Alignment Contig 610

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMSF007G06+ GAAACCCTCCGCTGGGCACACTGCTAGTCGCCTGGTTTGCTCTAGCAACTACTTATCACT
JMSF004K05+ GTCGCCTGGTTTGCTCTAGCAACTACTTATCACT
JMSF001M06+ GTCGCCTGGTTTGCTCTAGCAACTACTTATCACT
JMSF037J14+ GTCGCCTGGTTTGCTCTAGCAACTACTTATCACT
JMSF032K05+ TCGCCTGGTTTGCTCTAGCAACTACTTATCACT
JMSF029C19+ GCCTGGTTTGCTCTAGCAACTACTTATCACT
JMFS087E10+ CAACTACTTATCACT
JMSF045N15+ CTGGTTTGCTCTAGCAACTACTTATCACT
____________________________________________________________
consensus GAAACCCTCCGCTGGGCACACTGCTAGTCGCCTGGTTTGCTCTAGCAACTACTTATCACT

. : . : . : . : . : . :
JMSF007G06+ TCACCATTGATTTCGCCGTCGTCAATGGCGGTCCCTTCAGACTCAGAAGCCGTTCCAGGA
JMSF004K05+ TCACCATTGATTTCGCCGTCGTCAATGGCGGTCCCTTCAGACTCAGAAGCCGTTCCAGGA
JMSF001M06+ TCACCATTGATTTCGCCGTCGTCAATGGCGGTCCCTTCAGACTCAGAAGCCGTTCCAGGA
JMSF037J14+ TCACCATTGATTTCGCCGTCGTCAATGGCGGTCCCTTCAGACTCAGAAGCCGTTCCAGGA
JMSF032K05+ TCACCATTGATTTCGCCGTCGTCAATGGCGGTCCCTTCAGACTCAGAAGCCGTTCCAGGA
JMSF029C19+ TCACCATTGATTTCGCCGTCGTCAATGGCGGTCCCTTCAGACTCAGAAGCCGTTCCAGGA
JMFS087E10+ TCACCATTGATTTCGCCGTCGTCAATGGCGGTCCCTTCAGACTCAGAAGCCGTTCCAGGA
JMSF045N15+ TCACCATTGATTTCGCCGTCGTCAATGGCGGTCCCTTCAGACTCAGAAGCCGTTCCAGGA
____________________________________________________________
consensus TCACCATTGATTTCGCCGTCGTCAATGGCGGTCCCTTCAGACTCAGAAGCCGTTCCAGGA

. : . : . : . : . : . :
JMSF007G06+ TCGGCGGCAACTCTCCGTCAAGCTTTCGGAAATGTCTTCTCGCTTTTAATTCTAATCCTC
JMSF004K05+ TCGGCGGCAACTCTCCGTCAAGCTTTCGGAAATGTCTTCTCGCTTTTAATTCTAATCCTC
JMSF001M06+ TCGGCGGCAACTCTCCGTCAAGCTTTCGGAAATGTCTTCTCGCTTTTAATTCTAATCCTC
JMSF037J14+ TCGGCGGCAACTCTCCGTCAAGCTTTCGGAAATGTCTTCTCGCTTTTAATTCTAATCCTC
JMSF032K05+ TCGGCGGCAACTCTCGGTCAAGCTTTCGGAAATGTCTTCTCGCTTTTAATTCTAATCCTC
JMSF029C19+ TCGGCGGCAACTCTCCGTCAAGCTTTCGGAAATGTCTTCTCGCTTTTAATTCTAATCCTC
JMFS087E10+ TCGGCGGCAACTCTCCGTCAAGCTTTCGGAAATGTCTTCTCGCTTTTAATTCTAATCCTC
JMSF045N15+ TCGGCGGCAACTCTCCGTCAAGCTTTCGGAAATGTCTTCTCGCTTTTAATTCTAATCCTC
____________________________________________________________
consensus TCGGCGGCAACTCTCCGTCAAGCTTTCGGAAATGTCTTCTCGCTTTTAATTCTAATCCTC

. : . : . : . : . : . :
JMSF007G06+ ATCGGCGTTATGGCTTTCTCGATCCGGCTGTTCTCGGTGATCAAGTATGAGAGCGTGATT
JMSF004K05+ ATCGGCGTTATGGCTTTCTCGATCCGGCTGTTCTCGGTGATCAAGTATGAGAGCGTGATT
JMSF001M06+ ATCGGCGTTATGGCTTTCTCGATCCGGCTGTTCTCGGTGATCAAGTATGAGAGCGTGATT
JMSF037J14+ ATCGGCGTTATGGCTTTCTCGATCCGGCTGTTCTCGGTGATCAAGTATGAGAGCGTGATT
JMSF032K05+ ATCGGCGTTATGGCTTTCTCGATCCGGCTGTTCTCGGTGATCAAGTATGAGAGCGTGATT
JMSF029C19+ ATCGGCGTTATGGCTTTCTCGATCCGGCTGTTCTCGGTGATCAAGTATGAGAGCGTGATT
JMFS087E10+ ATCGGCGTTATGGCTTTCTCGATCCGGCTGTTCTCGGTGATCAAGTATGAGAGCGTGATT
JMSF045N15+ ATCGGCGTTATGGCTTTCTCGATCCGGCTGTTCTCGGTGATCAAGTATGAGAGCGTGATT
____________________________________________________________
consensus ATCGGCGTTATGGCTTTCTCGATCCGGCTGTTCTCGGTGATCAAGTATGAGAGCGTGATT

. : . : . : . : . : . :
JMSF007G06+ CATGAGTTTGATCCTTATTTCAATTACAGAGTTACTCAGTTTCTGACAAAGAATGGGATA
JMSF004K05+ CATGAGTTTGATCCTTATTTCAATTACAGAGTTACTCAGTTTCTGACAAAGAATGGGATA
JMSF001M06+ CATGAGTTTGATCCTTATTTCAATTACAGAGTTACTCAGTTTCTGACAAAGAATGGGATA
JMSF037J14+ CATGAGTTTGATCCTTATTTCAATTACAGAGTTACTCAGTTTCTGACAAAGAATGGGATA
JMSF032K05+ CATGAGTTTGATCCTTATTTCAATTACAGAGTTACNCAGTTTCTGACAAAGAATGGGATA
JMSF029C19+ CATGAGTTTGATCCTTATTTCAATTACAGAGTTACTCAGTTTCTGACAAAGAATGGGATA
JMFS087E10+ CATGAGTTTGATCCTTATTTCAATTACAGAGTTACTCAGTTTCTGACAAAGAATGGGATA
JMSF045N15+ CATGAGTTTGATCCTTATTTCAATTACAGAGTTACTCAGTTTCTGACAAAGAATGGGATA
____________________________________________________________
consensus CATGAGTTTGATCCTTATTTCAATTACAGAGTTACTCAGTTTCTGACAAAGAATGGGATA

. : . : . : . : . : . :
JMSF007G06+ TATGACTTTTGGAATTGGTTTGACGATCGCACATGGTATCCCCTTGGACGTGTAATTGGT
JMSF004K05+ TATGACTTTTGGAATTGGTTTGACGATCGCACATGGTATCCCCTTGGACGTGTAATTGGT
JMSF001M06+ TATGACTTTTGGAATTGGTTTGACGATCGCACATGGTATCCCCTTGGACGTGTAATTGGT
JMSF037J14+ TATGACTTTTGGAATTGGTTTGACGATCGCACATGGTATCCCCTTGGACGTGTAATTGGT
JMSF032K05+ TATGACTTTTGGAATTGGTTTGACGATCGCACATGGTATCCCCTTGGACGTGTAATTGGT
JMSF029C19+ TATGACTTTTGGAATTGGTTTGACGATCGCACATGGTATCCCCTTGGACGTGTAATTGGT
JMFS087E10+ TATGACTTTTGGAATTGGTTTGACGATCGCACATGGTATCCCCTTGGACGTGTAATTGGT
JMSF045N15+ TATGACTTTTGGAATTGGTTTGACGATCGCACATGGTATCCCCTTGGACGTGTAATTGGT
____________________________________________________________
consensus TATGACTTTTGGAATTGGTTTGACGATCGCACATGGTATCCCCTTGGACGTGTAATTGGT

. : . : . : . : . : . :
JMSF007G06+ GGTACTGTTTATCCTGGACTTACATTGACAGC
JMSF004K05+ GGTACTGTTTATCCTGGACTTACATTGACAGCAGGCACTTTGTGGTGGATAT
JMSF001M06+ GGTACTGTTTATCCTGGACTTACATTGACAGCAGGCACTTTGTGGTGGATATTAAATTCT
JMSF037J14+ GGTACTGTTTATCCTGGACTTACATTGACAGCAGGCACTTTGTGGTGGATATTAAATTCT
JMSF032K05+ GGTACTGTTTATCCTGGACTTACATTGACAGCAGGCACTTTGTGGTGGATATTAAATTCT
JMSF029C19+ GGTACTGTTTATCCTGGACTTACATTGACAGCAGGCACTTTGTGGTGGATATTAAATTCT
JMFS087E10+ GGTACTGTTTATCCTGGACTTACATTGACAGCAGGCACTTTGTGGTGGATATTAAATTCT
JMSF045N15+ GGTACTGTTTATCCTGGACTTACATTGACAGCAGGCACTTTGTGGTGGATATTAAATTCT
____________________________________________________________
consensus GGTACTGTTTATCCTGGACTTACATTGACAGCAGGCACTTTGTGGTGGATATTAAATTCT

. : . : . : . : . : . :
JMSF001M06+ TTGAATATCCCTCTCTCTG
JMSF037J14+ TTGAATATCCCTCTCTCTGTTGAAACTGTGTGTGTATTTACCGCTCCAATTTTCTCTGCT
JMSF032K05+ TTGAATATCCCTCTCTCTGTTGAAACTGNGTGTGTATTTACCGCTCCNATTTTCTCTGCT
JMSF029C19+ TTGAATATCCCTCTCTCTGTTGAAACTGTGTGTGTATTTACCGCTCCAATTTTCTCTGCT
JMFS087E10+ TTGAATATCCCTCTCTCTGTTGAAACTTTGTGTGTATTTACCGCTCCAATTTTCTCTGCT
JMSF045N15+ TTGAATATCCCTCTCTCTGTTGAAACTGTGTGTGTATTTACCGCTCCAATTTTCTCTGCT
____________________________________________________________
consensus TTGAATATCCCTCTCTCTGTTGAAACTGTGTGTGTATTTACCGCTCCAATTTTCTCTGCT

. : . : . : . : . : . :
JMSF037J14+ TTTGCTTCTTGGGCAACCTACCTTTTGACAAAGGAAGTTAAGGGAACTGGTGCAGGGCTG
JMSF032K05+ TTTGCTTCTNGGGCAANCTACCTTTTGACAAAGGAAGTTAAGGGAACTGGTGCAGGGCTG
JMSF029C19+ TTTGCTTCTTGGGCAACCTACCTTTTGACAAAGGAAGTTAAGGGAACTGGTGCAGGGCTG
JMFS087E10+ TTTGCTTCTTGGGCAACCTACCTTTTGACAAAGGAAGTTAAGGGAACTGGTGCAGGGCTG
JMSF045N15+ TTTGCTTCTTGGGCAACCTACCTTTTGACAAAGGAAGTTAAGGGAACTGGTGCAGGGCTG
____________________________________________________________
consensus TTTGCTTCTTGGGCAACCTACCTTTTGACAAAGGAAGTTAAGGGAACTGGTGCAGGGCTG

. : . : . : . : . : . :
JMSF037J14+ ATGGCTGCTGCTCTTTTGGGGATGGTTCCTTCCTATATCTCTCGATCANTGGCTGGCAGC
JMSF032K05+ ATGGCTGCTGCTCTTTTGGGGATGGTTCCTTCCTATATCTCTCGATCAGTGGCTGGCAGC
JMSF029C19+ ATGGCTGCTGCTCTTTTGGGGATGGTTCCTTCCTATATCTCTCGATCAGTGGCTGGCAGC
JMFS087E10+ ATGGCTGCTGCTCTTTTGGGGATGGTTCCTTCCTATATCTCTCGATCAGTGGCTGGCAGC
JMSF045N15+ ATGGCTGCTGCTCTTTTGGGGATGGTTCCTTCCTATATCTCTCGATCAGTGGCTGGCAGC
____________________________________________________________
consensus ATGGCTGCTGCTCTTTTGGGGATGGTTCCTTCCTATATCTCTCGATCAGTGGCTGGCAGC

. : . : . : . : . : . :
JMSF037J14+ TATGACAATGAAGCTGTGGCTATATTTGCCTTGATTTTCACCTTTTATCTTTATATAAAG
JMSF032K05+ TATGACAATGAAGCTGTGGCTATAT
JMSF029C19+ TATGACAATGAAGCTGTGGCTATATTTGCCTTGATTTTCACCTTTTATCTTTATATAAAG
JMFS087E10+ TATGACAATGAAGCTGTGGCTATATTTGCCTTGATTNTCACCTTTTATCTTTATATAAAG
JMSF045N15+ TATGACAATGAAGCTGTGGCTATATTTGCCTTGATTTTCACCTTTTATCTTTATATAAAG
____________________________________________________________
consensus TATGACAATGAAGCTGTGGCTATATTTGCCTTGATTTTCACCTTTTATCTTTATATAAAG

. : . : . : . : . : . :
JMSF037J14+ ACAT
JMSF029C19+ ACATTAAATACAGGGTCCCTCTTTTATGCTACACTAAATGCCATTGCATACTTTTATATG
JMFS087E10+ ACATTAAATACAGGGTCCCT
JMSF045N15+ ACATTAAATACAGGGTCCCTCTTTTATGCTACACTAAATGCCATTGCATACTTTTATATG
____________________________________________________________
consensus ACATTAAATACAGGGTCCCTCTTTTATGCTACACTAAATGCCATTGCATACTTTTATATG

. : . : . : . : . : . :
JMSF029C19+ GTTGGCTCTT
JMSF045N15+ GTTTGCTCTTTGGGGAGGGTACACCTTTATTATCAACCTCATTCCAATGCACGCTCTTCT
____________________________________________________________
consensus GTTGGCTCTTTGGGGAGGGTACACCTTTATTATCAACCTCATTCCAATGCACGCTCTTCT

. : . : . : . : . : . :
JMSF045N15+ TTGCATTG
____________________________________________________________
consensus TTGCATTG