Alignment Contig 7400

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMFF027O18+ AGTGCCATTATTCATTCTCGCTCAGGTAATAAATGTCAAAGATCCTGCCCTTCTCCTTTT
____________________________________________________________
consensus AGTGCCATTATTCATTCTCGCTCAGGTAATAAATGTCAAAGATCCTGCCCTTCTCCTTTT

. : . : . : . : . : . :
JMFF027O18+ GGGGTTTTCTCTGATGATTCCAATCTCGATCGTCTCTGTACTGGATTTTTCATCTCTTTA
JMSF016G18+ GTTTTCTCTGATGATTCCAATCTCGATCGTCTCTGTACTGGATTTTTCATCTCTTTA
JMSF051E18+ GTTTTCTCTGATGATTCCAATCTCGATCGTCTCTGTACTGGATTTTTCATCTCTTTA
JMSF043D13+ GTTTTCTCTGATGATTCCAATCTCGATCGTCTCTGTACTGGATTTTTCATCTCTTTA
____________________________________________________________
consensus GGGGTTTTCTCTGATGATTCCAATCTCGATCGTCTCTGTACTGGATTTTTCATCTCTTTA

. : . : . : . : . : . :
JMFF027O18+ TTTTTGTGAGGGAAGAGCATGATTTTGAGGATTTTAGCGATTGGGGTTCTTTCTATTTTT
JMSF016G18+ TTTTTGTGAGGGAAGAGCATGATTTTGAGGATTTTAGCGATTGGGGTTCTTTCTATTTTT
JMSF051E18+ TTTTTGTGAGGGAAGAGCATGATTTTGAGGATTTTAGCGATTGGGGTTCTTTCTATTTTT
JMSF043D13+ TTTTTGTGAGGGAAGAGCATGATTTTGAGGATTTTAGCGATTGGGGTTCTTTCTATTTTT
____________________________________________________________
consensus TTTTTGTGAGGGAAGAGCATGATTTTGAGGATTTTAGCGATTGGGGTTCTTTCTATTTTT

. : . : . : . : . : . :
JMFF027O18+ TCTTGGTGGATTTTGGACTTTGAAGCTCTACTTATACTCGGTTCTTGCTTTGTTGCATTC
JMSF016G18+ TCTTGGTGGATTTTGGACTTTGAAGCTCTACTTATACTCGGTTCTTGCTTTGTTGCATTC
JMSF051E18+ TCTTGGTGGATTTTGGACTTTGAAGCTCTACTTATACTCGGTTCTTGCTTTGTTGCATTC
JMSF043D13+ TCTTGGTGGATTTTGGACTTTGAAGCTCTACTTATACTCGGTTCTTGCTTTGTTGCATTC
____________________________________________________________
consensus TCTTGGTGGATTTTGGACTTTGAAGCTCTACTTATACTCGGTTCTTGCTTTGTTGCATTC

. : . : . : . : . : . :
JMFF027O18+ TTCAATTAGTGGATTTTTTTTTGTGTTTGGTGTCTTACTAAGGAGATCAAAGCAGTGTTA
JMSF016G18+ TTCAATTAGTGGATTTTTTTTTGTGTTTGGTGTCTTACTAAGGAGATCAAAGCAGTGTTA
JMSF051E18+ TTCAATTAGTGGATTTTTTTTTGTGTTTGGTGTCTTACTAAGGAGATCAAAGCAGTGTTA
JMSF043D13+ TTCAATTAGTGGATTTTTTTTTGTGTTTGGTGTCTTACTAAGGAGATCAAAGCAGTGTTA
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consensus TTCAATTAGTGGATTTTTTTTTGTGTTTGGTGTCTTACTAAGGAGATCAAAGCAGTGTTA

. : . : . : . : . : . :
JMFF027O18+ ATTTAACGGACTTGGGAGATTGTACAAATATGGCGAACGATGCGGCGGCTTGTGCTGAGA
JMSF016G18+ ATTTAACGGACTTGGGAGATTGTACAAATATGGCGAACGATGCGGCGGCTTGTGCTGAGA
JMSF051E18+ ATTTAACGGACTTGGGAGATTGTACAAATATGGCGAACGATGCGGCGGCTTGTGCTGAGA
JMSF043D13+ ATTTAACGGACTTGGGAGATTGTACAAATATGGCGAACGATGCGGCGGCTTGTGCTGAGA
____________________________________________________________
consensus ATTTAACGGACTTGGGAGATTGTACAAATATGGCGAACGATGCGGCGGCTTGTGCTGAGA

. : . : . : . : . : . :
JMFF027O18+ GGGCCACAAGTGACATGTTGATTGGTCCTGACTGGGCAGTTAATATTGAGCTTTGTGATA
JMSF016G18+ GGGCCACAAGTGACATGTTGATTGGTCCTGACTGGGCAGTTAATATTGAGCTTTGTGATA
JMSF051E18+ GGGCCACAAGTGACATGTTGATTGGTCCTGACTGGGCAGTTAATATTGAGCTTTGTGATA
JMSF043D13+ GGGCCACAAGTGACATGTTGATTGGTCCTGACTGGGCAGTTAATATTGAGCTTTGTGATA
____________________________________________________________
consensus GGGCCACAAGTGACATGTTGATTGGTCCTGACTGGGCAGTTAATATTGAGCTTTGTGATA

. : . : . : . : . : . :
JMFF027O18+ TTATTAACATCAACCCTGGGGAAGCGAAGGATGCACTCAAGATTCTAAAGAAACGTCTTG
JMSF016G18+ TTATTAACATCAACCCTGGGCAAGCGAAGGATGCACTCAAGATTCTAAAGAAACGTCTTG
JMSF051E18+ TTATTAACATCAACCCTGGGCAAGCGAAGGATGCACTCAAGATTCTAAAGAAACGTCTTG
JMSF043D13+ TTATTAACATCAACCCTGGGCAAGCGAAGGATGCACTCAAGATTCTAAAGAAACGTCTTG
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consensus TTATTAACATCAACCCTGGGCAAGCGAAGGATGCACTCAAGATTCTAAAGAAACGTCTTG

. : . : . : . : . : . :
JMFF027O18+ GGAATAAAAACCCTAAAATACAACTTCTTGCATTATTTGTACTTGAG
JMSF016G18+ GGAATAAAAACCCTAAAATACAACTTCTTGCATTATTTGTACTTGAGACTCTTAGCAAAA
JMSF051E18+ GGAATAAAAACCCTAAAATACAACTTCTTGCATTATTTGTACTTGAGACTCTTAGCAAAA
JMSF043D13+ GGAATAAAAACCCTAAAATACAACTTCTTGCATTATTTGTACTTGAGACTCTTAGCAAAA
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consensus GGAATAAAAACCCTAAAATACAACTTCTTGCATTATTTGTACTTGAGACTCTTAGCAAAA

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JMSF016G18+ ACTGTGG
JMSF051E18+ ACTGTGGAGAGAATATATTTCAGCAGATTGTTGAGCGGGACATTTTGCATGACATGGTGA
JMSF043D13+ ACTGTGGAGAGAATATATTTCAGCAGATTGTTGAGCGGGACATTTTGCATGACATGGTGA
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consensus ACTGTGGAGAGAATATATTTCAGCAGATTGTTGAGCGGGACATTTTGCATGACATGGTGA

. : . : . : . : . : . :
JMSF051E18+ AAATTGTAAAGAAAAAGCCTGATTTGAATGTGAGGGAAAAGATTTTGATTCTGATAGATA
JMSF043D13+ AAATTGTAAAGAAAAAGCCTGATTTGAATGTGAGGGAAAAGATTTTGATTCTGATAGATA
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consensus AAATTGTAAAGAAAAAGCCTGATTTGAATGTGAGGGAAAAGATTTTGATTCTGATAGATA

. : . : . : . : . : . :
JMSF051E18+ CATGGCAAGAAGCTTTAGGGGGACCCAGANGACGGTTTCCACAATACCATGCTGCCTATA
JMSF043D13+ CATGGCAAGAAGCTTTAGGGGGACCCAGAGGACGGTTTCCACAATACCATGCTGCCTATA
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consensus CATGGCAAGAAGCTTTAGGGGGACCCAGAGGACGGTTTCCACAATACCATGCTGCCTATA

. : . : . : . : . : . :
JMSF051E18+ ATGAGCTGAAGGCTTTTGGTGTGGAATTTCC
JMSF043D13+ ATGAGCTGAAGGCTTTTGGTGTGGAATTTCCTCCCCGTGAAGAAAACAGCGTTCCTTTAT
____________________________________________________________
consensus ATGAGCTGAAGGCTTTTGGTGTGGAATTTCCTCCCCGTGAAGAAAACAGCGTTCCTTTAT

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JMSF043D13+ TTACTCCACCG
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consensus TTACTCCACCG