Alignment Contig 573

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consensus ACCGCCCGCGATCATGCTGCCGATAATAAGCGCGATTTTTTTCATCTCATTAAACCTGGG

. : . : . : . : . : . :
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consensus TTACTGGCTGACTTTAATATCCTGTAATAAAGAAAGGTTGCCCTGCTGGACAAAATTAAA

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JMSF004E10+ CGCCACTTTGTCGCCGGNTTTAATTTCACTCATTTTCGTCTGCGGGGTGATGGTAAAGCG
JMFF027C24+ CGCCACTTTGTCGCCGGTTTTAATTTCACTCATTTTCGTCTGCGGGGTGATGGTAAAGCG
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JMFF032O11+ CGCCACTTTGTCGCCGG
JMFF027I23+ CGCCACTTTGTCNCCGGNTTTAATTTCACTCATTTTC
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. : . : . : . : . : . :
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consensus GCTTTCCAGATCGATACCCTTTACCACGCCAGTGGCGCTAATAACCTGTGGTTGTGCTTC

. : . : . : . : . : . :
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JMSF002G09+ GCTCATGGTTTCATGATGATGTTCGTTAGCCTGGGCATTAAAGCCAATAACGGTAAACAG
JMSF024G09+ GCTCATGGTTTCATGATGATGTTCGTTAGCCTGGGCATTAAAGCCAATAACGGTAAACAG
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JMSF036I11+ GCTCATGGTTTCATGATGATGTTCGTTAGCCTGGGCATTAAAGCCAATAACGGTAAACAN
JMSF028O16+ GCTCATGGTTTCATGATGATGTTCGTTAGCCTGGGCATTAAAGCCAATAACGGTAAACAG
JMSF028H21+ GCTCATGGTTTCATGATGATGTTCGTTAGCCTGGGCATTAAAGCCAATAACGGTAAACAG
JMFF041D11+ GCTCATGGTTTCATGATGATGTTCGTTAGCCTGGGCATTAAAGCCAATAACGGTAAACAG
JMSF024O18+ GCTCATGGTTTCATGATGATGTTCG
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JMFF041D12+ GCTCATGGTTTCATGATGATGTTCGTTAGCCTGGGCATTAAAGCCAATAACGGTAAACAG
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JMFF041H13+ GCTCATGGTTTCATGATGATGTTCGTTAGCCTGGGCATTAAAGCCAATAACGGTAAACAG
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consensus GCTCATGGTTTCATGATGATGTTCGTTAGCCTGGGCATTAAAGCCAATAACGGTAAACAG

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JMSF041B20+ ACTGAACATTGCGACTTGCAGTGCTTTTTTCATTTATTCTCTCCTGGAGTTAAAAGTCAT
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consensus ACTGAACATTGCGACTTGCAGTGCTTTTTTCATTTATTCTCTCCTGGAGTTAAAAGTCAT

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JMSF041B20+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCANGAGCTTACAT
JMSF039P19+ ACTCTAAATAA
JMSF024G09+ ACTCTAAATAANTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCA
JMFF047J05+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMSF036I11+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMSF028O16+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMSF028H21+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF041D11+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF049P12+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF047H21+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF047H10+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF045H04+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF050L20+ ACTCTANATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF051E19+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF043L17+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF043C03+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF049D24+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF049L16+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF041D12+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF041D05+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF041J01+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF041H13+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMFF041F22+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT
JMSF051B23+ ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCANGAGCTTACAT
____________________________________________________________
consensus ACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGACAAGCGAGTGAATCCCCAGGAGCTTACAT

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JMSF041B20+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF047J05+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMSF036I11+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMSF028O16+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMSF028H21+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACNAG
JMFF041D11+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF049P12+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACG
JMFF047H21+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF047H10+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF045H04+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF050L20+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF051E19+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF043L17+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF043C03+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF049D24+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF049L16+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF041D12+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF041D05+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF041J01+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF041H13+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMFF041F22+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
JMSF051B23+ AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG
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consensus AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCGAACGCAGACGCAGCACATGCAACTTGAAGTATGACGAG

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JMSF041B20+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATACAAAGAAATTTCGTTAACCTGACGGG
JMFF047J05+ TATATTGCTGTCAAC
JMSF036I11+ TATATTGCTGTCAACCGCCNCCAAGTGCGGTATACAAA
JMSF028O16+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTA
JMSF028H21+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATACAAAGAAATTTCGTT
JMFF041D11+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATACAAAGAAATTTCGTTAACCTGACGGG
JMFF047H21+ TATATTGCT
JMFF047H10+ TATATTGCTGTCAAC
JMFF045H04+ TATATTGCTGTCAACCGC
JMFF050L20+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCA
JMFF051E19+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCG
JMFF043L17+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGT
JMFF043C03+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATA
JMFF049D24+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATACAAAGAAATTTCGTTAA
JMFF049L16+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATACAAAGAAATTTCGTTAACC
JMFF041D12+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATACAAAGAAATTTCGTTAACCTGACGGG
JMFF041D05+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATACAAAGAAATTTCGTTAACCTGACGGG
JMFF041J01+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATACAAAGAAATTTCGTTAACCTGACGGG
JMFF041H13+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATACAAAGAAATTTCGTTAACCTGACGGG
JMFF041F22+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATACAAAGAAATTTCGTTAACCTGACGGG
JMSF051B23+ TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATACAAAGAAATTTCGTTAACCTGACGGG
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consensus TATATTGCTGTCAACCGCCACCAAGTGCGGTATACAAAGAAATTTCGTTAACCTGACGGG

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JMSF041B20+ CATAATTCAGATCAAGTAAAGTTTGTCGGGTTGCAAATAAAGAACGCTCGGCATCCAGCA
JMFF041D11+ CATAA
JMFF041D05+ CATA
JMFF041J01+ CATAA
JMFF041H13+ CATAA
JMFF041F22+ CATAA
JMSF051B23+ CATAATTCAGATCANGTAAAGTTTGT
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consensus CATAATTCAGATCAAGTAAAGTTTGTCGGGTTGCAAATAAAGAACGCTCGGCATCCAGCA

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JMSF041B20+ CTTCCAGATAACTTACTGCNCCGTGCTGATATAATGCCCGCGCCCGTTGCAAAGTAATTT
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consensus CTTCCAGATAACTTACTGCNCCGTGCTGATATAATGCCCGCGCCCGTTGCAAAGTAATTT

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JMSF041B20+ GCAGCG
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consensus GCAGCG