Alignment Contig 520

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMFS150E12+ AAGCTTAAGCTTAATGCTTCTCTCTATTTCTGTCCATCTGCCAATAGAGCAATATCTCTC
JMFF008P23+ ATCTCTC
JMFS050A08+ CTCTC
JMFS039E04+ TTCTCTCTATTTCTGTCCATCTGCCAATAGAGCAATATCTCTC
JMFS100B09+ ATCTCTC
____________________________________________________________
consensus AAGCTTAAGCTTAATGCTTCTCTCTATTTCTGTCCATCTGCCAATAGAGCAATATCTCTC

. : . : . : . : . : . :
JMFS150E12+ TCTCTCTCTCTCTCTCTATCGCTCTCTCTCTCTACTGTGCAGTCATCTACGCGTCTGGTT
JMFF008P23+ TCTCTCTCTCTCTCTCTATCGCTCTCTCTCTCTACTGTGCAGTCATCTACGCGTCTGGTT
JMFS050A08+ TCTCTCTCTCTCTCTCTATCGCTCTCTCTCTCTACTGTGCAGTCNTCTACGCGTCTGGTT
JMFS039E04+ TCTCTCTCTCTCTCTCTATCGCTCTCTCTCTCTACTGTGCAGTCATCTACGCGTCTGGTT
JMFS100B09+ TCTCTCTCTCTCTCTCTATCGCTCTCTCTCTCTACTGTGCAGTCATCTACGCGTCTGGTT
JMFS106B11+ TCTATCGCTCTCTCTCTCTACTGTGCAGTCATCTACGCGTCTGGTT
____________________________________________________________
consensus TCTCTCTCTCTCTCTCTATCGCTCTCTCTCTCTACTGTGCAGTCATCTACGCGTCTGGTT

. : . : . : . : . : . :
JMFS150E12+ TTGGTTGTCCTTCCAGTTGAAATTGACCAAATCTACTGCTGCATTTAGCTAGGAGACCCG
JMSF019H18+ AGTTGAAATTGACCAAATCTACTGCTGCATTTAGCTAGGAGACCCG
JMFF008P23+ TTGGNTGTCCTTCCAGTTGAAATTGACCAAATCTACTGCTGCATTTAGCTAGGAGACCCG
JMFS050A08+ TTGGTTGTCCTTCCAGTTGAAATTGACCAAATCTACTGCTGCATTTANCTAGGAGACCCG
JMFS039E04+ TTGGTTGTCCTTCCAGTTGAAATTGACCAAATCTACTGCTGCATTTAGCTAGGAGACCCG
JMFS100B09+ TTGGTTGTCCTTCCAGTTGAAATTGACCAAATCTACTGCTGCATTTAGCTAGGAGACCCG
JMFS106B11+ TTGGTTGTCCTTCCAGTTGAAATTGACCAAATCTACTGCTGCATTTAGCTAGGAGACCCG
____________________________________________________________
consensus TTGGTTGTCCTTCCAGTTGAAATTGACCAAATCTACTGCTGCATTTAGCTAGGAGACCCG

. : . : . : . : . : . :
JMFS150E12+ AAGAAAGCTGTTGCCGGAGAGTTTTTGAGTCTTGCCGTAGTAGTTCTTCGGCTGAGCTCC
JMSF019H18+ AAGAAAGCTGTTGCCGGAGAGTTTTTGAGTCTTGCCGTAGTAGTTCTTCGGCTGAGCTCC
JMFF008P23+ AAGAAAGCTGTTGCCGGAGAGTTTTTGAGTCTTGCCGTANTAGTTCTTCGGCTGAGCTCC
JMFS050A08+ AAGAAAGCTGTTGCCGGAGAGTTTTTGAGTCTTGCCGTAGTAGTTCTTCGGCTGAGCTCA
JMFS039E04+ AAGAAAGCTGTTGCCGGAGAGTTTTTGAGTCTTGCCGTAGTAGTTCTTCGGCTGAGCTCC
JMFS100B09+ AAGAAAGCTGTTGCCGGAGAGTTTTTGAGTCTTGCCGTAGTAGTTCTTCGGCTGAGCTCC
JMFS106B11+ AAGAAAGCTGTTGCCGGAGAGTTTTTGAGTCTTGCCGTAGTAGTTCTTCGGCTGAGCTCC
____________________________________________________________
consensus AAGAAAGCTGTTGCCGGAGAGTTTTTGAGTCTTGCCGTAGTAGTTCTTCGGCTGAGCTCC

. : . : . : . : . : . :
JMFS150E12+ CTGGCAATGTGGAAGCTCCGCTCGATCTTCAACCTCTTGCTTCTCTGCTCCGCCGTGACA
JMSF019H18+ CTGGCAATGTGGAAGCTCCGCTCGATCTTCAACCTCTTGCTTCTCTGCTCCGCCGTGACA
JMFF008P23+ CTGGCAATGTGGAAGCTCCGCTCGATCTTCAACCTCTTGCTTCTCTGCTCCGCCGTGACA
JMFS050A08+ CTGGCAATGTGGAAGCTCCGCTCGATCTTCAACCTCTTGCTTCTCTGCTCCGCCGTGACA
JMFS039E04+ CTGGCAATGTGGAAGCTCCGCTCGATCTTCAACCTCTTGCTTCTCTGCTCCGCCGTGACA
JMFS100B09+ CTGGCAATGTGGAAGCTCCGCTCGATCTTCAACCTCTTGCTTCTCTGCTCCGCCGTGACA
JMFS106B11+ CTGGCAATGTGGAAGCTCCGCTCGATCTTCAACCTCTTGCTTCTCTGCTCCGCCGTGACA
____________________________________________________________
consensus CTGGCAATGTGGAAGCTCCGCTCGATCTTCAACCTCTTGCTTCTCTGCTCCGCCGTGACA

. : . : . : . : . : . :
JMFS150E12+ TTGGTCGCTGCTCAAGGATCTACTAACAGTACCTCGAAATGGCAAACGCTTAGCGGAGAT
JMSF019H18+ TTGGTCGCTGCTCAAGGATCTACTAACAGTACCTCGAAATGGCAAACGCTTAGCGGAGAT
JMFF008P23+ TTGGTCGCTGCTCAAGGATCTACTAACAGTACCTCGAAATGGCAAACGCTTAGCGGAGAT
JMFS050A08+ TTGGTCGCTGCTCAAGGATCTACTAACAGTACCTCGAAATGGCAAACGCTTAGCGGAGAT
JMFS039E04+ TTGGTCGCTGCTCAAGGATCTACTAACAGTACCTCGAAATGGCAAACGCTTAGCGGAGAT
JMFS100B09+ TTGGTCGCTGCTCAAGGATCTACTAACAGTACCTCGAAATGGCAAACGCTTAGCGGAGAT
JMFS106B11+ TTGGTCGCTGCTCAAGGATCTACTAACAGTACCTCGAAATGGCAAACGCTTAGCGGAGAT
____________________________________________________________
consensus TTGGTCGCTGCTCAAGGATCTACTAACAGTACCTCGAAATGGCAAACGCTTAGCGGAGAT

. : . : . : . : . : . :
JMFS150E12+ GCACCCTTAGTCATTGCTCGTGGTGGATTTTCAGGGTTATTCCCCGACTCCAGCTTTAAT
JMSF019H18+ GCACCCTTAGTCATTGCTCGTGGTGGATTTTCAGGGTTATTCCCCGACTCCAGCTTTAAT
JMFF008P23+ GCACCCTTAGTCATTGCTCGTGGNGGATTTTCAGGGTTATTCCCCGACTCCAGCTTTAAT
JMFS050A08+ GCACCCTTAATCATTGCTCGAGGTGGATTTTCAGGGTTAATCCCCGACTCCAGCTATAAT
JMFS039E04+ GCACCCTTAGTCATTGCTCGTGGTGGATTTTCAGGGTTATTCCCCGACTCCAGCTTTAAT
JMFS100B09+ GCACCCTTAGTCATTGCTCGTGGTGGATTTTCAGGGTTATTCCCCGACTCCAGCTTTAAT
JMFS106B11+ GCACCCTTAGTCATTGCTCGTGGTGGATTTTCAGGGTTATTCCCCGACTCCAGCTTTAAT
JMSF050D18+ TGGTGGATTTTCAGGGTTATTCCCCGACTCCAGCTTTAAT
____________________________________________________________
consensus GCACCCTTAGTCATTGCTCGTGGTGGATTTTCAGGGTTATTCCCCGACTCCAGCTTTAAT

. : . : . : . : . : . :
JMFS150E12+ GCATACAGTTTCGCTGGGTTGACTAGCTTAACTAATGTGATTATGTGGTGTGATGTACAA
JMSF019H18+ GCATACAGTTTCGCTGGGTTGACTAGCTTAACTAATGTGATTATGTGGTGTGATGTACAA
JMFF008P23+ GCATACAGTTTCGCTGGGNTGACTAGCTTAACTANTGTGATTATGTGGTGTGATGTACAA
JMFS050A08+ GCATACAGATTCGCTGGGTTGACTAGCTTAACTAATGTGATTATGTGGTGTGATGTACTA
JMFS039E04+ GCATACAGTTTCGCTGGGTTGACTAGCTTAACTAATGTGATTATGTGGTGTGATGTACAA
JMFS100B09+ GCATACAGTTTCGCTGGGTTGACTAGCTTAACTAATGTGATTATGTGGTGTGATGTACAA
JMFS106B11+ GCATACAGTTTCGCTGGGTTGACTAGCTTAACTAATGTGATTATGTGGTGTGATGTACAA
JMSF050D18+ GCATACAGTTTCGCTGGGTTGACTAGCTTAACTAATGTGATTATGTGGTGTGATGTACAA
____________________________________________________________
consensus GCATACAGTTTCGCTGGGTTGACTAGCTTAACTAATGTGATTATGTGGTGTGATGTACAA

. : . : . : . : . : . :
JMFS150E12+ CTAACAAAAGATGGAGTTGGAATCTGCTTTCCAGATATCAAGCTTGATAATGCCTCCAAC
JMSF019H18+ CTAACAAAAGATGGAGTTGGAATCTGCTTTCCAGATATCAAGCTTGATAATGCCTCCAAC
JMFF008P23+ CTAACAAAAGATGGAGTTGGAATCTGCTTTCCAGATATCAAGCTTGATAATGCCTCCAAC
JMFS050A08+ CTAACAAAAGATGGAGTTGGAATCTGCTTTCCAGATATCAAGCTTGATAATGCCTACAAC
JMFS039E04+ CTAACAAAAGATGGAGTTGGAATCTGCTTTCCAGATATCAAGCTTGATAATGCCTCCAAC
JMFS100B09+ CTAACAAAAGATGGAGTTGGAATCTGCTTTCCAGATATCAAGCTTGATAATGCCTCCAAC
JMFS106B11+ CTAACAAAAGATGGAGTTGGAATCTGCTTTCCAGATATCAAGCTTGATAATGCCTCCAAC
JMSF050D18+ CTAACAAAAGATGGAGTTGGAATCTGCTTTCCAGATATCAAGCTTGATAATGCCTCCAAC
JMSF048H03+ GCTTGATAATGCCTCCAAC
____________________________________________________________
consensus CTAACAAAAGATGGAGTTGGAATCTGCTTTCCAGATATCAAGCTTGATAATGCCTCCAAC

. : . : . : . : . : . :
JMFS150E12+ GTTGCTACACTCTTCAAAGATAAGCAGAGTACCTACCTTGTGAATGGGGTTCCAACGACG
JMSF019H18+ GTTGCTACACTCTTCAAAGATAAGCAGAGTACCTACCTTGTGAA
JMFF008P23+ GTTGCTACACTCTTCAAA
JMFS050A08+ GTTGCTACACTCTTCAAAGATGAGCAGAGTNCCTACCTTGTGAATGGG
JMFS039E04+ GTTGCTACACTCTTCAAAGATAAGCAGAGTACCTACCTTGTGAATGGGGTTCCAACGACG
JMFS100B09+ GTTGCTACACTCTTCAAAGATAAGCAGAGTACCTACCTTGTGAATGGGGTTCCAACGACG
JMFS106B11+ GTTGCTACACTCTTCAAAGATAAGCAGAGTACCTACCTTGTGAATGGGGTTCCAACGACG
JMSF050D18+ GTTGCTACACTCTTCAAAGATAAGCAGAGTACCTACCTTGTGAATGGGGTTCCAACGACG
JMSF048H03+ GTTGCTACACTCTTCAAAGATAAGCAGAGTACCTACCTTGTGAATGGGGTTCCAACGACG
____________________________________________________________
consensus GTTGCTACACTCTTCAAAGATAAGCAGAGTACCTACCTTGTGAATGGGGTTCCAACGACG

. : . : . : . : . : . :
JMFS150E12+ GCATGG
JMFS039E04+ GCATGGTTTCC
JMFS100B09+ GCATGGTTTCCCATAGATTTTAATTTCAAGCAGCTGACGCTTGTCAATTTGCAACAAGGA
JMFS106B11+ GCATGGTTTCCCATAGATTTTAATTTCAAGCAGCTGACGCTTGTCAATTTGCAACAAGGA
JMSF050D18+ GCATGGTTTCCCATAGATTTTAATTTCAAGCAGCTGACGCTTGTCAATTTGCAACAAGGA
JMSF048H03+ GCATGGTTTCCCATAGATTTTAATTTCAAGCAGCTGACGCTTGTCAATTTGCAACAAGGA
____________________________________________________________
consensus GCATGGTTTCCCATAGATTTTAATTTCAAGCAGCTGACGCTTGTCAATTTGCAACAAGGA

. : . : . : . : . : . :
JMFS100B09+ GTTTATTCTCGATCAA
JMFS106B11+ GTTTATTCTCGATCAAGTAGATTTGATGGC
JMSF050D18+ GTTTATTCTCGATCAAGTAGATTTGATGGCACCCCGCAGCAGATTCTTACTGTCGAAGAT
JMSF048H03+ GTTTATTCTCGATCAAGTAGATTTGATGGCACCCCGCAGCAGATTCTTACTGTCGAAGAT
____________________________________________________________
consensus GTTTATTCTCGATCAAGTAGATTTGATGGCACCCCGCAGCAGATTCTTACTGTCGAAGAT

. : . : . : . : . : . :
JMSF050D18+ GTGTTTAATAAAGTCCAACCTCCAGGGTTATGGTTGAATGTTCAGCATGATTCCTTCTAT
JMSF048H03+ GTGTTTAATAAAGTCCAACCTCCAGGGTTATGGTTGAATGTTCAGCATGATTCCTTCTAT
JMFF039F05+ CTAT
JMFF010E09+ CTAT
JMFF043O10+ CTAT
____________________________________________________________
consensus GTGTTTAATAAAGTCCAACCTCCAGGGTTATGGTTGAATGTTCAGCATGATTCCTTCTAT

. : . : . : . : . : . :
JMSF050D18+ AGCCAACACAATCTGAGTATGAGAACCTTTGTTCTTAGTGTATCTAGAAGGGTTGTTATT
JMSF048H03+ AGCCAACACAATCTGAGTATGAGAACCTTTGTTCTTAGTGTATCTAGAAGGGTTGTTATT
JMFF039F05+ AGCCAACACAATCTGAGTATGAGAACCTTTGTTCTTAGTGTATCTAGAAGGGTTGTTATT
JMFF010E09+ AGCCAACACAATCTGAGTATGAGAACCTTTGTTCTTAGTGTATCTAGAAGGGTTGTTATT
JMFF043O10+ AGCCAACACAATCTGAGTATGAGAACCTTTGTTCTTAGTGTATCTAGAAGGGTTGTTATT
____________________________________________________________
consensus AGCCAACACAATCTGAGTATGAGAACCTTTGTTCTTAGTGTATCTAGAAGGGTTGTTATT

. : . : . : . : . : . :
JMSF050D18+ AACTACATTTCATCACCTGAAGTGAACTTCTTGAAAAGTATTGCATCACGAATCAATCCA
JMSF048H03+ AACTACATTTCATCACCTGAAGTGAACTTCTTGAAAAGTATTGCATCACGAATCAATCCA
JMFF039F05+ AACTACATTTCATCACCTGAAGTGAACTTCTTGAAAAGTATTGCATCACGAATCAATCCA
JMFF010E09+ AACTACATTTCATCACCTGAAGTGAACTTCTTGAAAAGTATTGCATCACGAATCAATCCA
JMFF043O10+ AACTACATTTCATCACCTGAAGTGAACTTCTTGAAAAGTATTGCATCACGAATCAATCCA
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consensus AACTACATTTCATCACCTGAAGTGAACTTCTTGAAAAGTATTGCATCACGAATCAATCCA

. : . : . : . : . : . :
JMSF050D18+ AGAGTGACAAAACTAGTTTTCCGATTTCTTGGAAATGATGAAACTGAACCTTCAACCAAC
JMSF048H03+ AGAGTGACAAAACTAGTTTTCCGATTTCTTGGAAATGATGAAACTGAACCTTCAACCAAC
JMFF039F05+ AGAGTGACAAAACTAGTTTTCCGATTTCTTGGAAATGATGAAACTGAACCTTCAACCAAC
JMFF010E09+ AGAGTGACAAAACTAGTTTTCCGATTTCTTGGAAATGATGAAACTGAACCTTCAACCAAC
JMFF043O10+ AGAGTGACAAAACTAGTTTTCCGATTTCTTGGAAATGATGAAACTGAACCTTCAACCAAC
____________________________________________________________
consensus AGAGTGACAAAACTAGTTTTCCGATTTCTTGGAAATGATGAAACTGAACCTTCAACCAAC

. : . : . : . : . : . :
JMSF050D18+ CAAACATATGGATCTCTGTTACAGAATCTTGCTTCTATTAAAACCTTTGCCTCAGGGATC
JMSF048H03+ CAAACATATGGATCTCTGTTACAGAATCTTGCTTCTATTAAAACCTTTGCCTCAGGGATC
JMFF039F05+ CAAACATATGGATCTCTGTTACAGAATCTTGCTTCTATTAAAACCTTTGCCTCAGGGATC
JMFF010E09+ CAAACATATGGATCTCTGTTACAGAATCTTGCTTCTATTAAAACCTTTGCCTCAGGGATC
JMFF043O10+ CAAACATATGGATCTCTGTTACAGAATCTTGCTTCTATTAAAACCTTTGCCTCAGGGATC
____________________________________________________________
consensus CAAACATATGGATCTCTGTTACAGAATCTTGCTTCTATTAAAACCTTTGCCTCAGGGATC

. : . : . : . : . : . :
JMSF050D18+ CTCGTACCTAAAAGTTATATCTGGCCAGTGGACAAGTCTTCCTCCTATCTACAGCCTACT
JMSF048H03+ CTCGTACCTAAAAGTTATATCTGGCCAGTGGACAAGTCTTCCTCCTATCTACAGCCTACT
JMFF039F05+ CTCGTACCTAAAAGTTATATCTGGCCAGTGGACAAGTCTTCCTCCTATCTACAGCCTACT
JMFF010E09+ CTCGTACCTAAAAGTTATATCTGGCCAGTGGACAAGTCTTCCTCCTATCTACAGCCTACT
JMFF043O10+ CTCGTACCTAAAAGTTATATCTGGCCAGTGGACAAGTCTTCCTCCTATCTACAGCCTACT
____________________________________________________________
consensus CTCGTACCTAAAAGTTATATCTGGCCAGTGGACAAGTCTTCCTCCTATCTACAGCCTACT

. : . : . : . : . : . :
JMSF050D18+ ACATCTCTTGTACT
JMSF048H03+ ACATCTCTTGTACTGGATGCTCATAAAGTGGGCCTAGAAGTTTATGCCTCAGACTTTGCC
JMFF039F05+ ACATCTCTTGTACTGGATGCTCATAAAGTGGGCCTAGAAGTTTATGCCTCAGACTTTGCC
JMFF010E09+ ACATCTCTTGTACTGGATGCTCATAAAGTGGGCCTAGAAGTTTATGCCTCAGACTTTGCC
JMFF043O10+ ACATCTCTTGTACTGGATGCTCATAAAGTGGGCCTAGAAGTTTATGCCTCAGACTTTGCC
____________________________________________________________
consensus ACATCTCTTGTACTGGATGCTCATAAAGTGGGCCTAGAAGTTTATGCCTCAGACTTTGCC

. : . : . : . : . : . :
JMSF048H03+ AGTGATGTTCCTTTTGCCTTCGATTACAGTTATGATCCTGTAGCAGAGTACCTTTCCTTC
JMFF039F05+ AGTGATGTTCCTTTTGCCTTCGATTACAGTTATGATCCTGTAGCAGAGTACCTTTCCTTC
JMFF010E09+ AGTGATGTTCCTTTTGCCTTCGATTACAGTTATGATCCTGTAGCAGAGTACCTTTCCTTC
JMFF043O10+ AGTGATGTTCCTTTTGCCTTCGATTACAGTTATGATCCTGTAGCAGAGTACCTTTCCTTC
____________________________________________________________
consensus AGTGATGTTCCTTTTGCCTTCGATTACAGTTATGATCCTGTAGCAGAGTACCTTTCCTTC

. : . : . : . : . : . :
JMSF048H03+ ATTGACAATGGGAACTATTCTG
JMFF039F05+ ATTGACAATGGGAACTATTCTGTGGATGGTGTGCTCTCTGACTTCCCAATAACACCATCA
JMFF010E09+ ATTGACAATGGGAACTATTCTGTGGATGGTGTGCTCTCTGACTTCCCAATAACACCATCA
JMFF043O10+ ATTGACAATGGGAACTATTCTGTGGATGGTGTGCTCTCTGACTTCCCAATAACACCATCA
____________________________________________________________
consensus ATTGACAATGGGAACTATTCTGTGGATGGTGTGCTCTCTGACTTCCCAATAACACCATCA

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JMFF039F05+ GGGGCGATAGACTGCTATTCTCATATGCGGAAGGGTCAAAAAAATCAAGTGCCTGAGTTT
JMFF010E09+ GGGGCGATAGACTGCTATTCTCATATGCGGAAGGGTCAAAAAAATCAAGTGCCTGAGTTT
JMFF043O10+ GGGGCGATAGACTGCTATTCTCATATGCGGAAGGGTCAAAAAAATCAAGTGCCTGAGTTT
____________________________________________________________
consensus GGGGCGATAGACTGCTATTCTCATATGCGGAAGGGTCAAAAAAATCAAGTGCCTGAGTTT

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JMFF039F05+ CTGGTTATCTCATTTGATGGAGCAAGTGGGGACTATCCTGGTTGTACTGAC
JMFF010E09+ CTGGTTATCTCATTTGATGGAGCAAGTGGGGACTATCCTGGNTGTACTGAC
JMFF043O10+ CTGGTTATCTCATTTGATGGAGCAAGTGGGGACTATCCTGGTTGTACTGACNAGGCATAT
____________________________________________________________
consensus CTGGTTATCTCATTTGATGGAGCAAGTGGGGACTATCCTGGTTGTACTGACNAGGCATAT

. : . : . : . : . : . :
JMFF043O10+ TCGAAAGCAGTTTCTGATGGCGTAGATATTATTGACTGTACTG
____________________________________________________________
consensus TCGAAAGCAGTTTCTGATGGCGTAGATATTATTGACTGTACTG