Alignment Contig 7

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMFF002F08+ CTCTTCTCTTCTACTCCGTATCACTTCGTTCTACTCAACCCCAGTAGTCTTCTTGATTCT
JMFF015K07+ TCTTCTCTTCTACTCCGTATCACTTCGTTCTACTCAACCCCAGTAGTCTTCTTGATTCT
JMFS069H08+ TCCGTATCACTTCGTTCTACTCAACCCCAGTAGTCTTCTTGATTCT
JMFS025F06+ CCGTATCACTTCGTTCTACTCA-CCCCAGTAGTCTTCTTGATTCT
JMSF021M10+ ATCACTTCGTTCTACTCAACCCCAGTAGTCTTCTTGATTCT
JMFS025C05+ TCT
JMFS064E12+ TCAACCCCAGTAGTCTTCTTGATTCT
JMFS081D08+ TTCGTTCTACTCAACCCCAGTAGTCTTCTTGATTCT
____________________________________________________________
consensus CTCTTCTCTTCTACTCCGTATCACTTCGTTCTACTCAACCCCAGTAGTCTTCTTGATTCT

. : . : . : . : . : . :
JMFF002F08+ TGAACGATAAAGATTGAATCTTTTTGCCCAGATTTTGACTCCTTTTCCAGTTTAAGCTTC
JMFF015K07+ TGAACGATAAAGATTGAATCTTTTTGCCCAGATTTTGACTCCTTTTCCAGTTTAAGCTTC
JMFS069H08+ TGAACGATAAAGATTGAATCTTTTTGCCCAGATTTTGACTCCTTTTCCAGTTTAAGCTTC
JMFS025F06+ TGAACGATAAAGATTGAATCTTTTTGCCCAGATTTTGACTCCTTTTCCAGTTTAAGCTTC
JMSF021M10+ TGAACGATAAAGATTGAATCTTTTTGCCCAGATTTTGACTCCTTTTCCAGTTTAAGCTTC
JMFS025C05+ TGAACGATAAAGATTGAATCTTTTTGCCCAGATTTTGACTCCTTTTCCAGTTTAAGCTTC
JMFS064E12+ TGAACGATAAAGATTGAATCTTTTTGCCCAGATTTTGACTCCTTTTCCAGTTTAAGCTTC
JMFS081D08+ TGAACGATAAAGATTGAATCTTTTTGCCCAGATTTTGACTCCTTTTCCAGTTTAAGCTTC
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consensus TGAACGATAAAGATTGAATCTTTTTGCCCAGATTTTGACTCCTTTTCCAGTTTAAGCTTC

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JMFF002F08+ TGGGTGTTTTCTGATTAATGGGTTCTGAGAATCTTTTCTGCAGAGAGTTGCCTTATGACT
JMFF015K07+ TGGGTGTTTTCTGATTAATGGGTTCTGAGAATCTTTTCTGCAGAGAGTTGCCTTATGACT
JMFS069H08+ TGGGTGTTTTCTGATTAATGGGTTCTGAGAATCTTTTCTGCAGAGAGTTGCCTTATGACT
JMFS025F06+ TGGGTGTTTTCTGATTAATGGGTTCTGAGAATCTTTTCTGCAGAGAGTTGCCTTATGACT
JMSF021M10+ TGGGTGTTTTCTGATTAATGGGTTCTGAGAATCTTTTCTGCAGAGAGTTGCCTTATGACT
JMFS025C05+ TGGGTGTTTTCTGATTAATGGGTTCTGAGAATCTTTTCTGCAGAGAGTTGCCTTATGACT
JMFS064E12+ TGGGTGTTTTCTGATTAATGGGTTCTGAGAATCTTTTCTGCAGAGAGTTGCCTTATGACT
JMFS081D08+ TGGGTGTTTTCTGATTAATGGGTTCTGAGAATCTTTTCTGCAGAGAGTTGCCTTATGACT
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consensus TGGGTGTTTTCTGATTAATGGGTTCTGAGAATCTTTTCTGCAGAGAGTTGCCTTATGACT

. : . : . : . : . : . :
JMFF002F08+ GATGAGTGATGAGTGGCTTTTGTACTTGAGTAGTCAT-TTTTAGCAAGAAGTTGAAGAAG
JMFF015K07+ GATGAGTGATGAGTGGCTTTTGTACTTGAGTAGTCAT-TTTTAGCAAGAAGTTGAAGAAG
JMFS069H08+ GATGAGTGATGAGTGGCTTTTGTACTTGAGTAGTCATCTTTTAGCAAGAAGTTGAAGAAG
JMFS025F06+ GATGAGTGATGAGTGGCTTTTGTACTTGAGTAGTCATCTTTTAGCAAGAAGTTGAAGAAG
JMSF021M10+ GATGAGTGATGAGTGGCTTTTGTACTTGAGTAGTCATCTTTTAGCAAGAAGTTGAAGAAG
JMFS025C05+ GATGAGTGATGAGTGGCTTTTGTACTTGAGTAGTCATCTTTTAGCAAGAAGTTGAAGAAG
JMFS064E12+ GATGAGTGATGAGTGGCTTTTGTACTTGAGTAGTCATCTTTTAGCAAGAAGTTGAAGAAG
JMFS081D08+ GATGAGTGATGAGTGGCTTTTGTACTTGAGTAGTCATCTTTTAGCAAGAAGTTGAAGAAG
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consensus GATGAGTGATGAGTGGCTTTTGTACTTGAGTAGTCATCTTTTAGCAAGAAGTTGAAGAAG

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JMFF002F08+ GATTTAGTCTTCCCTGGGAGCCCTTGAGGTCTGGCCTTGTTGTTTCTACAAAGTTCATAT
JMFF015K07+ GATTTAGTCTTCCCTGGGAGCCCTTGAGGTCTGGCCTTGTTGTTTCTACAAAGTTCATAT
JMFS069H08+ GATTTAGTCTTCCCTGGGAGCCCTTGAGGTCTGGCCTTGTTGTTTCTACAAAGTTCATAT
JMFS025F06+ GATTTAGTCTTCCCTGGGAGCCCTTGAGGTCTGGCCTTGTTGTTTCTACAAAGTTCATAT
JMSF021M10+ GATTTAGTCTTCCCTGGGAGCCCTTGAGGTCTGGCCTTGTTGTTTCTACAAAGTTCATAT
JMFS025C05+ GATTTAGTCTTCCCTGGGAGCCCTTGAGGTCTGGCCTTGTTGTTTCTACAAAGTTCATAT
JMFS064E12+ GATTTAGTCTTCCCTGGGAGCCCTTGAGGTCTGGCCTTGTTGTTTCTACAAAGTTCATAT
JMFS081D08+ GATTTAGTCTTCCCTGGGAGCCCTTGAGGTCTGGCCTTGTTGTTTCTACAAAGTTCATAT
JMFS169A01+ TCTGGCCTTGTTGTTTCTACAAAGTTCATAT
JMFS139D03+ AGTTCATAT
JMSF051J12+ AGTTCATAT
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consensus GATTTAGTCTTCCCTGGGAGCCCTTGAGGTCTGGCCTTGTTGTTTCTACAAAGTTCATAT

. : . : . : . : . : . :
JMFF002F08+ TAGTTGGAGTTGGATTCAGGGTTGTTGAGAATGAACGGGGCTGTGTTAGTGGCGATTGCG
JMFF015K07+ TANTTGGAGTTGGATTCAGGGTTGTTGAGAATGAACGGGGCTGTGTTAGTGGCGATTGCG
JMFS069H08+ TAGTTGGAGTTGGATTCAGGGTTGTTGAGAATGAACGGGGCTGTGTTAGTGGCGATTGCG
JMFS025F06+ TAGTTGGAGTTGGATTCAGGGTTGTTGAGAATGAACGGGGCTGTGTTAGTGGCGATTGCG
JMSF021M10+ TAGTTGGAGTTGGATTCAGGGTTGTTGAGAATGAACGGGGCTGTGTTAGTGGCGATTGCG
JMFS025C05+ TAGTTGGAGTTGGATTCAGGGTTGTTGAGAATGAACGGGGCTGTGTTAGTGGCGATTGCG
JMFS064E12+ TAGTTGGAGTTGGATTCAGGGTTGTTGAGAATGAACGGGGCTGTGTTAGTGGCGATTGCG
JMFS081D08+ TAGTTGGAGTTGGATTCAGGGTTGTTGAGAATGAACGGGGCTGTGTTAGTGGCGATTGCG
JMFS169A01+ TAGTTGGAGTTGGATTCAGGGTTGTTGAGAATGAACGGGGCTGTGATAGTGGCGATTGCG
JMFS139D03+ TAGTTGGAGTTGGATTCAGGGTTGTTGAGAATGAACGGGGCTGTGTTAGTGGCGATTGCG
JMSF051J12+ TAGTTGGAGTTGGATTCAGGGTTGTTGAGAATGAACGGGGCTGTGTTAGTGGCGATTGCG
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consensus TAGTTGGAGTTGGATTCAGGGTTGTTGAGAATGAACGGGGCTGTGTTAGTGGCGATTGCG

. : . : . : . : . : . :
JMFF002F08+ GCCACAATTGGGAACTTTTTGCAGGGTTGGGATAATGCCACCATAGCAGGAGCTGTTGTT
JMFF015K07+ GCCACAATTGGGAACTTTTTGCAGGGTTGGGATAATGCCACCATAGCAGGAGCTGTTGTT
JMFS069H08+ GCCACAATTGGGAACTTTTTGCAGGGTTGGGATAATGCCACCATAGCAGGAGCTGTTGTT
JMFS025F06+ GCCACAATTGGGAACTTTTTGCAGGGTTGGGATAATGCCACCATAGCAGGAGCTGTTGTT
JMSF021M10+ GCCACAATTGGGAACTTTTTGCAGGGTTGGGATAATGCCACCATAGCAGGAGCTGTTGTT
JMFS025C05+ GCCACAATTGGGAACTTTTTGCAGGGTTGGGATAATGCCACCATAGCAGGAGCTGTTGTT
JMFS064E12+ GCCACAATTGGGAACTTTTTGCAGGGTTGGGATAATGCCACCATAGCAGGAGCTGTTGTT
JMFS081D08+ GCCACAATTGGGAACTTTTTGCAGGGTTGGGATAATGCCACCATAGCAGGAGCTGTTGTT
JMFS169A01+ GCCACAATTGGGAACTTTTTGCAGGGTTGGGATAATGCCACCATAGCAGGAGCTGTTGTT
JMFS139D03+ GCCACAATTGGGAACTTTTTGCAGGGTTGGGATAATGCCACCATAGCAGGAGCTGTTGTT
JMSF051J12+ GCCACAATTGGGAACTTTTTGCAGGGTTGGGATAATGCCACCATAGCAGGAGCTGTTGTT
JMFS094A04+ TGTTGTT
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consensus GCCACAATTGGGAACTTTTTGCAGGGTTGGGATAATGCCACCATAGCAGGAGCTGTTGTT

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JMFF002F08+ TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT
JMFF015K07+ TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT
JMFS069H08+ TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT
JMFS025F06+ TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT
JMSF021M10+ TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT
JMFS025C05+ TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT
JMFS064E12+ TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT
JMFS081D08+ TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT
JMFS169A01+ TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT
JMFS139D03+ TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT
JMSF051J12+ TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT
JMFS094A04+ TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT
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consensus TACATAAAGAAGGAGCTTGTTTTGGAAACTTATATGGAAGGGCTTGTGGTTGCCATGTCT

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JMFF002F08+ CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA
JMFF015K07+ CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA
JMFS069H08+ CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA
JMFS025F06+ CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA
JMSF021M10+ CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA
JMFS025C05+ CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA
JMFS064E12+ CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA
JMFS081D08+ CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA
JMFS169A01+ CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA
JMFS139D03+ CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA
JMSF051J12+ CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA
JMFS094A04+ CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA
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consensus CTCATTGGAGCCACGCTAATTACGACGTGTTCGGGATCCATAGCCGACTGGCTTGGTCGA

. : . : . : . : . : . :
JMFF002F08+ CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTTTATTTCCTGAGTG
JMFF015K07+ CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTTTATTTCCTGAGTG
JMFS069H08+ CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTNTATTTCCTGAGTGGTTTGATAATGTTGTGG
JMFS025F06+ CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTTTATTTCCTGAGTGGTTTGATAATGTTGTGG
JMSF021M10+ CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTTTATTTCCTGAGTGGTTTGATAATGTTGTGG
JMFS025C05+ CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTTTATTTCCTGAGTGGTTTGATAATGTTGTGG
JMFS064E12+ CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTTTATTTCCTGAGTGGTTTGATAATGTTGTGG
JMFS081D08+ CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTTTATTTCCTGAGTGGTTTGATAATGTTGTGG
JMFS169A01+ CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTTTATTTCCTGAGTGGTTTGATAATGTTGTGG
JMFS139D03+ CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTTTATTTCCTGAGTGGTTTGATAATGTTGTGG
JMSF051J12+ CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTTTATTTCCTGAGTGGTTTGATAATGTTGTGG
JMFS094A04+ CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTTTATTTCCTGAGTGGTTTGATAATGTTGTGG
____________________________________________________________
consensus CGCCCGATGCTCATTCTCTCGTCAATGTTTTATTTCCTGAGTGGTTTGATAATGTTGTGG

. : . : . : . : . : . :
JMFS069H08+ TCGCCTAATGTCTATGTCCTACTAATAGCGAGGCTTTTGGA
JMFS025F06+ TCGCCTAATGTCTATGTCCTACTAATAGCGAGGCTTTTGGATGGG
JMSF021M10+ TCGCCTAATGTCTATGTCCTACTAATAGCGAGGCTTTTGGATGGGTTCGGGATTGGATTG
JMFS025C05+ TCGCCTAATGTCTATGTCCTACTAATAGCGAGGCTTTTGGATGGGTTCGGGATTGGATTG
JMFS064E12+ TCGCCTAATGTCTATGTCCTACTAATAGCGAGGCTTTTGGATGGGTTCGGGATTGG
JMFS081D08+ TCGCCTAATGTCTATGTCCTACTAATAGCGAGGCTTTTGGATGGGTTCGGG
JMFS169A01+ TCGCCTAATGTCTATGTCCTACTAATAGCGAGGCTTTTGGATGGGTTCGGGATTGGATTG
JMFS139D03+ TCGCCTAATGTCTATGTCCTACTAATAGCGAGGCTTTTGGATGGGTTCGGGATTGGATTG
JMSF051J12+ TCGCCTAATGTCTATGTCCTACTAATAGCGAGGCTTTTGGATGGGTTCGGGATTGGATTG
JMFS094A04+ TCGCCTAATGTCTATGTCCTACTAATAGCGAGGCTTTTGGATGGGTTCGGGATTGGATTG
____________________________________________________________
consensus TCGCCTAATGTCTATGTCCTACTAATAGCGAGGCTTTTGGATGGGTTCGGGATTGGATTG

. : . : . : . : . : . :
JMSF021M10+ GCGGTTACTCTTGTCCCGCTCTATATATCGG
JMFS025C05+ GCGGT
JMFS169A01+ GCGGTTACTCTTGTCCCGCTCTATATATCGGAGACAGCACCGTCGGAGATTAGAGGATTG
JMFS139D03+ GCGGTTACTCTTGTCCCGCTCTATATATCGGAGACAGCACCGTCGGAGATTAGAGGATTG
JMSF051J12+ GCGGTTACTCTTGTCCCGCTCTATATATCGGAGACAGCACCGTCGGAGATTAGAGGATTG
JMFS094A04+ GCGGTTACTCTTGTCCCGCTCTATATATCGGAGACAGCACCGTCGGAGATTAGAGGATTG
____________________________________________________________
consensus GCGGTTACTCTTGTCCCGCTCTATATATCGGAGACAGCACCGTCGGAGATTAGAGGATTG

. : . : . : . : . : . :
JMFS169A01+ TTAAATACCCTTCCCCAATTTACCGGGTCGGGGGGGATGTTTTTGGCGTATTGTATGATT
JMFS139D03+ TTAAATACCCTTCCCCAATTTACCGGGTCGGGGGGGATGTTTTTGGCGT
JMSF051J12+ TTAAATACCCTTCCCCAATTTACCGGGTCGGGGGGGATGTTTTTGGCGTATTGTATGATT
JMFS094A04+ TTAAATACCCTTCCCCAATTTACCGGGTCGGGGGGGATGTTTTTGGCGTATTGTATGATT
____________________________________________________________
consensus TTAAATACCCTTCCCCAATTTACCGGGTCGGGGGGGATGTTTTTGGCGTATTGTATGATT

. : . : . : . : . : . :
JMFS169A01+ TTTGGAATGTCGGTGACGACAGCGCCGAGCTGGAGATTGATGCTCGGGGTTCTTTCGATC
JMSF051J12+ TTTGGAATGTCGGTGACGACAGCGCCGAGCTGGAGATTGATGCTCGGGGTTCTTTCGATC
JMFS094A04+ TTTGGAATGTCGGTGACGACAGCGCCGAGCTGGAGATTGATGCTCGGGGTTCTTTCGATC
____________________________________________________________
consensus TTTGGAATGTCGGTGACGACAGCGCCGAGCTGGAGATTGATGCTCGGGGTTCTTTCGATC

. : . : . : . : . : . :
JMFS169A01+ CCATCGCTTTTGTATTTTGCCCTAACTGTGTTTTATTTGCCCGAGT
JMSF051J12+ CCATCGCTTTTGTATTTTGCCCTAACTGTGTTTTATTTGCCCGAGTCTCCTCGATGGCTT
JMFS094A04+ CCATCGCTTTTGTATTTTGCCCTAACTGTGTTTTATTTGCCCGAGTCTCCTCGATGGCTT
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consensus CCATCGCTTTTGTATTTTGCCCTAACTGTGTTTTATTTGCCCGAGTCTCCTCGATGGCTT

. : . : . : . : . : . :
JMSF051J12+ GTTAGCAAAGGAAGGATGGTAGANGCCAAACGAGTTTT
JMFS094A04+ GTTAGCAAAGGAAGGATGGTAGAGGCCAAACGAGTTTTGCAGAAATTGCGTGGCAGAGAA
____________________________________________________________
consensus GTTAGCAAAGGAAGGATGGTAGAGGCCAAACGAGTTTTGCAGAAATTGCGTGGCAGAGAA

. : . : . : . : . : . :
JMFS094A04+ GATGTATCGGGAGAGATGGCTTTGCTCGTTAGAGGTCTTGCTGTTGG
____________________________________________________________
consensus GATGTATCGGGAGAGATGGCTTTGCTCGTTAGAGGTCTTGCTGTTGG