Alignment Contig 785

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMSF027F19+ GCTGGTTTCTTCATCTTTGTGACCTATCGGTTCTTCCCCTCACGAATCACCATTCCCTAT
JMSF009L10+ GCTGGTTTCTTCATCTTTGTGACCTATCGGTTCTTCCCCTCACGAATCACCATTCCCTAT
JMSF009E09+ ACGAATCACCATTCCCTAT
JMFF014O14+ TCTTTGTGACCTATCGGTTCTTCCCCTCACGAATCACCATTCCCTAT
JMFN036A23+ TCTTTGTGACCTATCGGTTCTTCCCCTCACGAATCACCATTCCCTAT
____________________________________________________________
consensus GCTGGTTTCTTCATCTTTGTGACCTATCGGTTCTTCCCCTCACGAATCACCATTCCCTAT

. : . : . : . : . : . :
JMSF027F19+ AGGGGCTTTATGCTGAAACATTGATTTTCCCCAAAACTACTCTACTGAAATTCAGTGTCG
JMSF009L10+ AGGGGCTTTATGCTGAAACATTGATTTTCCCCAAAACTACTCTACTGAAATTCAGTGTCG
JMSF009E09+ AGGGGCTTTATGCTGAAACATTGATTTTCCCCAAAACTACTCTACTGAAATTCAGTGTCG
JMFF014O14+ AGGGGCTTTATGCTGAAACATTGATTTTCCCCAAAACTACTCTACTGAAATTCAGTGTCG
JMFN036A23+ AGGGGCTTTATGCTGAAACATTGATTTTCCCCAAAACTACTCTACTGAAATTCAGTGTCG
____________________________________________________________
consensus AGGGGCTTTATGCTGAAACATTGATTTTCCCCAAAACTACTCTACTGAAATTCAGTGTCG

. : . : . : . : . : . :
JMSF027F19+ AAGCCACGGGCTGTTGATCAAGATGACGCCTGTTTGCCCTTTTGTCAAGGCTGCTCGGCC
JMSF009L10+ AAGCCACGGGCTGTTGATCAAGATGACGCCTGTTTGCCCTTTTGTCAAGGCTGCTCGGCC
JMSF009E09+ AAGCCACGGGCTGTTGATCAAGATGACGCCTGTTTGCCCTTTTGTCAAGGCTGCTCGGCC
JMFF014O14+ AAGCCACGGGCTGTTGATCAAGATGACGCCTGTTTGCCCTTTTGTCAAGGCTGCTCGGCC
JMFN036A23+ AAGCCACGGGCTGTTGATCAAGATGACGCCTGTTTGCCCTTTTGTCAAGGCTGCTCGGCC
____________________________________________________________
consensus AAGCCACGGGCTGTTGATCAAGATGACGCCTGTTTGCCCTTTTGTCAAGGCTGCTCGGCC

. : . : . : . : . : . :
JMSF027F19+ TGATGATGCATCTGTTAAGAAACCTGGAGAAAGTCAAAGTAAACAGCATGGCGGCAGTGA
JMSF009L10+ TGATGATGCATCTGTTAAGAAACCTGGAGAAAGTCAAAGTAAACAGCATGGCGGCAGTGA
JMSF009E09+ TGATGATGCATCTGTTAAGAAACCTGGAGAAAGTCAAAGTAAACAGCATGGCGGCAGTGA
JMFF014O14+ TGATGATGCATCTGTTAAGAAACCTGGAGAAAGTCAAAGTAAACAGCATGGCGGCAGTGA
JMFN036A23+ TGATGATGCATCTGTTAAGAAACCTGGAGAAAGTCAAAGTAAACAGCATGGCGGCAGTGA
____________________________________________________________
consensus TGATGATGCATCTGTTAAGAAACCTGGAGAAAGTCAAAGTAAACAGCATGGCGGCAGTGA

. : . : . : . : . : . :
JMSF027F19+ GAAGCCCAAGCAGGAGTCTGGGGAGCCAGCTATGGTGCCGTCGAAATGCCCTTTTGTCCA
JMSF009L10+ GAAGCCCAAGCAGGAGTCTGGGGAGCCAGCTATGGTGCCGTCGAAATGCCCTTTTGTCCA
JMSF009E09+ GAAGCCCAAGCAGGAGTCTGGGGAGCCAGCTATGGTGCCGTCGAAATGCCCTTTTGTCCA
JMFF014O14+ GAAGCCCAAGCAGGAGTCTGGGGAGCCAGCTATGGTGCCGTCGAAATGCCCTTTTGTCCA
JMFN036A23+ GAAGCCCAAGCAGGAGTCTGGGGAGCCAGCTATGGTGCCGTCGAAATGCCCTTTTGTCCA
____________________________________________________________
consensus GAAGCCCAAGCAGGAGTCTGGGGAGCCAGCTATGGTGCCGTCGAAATGCCCTTTTGTCCA

. : . : . : . : . : . :
JMSF027F19+ TAAACAGCAAGCTGGCAGTGAAATCAAGCCTAATCAGGAATCTGGGGAGCAAGCAAAGGT
JMSF009L10+ TAAACAGCAAGCTGGCAGTGAAATCAAGCCTAATCAGGAATCTGGGGAGCAAGCAAAGGT
JMSF009E09+ TAAACAGCAAGCTGGCAGTGAAATCAAGCCTAATCAGGAATCTGGGGAGCAAGCAAAGGT
JMFF014O14+ TAAACAGCAAGCTGGCAGTGAAATCAAGCCTAATCAGGAATCTGGGGAGCAAGCAAAGGT
JMFN036A23+ TAAACAGCAAGCTGGCAGTGAAATCAAGCCTAATCAGGAATCTGGGGAGCAAGCAAAGGT
____________________________________________________________
consensus TAAACAGCAAGCTGGCAGTGAAATCAAGCCTAATCAGGAATCTGGGGAGCAAGCAAAGGT

. : . : . : . : . : . :
JMSF027F19+ GTCATCCAAATGCCCCTTTGGATATACACAAGAAGCTGGTGGTGAAAACAAGCCTAAGCA
JMSF009L10+ GTCATCCAAATGCCCCTTTGGATATACACAAGAAGCTGGTGGTGAAAACAAGCCTAAGCA
JMSF009E09+ GTCATCCAAATGCCCCTTTGGATATACACAAGAAGCTGGTGGTGAAAACAAGCCTAAGCA
JMFF014O14+ GTCATCCAAATGCCCCTTTGGATATACACAAGAAGCTGGTGGTGAAAACAAGCCTAAGCA
JMFN036A23+ GTCATCCAAATGCCCCTTTGGATATACACAAGAAGCTGGTGGTGAAAACAAGCCTAAGCA
____________________________________________________________
consensus GTCATCCAAATGCCCCTTTGGATATACACAAGAAGCTGGTGGTGAAAACAAGCCTAAGCA

. : . : . : . : . : . :
JMSF027F19+ AGTGTCTGAGAAGCCTGGCGTTATGTCACCCAAGTGTCCCCTTGGATTTGATTCTCAAAC
JMSF009L10+ AGTGTCTGAGAAGCCTGGCGTTATGTCACCCAAGTGTCCCCTTGGATTTGAT
JMSF009E09+ AGTGTCTGAGAAGCCTGGCGTTATGTCACCCAAGTGTCCCCTTGGATTTGATTCTCAAAC
JMFF014O14+ AGTGTCTGAGAAGCCTGGCGTTATGTCACCCAAGTGTCCCCTTGGATTTGATTCTCAAAC
JMFN036A23+ AGTGTCTGAGAAGCCTGGCGTTATGTCACCCAAGTGTCCCCTTGGATTTGATTCTCAAAC
____________________________________________________________
consensus AGTGTCTGAGAAGCCTGGCGTTATGTCACCCAAGTGTCCCCTTGGATTTGATTCTCAAAC

. : . : . : . : . : . :
JMSF027F19+ ATTTAAGCTCGGTCCTCTTAGCTGCATGATATGTCAAGCTTTACTTTATGATTGCAGCCG
JMSF009E09+ ATTTAAGCTCGGTCCTCTTAGCTGCATGATATGTCAAGCTTTACTTTATGA
JMFF014O14+ ATTTAAGCTCGGTCCTCTTAGCTGCATGATATGTCAAGCTTTACTTTATGATTGCAGCCG
JMFN036A23+ ATTTAAGCTCGGTCCTCTTAGCTGCATGATATGTCAAGCTTTACTTTATGATTGCAGCCG
____________________________________________________________
consensus ATTTAAGCTCGGTCCTCTTAGCTGCATGATATGTCAAGCTTTACTTTATGATTGCAGCCG

. : . : . : . : . : . :
JMSF027F19+ ATGTGTGCCTTGTTCTCATGTATTTTGCAAAGTATGTATCACACGCTTTAAGGACTGTCC
JMFF014O14+ ATGTGTGCCTTGTTCTCATGTATTTTGCAAAGTATGTATCACACGCTTTAAG
JMFN036A23+ ATGTGTGCCTTGTTCTCATGTATTTTGCAAAGTATGTATCACACGCTTTAAGGACTGTCC
____________________________________________________________
consensus ATGTGTGCCTTGTTCTCATGTATTTTGCAAAGTATGTATCACACGCTTTAAGGACTGTCC

. : . : . : . : . : . :
JMSF027F19+ ATTATGCGGAGCTGATGTTGAGAAGATTGAAGCTGAC
JMFN036A23+ ATTATGCGGA
____________________________________________________________
consensus ATTATGCGGAGCTGATGTTGAGAAGATTGAAGCTGAC