Alignment Contig 7915

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMSF027E01+ GGAGAATTTATTTCAAAGTCGAAATCTTTTGTTTTTTTATTGTTTTTTGTTTCTGTGATT
JMSF017I15+ ATTTATTTCAAAGTCGAAATCTTTTGTTTTTTTATTGTTTTTTGTTTCTGTGATT
JMFS118E04+ ATTTATTTCAAAGTCGAAATCTTTTGTTTTTTTATTGTTTTTTGTTTCTGTGATT
JMSF028B22+ ATTTATTTCAAAGTCGAAATCTTTTGTTTTTTTATTGTTTTTTGTTTCTGTGATT
____________________________________________________________
consensus GGAGAATTTATTTCAAAGTCGAAATCTTTTGTTTTTTTATTGTTTTTTGTTTCTGTGATT

. : . : . : . : . : . :
JMSF027E01+ CTATAGGATCTTGATGTGATTTCAATATATTCCTCTGGAAATCTGGTTTTGGGAAAACCT
JMSF017I15+ CTATAGGATCTTGATGTGATTTCAATATATTCCTCTGGAAATCTGGTTTTGGGAAAACCT
JMFS118E04+ CTATAGGATCTTGATGTGATTTCAATATATTCCTCTGGAAATCTGGTTTTGGGAAAACCT
JMSF028B22+ CTATAGGATCTTGATGTGATTTCAATATATTCCTCTGGAAATCTGGTTTTGGGAAAACCT
JMFS019F06+ CTTGATGTGATTTCAATATATTCCTCTGGAAATCTGGTTTTGGGAAAACCT
____________________________________________________________
consensus CTATAGGATCTTGATGTGATTTCAATATATTCCTCTGGAAATCTGGTTTTGGGAAAACCT

. : . : . : . : . : . :
JMSF027E01+ ATTTTACATTTTTTTTAATATTTATTATTAGGATAACTGGATAAGAACATGAGTAGGATC
JMSF017I15+ ATTTTACATTTTTTTTAATATTTATTATTAGGATAACTGGATAAGAACATGAGTAGGATC
JMFS118E04+ ATTTTACATTTTTTTTAATATTTATTATTAGGATAACTGGATAAGAACATGAGTAGGATC
JMSF028B22+ ATTTTACATTTTTTTTAATATTTATTATTAGGATAACTGGATAAGAACATGAGTAGGATC
JMFS019F06+ ATTTTACATTTTTTTTAATATTTATTATTAGGATAACTGGATAAGAACATGAGTAGGATC
____________________________________________________________
consensus ATTTTACATTTTTTTTAATATTTATTATTAGGATAACTGGATAAGAACATGAGTAGGATC

. : . : . : . : . : . :
JMSF027E01+ TGAGCAAGTTTTTGGATGGGTAGGGAACGCTACTTGTCTTCTTTCAATCGTGGGTTTGAT
JMSF017I15+ TGAGCAAGTTTTTGGATGGGTAGGGAACGCTACTTGTCTTCTTTCAATCGTGGGTTTGAT
JMFS118E04+ TGAGCAAGTTTTTGGATGGGTAGGGAACGCTACTTGTCTTCTTTCAATCGTGGGTTTGAT
JMSF028B22+ TGAGCAAGTTTTTGGATGGGTAGGGAACGCTACTTGTCTTCTTTCAATCGTGGGTTTGAT
JMFS019F06+ TGAGCAAGTTTTTGGATGGGTAGGGAACGCTACTTGTCTTCTTTCAATCGTGGGTTTGAT
JMSF038P18+ GTGGGTTTGAT
____________________________________________________________
consensus TGAGCAAGTTTTTGGATGGGTAGGGAACGCTACTTGTCTTCTTTCAATCGTGGGTTTGAT

. : . : . : . : . : . :
JMSF027E01+ GGGTCTCTGGCAAATTATTGATAGACTGTGATGGCGACTGTTTCTCTATCTGAGATCTTT
JMSF017I15+ GGGTCTCTGGCAAATTATTGATAGACTGTGATGGCGACTGTTTCTCTATCTGAGATCTTT
JMFS118E04+ GGGTCTCTGGCAAATTATTGATAGACTGTGATGGCGACTGTTTCTCTATCTGAGATCTTT
JMSF028B22+ GGGTCTCTGGCAAATTATTGATAGACTGTGATGGCGACTGTTTCTCTATCTGAGATCTTT
JMFS019F06+ GGGTCTCTGGCAAATTATTGATAGACTGTGATGGCGACTGTTTCTCTATCTGAGATCTTT
JMSF038P18+ GGGTCTCTGGCAAATTATTGATAGACTGTGATGGCGACTGTTTCTCTATCTGAGATCTTT
____________________________________________________________
consensus GGGTCTCTGGCAAATTATTGATAGACTGTGATGGCGACTGTTTCTCTATCTGAGATCTTT

. : . : . : . : . : . :
JMSF027E01+ CTTATTTTAGCTTGATAATTACTTTAAATTAGACAATTTCTCTAGTTTCAACTCATAATT
JMSF017I15+ CTTATTTTAGCTTGATAATTACTTTAAATTAGACAATTTCTCTAGTTTCAACTCATAATT
JMFS118E04+ CTTATTTTAGCTTGATAATTACTTTAAATTAGACAATTTCTCTAGTTTCAACTCATAATT
JMSF028B22+ CTTATTTTAGCTTGATAATTACTTTAAATTAGACAATTTCTCTAGTTTCAACTCATAATT
JMFS019F06+ CTTATTTTAGCTTGATAATTACTTTAAATTAGACAATTTCTCTAGTTTCAACTCATAATT
JMSF038P18+ CTTATTTTAGCTTGATAATTACTTTAAATTAGACAATTTCTCTAGTTTCAACTCATAATT
JMFF036F17+ ATAATT
JMFF001A09+ ATAATT
____________________________________________________________
consensus CTTATTTTAGCTTGATAATTACTTTAAATTAGACAATTTCTCTAGTTTCAACTCATAATT

. : . : . : . : . : . :
JMSF027E01+ TTAGAATTTCTTGTACATACCACCTTTTTCACATTTCATCCCTTCTTGAAATCCTCTGTT
JMSF017I15+ TTAGAATTTCTTGTACATACCACCTTTTTCACATTTCATCCCTTCTTGAAATCCTCTGTT
JMFS118E04+ TTAGAATTTCTTGTACATACCACCTTTTTCACATTTCATCCCTTCTTGAAATCCTCTGTT
JMSF028B22+ TTAGAATTTCTTGTACATACCACCTTTTTCACATTTCATCCCTTCTTGAAATCCTCTGTT
JMFS019F06+ TTAGAATTTCTTGTACATACCACCTTTTTCACATTTCATCCCTTCTTGAAATCCTCTGTT
JMSF038P18+ TTAGAATTTCTTGTACATACCACCTTTTTCACATTTCATCCCTTCTTGAAATCCTCTGTT
JMFF036F17+ TTAGAATTTCTTGTACATACCACCTTTTTCACATTTCATCCCTTCTTGAAATCCTCTGTT
JMFF001A09+ TTAGAATTTCTTGTACATACCACCTTTTTCACATTTCATCCCTTCTTGAAATCCTCTGTT
JMFS011A10+ ATCCCTTCTTGAAATCCTCTGTT
____________________________________________________________
consensus TTAGAATTTCTTGTACATACCACCTTTTTCACATTTCATCCCTTCTTGAAATCCTCTGTT

. : . : . : . : . : . :
JMSF027E01+ ACCCTCAGTCGATCGATTGAATCTGATTATTGTTGTTTGTTGCAATCTATTATTAAAGCA
JMSF017I15+ ACCCTCAGTCGATCGATTGAATCTGATTATTGTTGTTTGTTGCAATCTATTATTAAAGCA
JMFS118E04+ ACCCTCAGTCGATCGATTGAATCTGATTATTGTTGTTTGTTGCAATCTATTATTAAAGCA
JMSF028B22+ ACCCTCAGTCGATCGATTGAATCTGATTATTGTTGTTTGTTGCAATCTATTATTAAAGCA
JMFS019F06+ ACCCTCAGTCGATCGATTGAATCTGATTATTGTTGTTTGTTGCAATCTATTATTAAAGCA
JMSF038P18+ ACCCTCAGTCGATCGATTGAATCTGATTATTGTTGTTTGTTGCAATCTATTATTAAAGCA
JMFF036F17+ ACCCTCAGTCGATCGATTGAATCTGATTATTGTTGTTTGTTGCAATCTATTATTAAAGCA
JMFF001A09+ ACCCTCAGTCGATCGATTGAATCTGATTATTGTTGTTTGTTGCAATCTATTATTAAAGCA
JMFS011A10+ ACCCTCAGTCGATCGATTGAATCTTATTATTGTTGTTTGTTGCAATCTATTATTAAAGCA
____________________________________________________________
consensus ACCCTCAGTCGATCGATTGAATCTGATTATTGTTGTTTGTTGCAATCTATTATTAAAGCA

. : . : . : . : . : . :
JMSF027E01+ AGTGGTTTGGTTCCTTGAACCTCTCTCATTGTACTGATGTTCTTGTTAAATACTGGTACA
JMSF017I15+ AGTGGNTTGGTTCCNTGAACCTCTCTCATTGGACTGATG
JMFS118E04+ AGTGGTTTGGTTCCTTGAACCTCTCTCATTGTACTGATGTTCTTGTTAAATACTGGTACA
JMSF028B22+ AGTGGTTTGGTTCCTTGAACCTCTCTCATTGTACTGATGTTCTTGTTAAATACTGGTACA
JMFS019F06+ AGTGGTTTGGTTCCTTGAACCTCTCTCATTGTACTGATGTTCTTGTTAAATACTGGTACA
JMSF038P18+ AGTGGTTTGGTTCCTTGAACCTCTCTCATTGTACTGATGTTCTTGTTAAATACTGGTACA
JMFF036F17+ AGTGGTTTGGTTCCTTGAACCTCTCTCATTGTACTGATGTTCTTGTTAAATACTGGTACA
JMFF001A09+ AGTGGTTTGGTTCCTTGAACCTCTCTCATTGTACTGATGTTCTTGTTAAATACTGGTACA
JMFS011A10+ AGTGGTTTGGTTCCTTGAACCTCTCTCATTGTACTGATGTTCTTGTTAAATACTGGTACA
JMFS028G01+ A
____________________________________________________________
consensus AGTGGTTTGGTTCCTTGAACCTCTCTCATTGTACTGATGTTCTTGTTAAATACTGGTACA

. : . : . : . : . : . :
JMSF027E01+ GCACTGATTTCTGCGGGGTGTGAAGGTGAAACAATGGAGATAAAACCGAAAAAATTCCTC
JMFS118E04+ GCACTGATTTCTGCGGNGTGTGAAGGTGAAACAATGGAGATAAAACCGAANAAATTCCTC
JMSF028B22+ GCACTGATTTCTGCGGGGTGTGAAGGTGAAACAATGGAGATAAAACCGAAAAAATTCCTC
JMFS019F06+ GCACTGATTTCTGCGGGGTGTGAAGGTGAAACAATGGAGATAAAACCGAAAAAATTCCTC
JMSF038P18+ GCACTGATTTCTGCGGGGTGTGAAGGTGAAACAATGGAGATAAAACCGAAAAAATTCCTC
JMFF036F17+ GCACTGATTTCTGCGGGGTGTGAAGGTGAAACAATGGAGATAAAACCGAAAAAATTCCTC
JMFF001A09+ GCACTGATTTCTGCGGGGTGTGAAGGTGAAACAATGGAGATAAAACCGAAAAAATTCCTC
JMFS011A10+ GCACTGATTTCTGCGGGGTGTGAAGGTGAAACAATGGAGATAAAACCGAAAAAATTCCTC
JMFS028G01+ GCACTGATTTCTGCGGGGTGTGAAGGTGAAACAATGGAGATAAAACCGAAAAAATTCCTC
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consensus GCACTGATTTCTGCGGGGTGTGAAGGTGAAACAATGGAGATAAAACCGAAAAAATTCCTC

. : . : . : . : . : . :
JMSF027E01+ ACAGTGGCTCCTTTCGAGTGTGCCTGGCGGGATG
JMFS118E04+ ACAGTGGCTCCTTTCGAGTGTGCCTGGCGGG
JMSF028B22+ ACAGTGGCTCCTTTCGAGTGTGCCTGGCGGGATGATCTTCGAT
JMFS019F06+ ACAGTGGCTCCTTTCGAGTGTGCCTGGCGGGATGATCTTCNATTCANGGAGGCTGGGAGA
JMSF038P18+ ACAGTGGCTCCTTTCGAGTGTGCCTGGCGGGATGATCTTCGATTCAGGGAGGCTGGGAGA
JMFF036F17+ ACAGTGGCTCCTTTCGAGTGTGCCTGGCGGGATGATCTTCGATTCAGGGAGGCTGGGAGA
JMFF001A09+ ACAGTGGCTCCTTTCGAGTGTGCCTGGCGGGATGATCTTCGATTCAGGGAGGCTGGGAGA
JMFS011A10+ ACAGTGGCTCCTTTCGAGTGTGCCTGGCGGGATGATCTTCGATTCAGGGAGGCTGGGAGA
JMFS028G01+ ACAGTGGCTCCTTTCGAGTGTGCCTGGCGGGATGATCTTCGATTCAGGGAGGCTGGGAGA
____________________________________________________________
consensus ACAGTGGCTCCTTTCGAGTGTGCCTGGCGGGATGATCTTCGATTCAGGGAGGCTGGGAGA

. : . : . : . : . : . :
JMFS019F06+ GGGTGTGTAGCTTTTGATGCTTTTGCT
JMSF038P18+ GGGTGTGTAGCTTTTGATGCTTTTGCTCACAACGATGTCACGGTTGTGTTCCGAGAGCAC
JMFF036F17+ GGGTGTGTAGCTTTTGATGCTTTTGCTCACAACTATGTCACGGTTGTGTTCCGAGAGCAC
JMFF001A09+ GGGTGTGTAGCTTTTGATGCTTTTGCTCACAACTATGTCACGGTTGTGTTCCGAGAGCAC
JMFS011A10+ GGGTGTGTAGCTTTTGATGCTTTTGCTCACAACGATGTCACGGTTGTGTTCCGAGAGCAC
JMFS028G01+ GGGTGTGTAGCTTTTGATGCTTTTGCTCACAACGATGTCACGGTTGTGTTCCGAGAGCAC
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consensus GGGTGTGTAGCTTTTGATGCTTTTGCTCACAACGATGTCACGGTTGTGTTCCGAGAGCAC

. : . : . : . : . : . :
JMSF038P18+ GTGGGTAGTCAACACTATCACTACAAGAGGGACGATAGTCCTCATTATACTGTGATTATT
JMFF036F17+ GTGGGTAGTCAACACTATCACTACAAGAGGGACGATAGTCCTCATTATACTGTGATTATT
JMFF001A09+ GTGGGTAGTCAACACTATCACTACAAGAGGGACGATAGTCCTCATTATACTGTGATTATT
JMFS011A10+ GTGGGTAGTCAACACTATCACTACAAGAGGGACGATAGTCCTCATTATACTGTGATTATT
JMFS028G01+ GTGGGTAGTCAACACTATCACTACAAGAGGGACGATAGTCCTCATTATACTGTGATTATT
____________________________________________________________
consensus GTGGGTAGTCAACACTATCACTACAAGAGGGACGATAGTCCTCATTATACTGTGATTATT

. : . : . : . : . : . :
JMSF038P18+ GGTAGCCATAGGAATAGGAGATTGAAAATCGAGGTAGATGGGAGAACGGTGGTCGATGTG
JMFF036F17+ GGTAGCCATAGGAATAGGAGATTGAAAATCGAGGTAGATGGGAGAACGGTGGTCGATGTG
JMFF001A09+ GGTAGCCATAGGAATAGGAGATTGAAAATCGAGGTAGATGGGAGAACGGTGGTCGATGTG
JMFS011A10+ GGTAGCCATAGGAATAGGAGATTGAAAATCGAGGTAGATGGGAGAACGGTGGTCGATGTG
JMFS028G01+ GGTAGCCATAGGAATAGGAGATTGAAAATCGAGGTAGATGGGAGAACGGTGGTCGATGTG
____________________________________________________________
consensus GGTAGCCATAGGAATAGGAGATTGAAAATCGAGGTAGATGGGAGAACGGTGGTCGATGTG

. : . : . : . : . : . :
JMSF038P18+ GCTAGTGTTGATCTTTGCTGTTCTTCGACGTTT
JMFF036F17+ GCTAGTGTTGATCTTTGCTGTTCTTCGACGTTTCAGAGCTATTGGATCGGTATCTATGAT
JMFF001A09+ GCTAGTGTTGATCTTTGCTGTTCTTCGACGTTTCAGAGCTATTGGATCGGTATCTATGAT
JMFS011A10+ GCTAGTGTTGATCTTTGCTGTTCTTCGACGTTTCAGAGCTATTGGATCGGTATCTATGAT
JMFS028G01+ GCTAGTGTTGATCTTTGCTGTTCTTCGACGTTTCAGAGCTATTGGATCGGTATCTATGAT
____________________________________________________________
consensus GCTAGTGTTGATCTTTGCTGTTCTTCGACGTTTCAGAGCTATTGGATCGGTATCTATGAT

. : . : . : . : . : . :
JMFF036F17+ GGGTTGATTAGTAT
JMFF001A09+ G
JMFS011A10+ GGGTTGATTAGTATTGGGAAAGGAAGGTACCCGTTTCAGAATCTTTGCTTGCAGTGGCAT
JMFS028G01+ GGGTTGATTAGTATTGGGAAAGGAAGGTACCCGTTTCAGAATCTTTGCTTGCAGTGGCAT
____________________________________________________________
consensus GGGTTGATTAGTATTGGGAAAGGAAGGTACCCGTTTCAGAATCTTTGCTTGCAGTGGCAT

. : . : . : . : . : . :
JMFS011A10+ GATTCGAAACCGAATTGCAGTGTCCAGTATGTTGGTCTTAGTAGTTGGGA
JMFS028G01+ GATTCGAAACCGAATTGCAGTGTCCAGTATGTTGGTCTTAGTAGTTGGGACAAGCATGTT
____________________________________________________________
consensus GATTCGAAACCGAATTGCAGTGTCCAGTATGTTGGTCTTAGTAGTTGGGACAAGCATGTT

. : . : . : . : . : . :
JMFS028G01+ GGCTACAGGAACGTTAATGTTCTACCTATTACGCAAAACCATATATCTTTGTGGAAACAG
____________________________________________________________
consensus GGCTACAGGAACGTTAATGTTCTACCTATTACGCAAAACCATATATCTTTGTGGAAACAG

. : . : . : . : . : . :
JMFS028G01+ GTAGATTATGTTGGGTGTGATAGCGAGGATGCTAATACTGAGCTGGAGGATAGAGCTGGG
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consensus GTAGATTATGTTGGGTGTGATAGCGAGGATGCTAATACTGAGCTGGAGGATAGAGCTGGG

. : . : . : . : . : . :
JMFS028G01+ GAT
____________________________________________________________
consensus GAT