAAGCTGGCACAGCAAGCTGGACTTTATGTTCATCTCAG
JMFF018H13+ GTATGATGTTGTGAAGTTCATTAAGCTGGCACAGCAAGCTGGACTTTATGTTCATCTCAG
JMFS040F01+ GTATGATGTTGTGAAGTTCATTAAGCTGGCACAGCAAGCTGGACTTTATGTTCATCTCAG
JMSF021F22+ GTATGATGTTGTGAAGTTCATTAAGCTGGCACAGCAAGCTGGACTTTATGTTCATCTCAG
____________________________________________________________
consensus GTATGATGTTGTGAAGTTCATTAAGCTGGCACAGCAAGCTGGACTTTATGTTCATCTCAG

. : . : . : . : . : . :
JMFF031F22+ GATTGGGCCTTATGCTTGTGGGGAATGGAATTTTGGGGGATTTCCAGTTTGGCTGAAGTT
JMFF048P10+ GATTGGGCCTTATGCTTGTGGGGAATGGAATTTTGGGGGATTTCCAGTTTGGCTGA
JMFS079H10+ GATTGGGCCTTATGCTTGTGGGGAATGGAATTTTGGGGGATTTCCAGTTTGGCTGAAGTT
JMFF033M24+ GATTGGGCCTTATGCTTGTGGGGAATGGAATTTTGGGGGATTTCCA
JMFS072F04+ GATTGGGCCTTATGCTTGTGGGGAATGGAATTTTGGGGGATTTCCAGTTTGGCT
JMFF018H13+ GATTGGGCCTTATGCTTGTGGGGAATGGAATTTTGGGGGATTTCCAGTTTGGCTGAAGTT
JMFS040F01+ GATTGGGCCTTATGCTTGTGGGGAATGGAATTTTGGGGGATTTCCAGTTTGGCTGAAGTT
JMSF021F22+ GATTGGGCCTTATGCTTGTGGGGAATGGAATTTTGGGGGATTTCCAGTTTGGCTGAAGTT
____________________________________________________________
consensus GATTGGGCCTTATGCTTGTGGGGAATGGAATTTTGGGGGATTTCCAGTTTGGCTGAAGTT

. : . : . : . : . : . :
JMFF031F22+ TGTTCCAG
JMFS079H10+ TGTTCCAGGGATTAGTTTCAGAACAGATAATGAACCTTTCAAGTCTGCCATGCAAAAGTT
JMFF018H13+ TGTTCC
JMFS040F01+ TGTTCCAGGGATTAGTTTCA
JMSF021F22+ TGTTCCAGGGATTAGTTTCAGAACAGATAATGAACCTTTCAAGTCTGCAATGCAAAAGTT
____________________________________________________________
consensus TGTTCCAGGGATTAGTTTCAGAACAGATAATGAACCTTTCAAGTCTGCAATGCAAAAGTT

. : . : . : . : . : . :
JMFS079H10+ CAC
JMSF021F22+ CACAACCATGATTGTCGATATGATGAAAACCGAAAGGCTGTATGCATCTCAGGGTGGTCC
____________________________________________________________
consensus CACAACCATGATTGTCGATATGATGAAAACCGAAAGGCTGTATGCATCTCAGGGTGGTCC

. : . : . : . : . : . :
JMSF021F22+ AATAATCTTATCCCAGATTGAGAACGAATATGGACCGATGGAGTATGAACTG
____________________________________________________________
consensus AATAATCTTATCCCAGATTGAGAACGAATATGGACCGATGGAGTATGAACTG