Alignment Contig 5133

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMSF028G21+ GGGATGGTGGGTGGTGACAGGTAGTGGTGGAGGTTTCTTGACTTTCTTCCCAGAGAGGGA
JMSF004F14+ ATGGTGGGTGGTGACAGGTAGTGGTGGAGGTTTCTTGACTTTCTTCCCAGAGAGGGA
JMSF001J21+ GGAGGTTTCTTGACTTTCTTCCCAGAGAGGGA
JMSF018O08+ GGAGGTTTCTTGACTTTCTTCCCAGAGAGGGA
JMFS076B05+ CTTTCTTCCCAGAGAGGGA
JMFS164B02+ TTCTTCCCAGAGAGGGA
JMFS140B09+ CTTTCTTCCCAGAGAGGGA
____________________________________________________________
consensus GGGATGGTGGGTGGTGACAGGTAGTGGTGGAGGTTTCTTGACTTTCTTCCCAGAGAGGGA

. : . : . : . : . : . :
JMSF028G21+ ATATGCTACGCTATTAATCTTTAATCCCTTCAGTTTAAATGGTTCCCCTTCCCCGCAAAC
JMSF004F14+ ATATGCTACGCTATTAATCTTTAATCCCTTCAGTTTAAATGGTTCCCCTTCCCCGCAAAC
JMSF001J21+ ATATGCTACGCTATTAATCTTTAATCCCTTCAGTTTAAATGGTTCCCCTTCCCCGCAAAC
JMSF018O08+ ATATGCTACGCTATTAATCTTTAATCCCTTCAGTTTAAATGGTTCCCCTTCCCCGCAAAC
JMFS076B05+ ATATGCTACGCTATTAATCTTTAATCCCTTCAGTTTAAATGGTTCCCCTTCCCCGCAAAC
JMFS164B02+ ATATGCTACGCTATTAATCTTTAATCCCTTCAGTTTAAATGGTTCCCCTTCCCCGCAAAC
JMFS140B09+ ATATGCTACGCTATTAATCTTTAATCCCTTCAGTTTAAATGGTTCCCCTTCCCCGCAAAC
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consensus ATATGCTACGCTATTAATCTTTAATCCCTTCAGTTTAAATGGTTCCCCTTCCCCGCAAAC

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JMSF028G21+ ATCCTGGATAATACGCTGACTCGATTCCGTGATCCATAATTCCTACTTTTCAAAATTTTC
JMSF004F14+ ATCCTGGATAATACGCTGACTCGATTCCGTGATCCATAATTCCTACTTTTCAAAATTTTC
JMSF001J21+ ATCCTGGATAATACGCTGACTCGATTCCGTGATCCATAATTCCTACTTTTCAAAATTTTC
JMSF018O08+ ATCCTGGATAATACGCTGACTCGATTCCGTGATCCATAATTCCTACTTTTCAAAATTTTC
JMFS076B05+ ATCCTGGATAATACGCTGACTCGATTCCGTGATCCATAATTCCTACTTTTCAAAATTTTC
JMFS164B02+ ATCCTGGATAATACGCTGACTCGATTCCGTGATCCATAATTCCTACTTTTCAAAATTTTC
JMFS140B09+ ATCCTGGATAATACGCTGACTCGATTCCGTGATCCATAATTCCTACTTTTCAAAATTTTC
JMFS124F08+ TTCCGTGATCCATAATTCCTACTTTTCAAAATTTTC
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consensus ATCCTGGATAATACGCTGACTCGATTCCGTGATCCATAATTCCTACTTTTCAAAATTTTC

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JMSF028G21+ TTTTGTACATTTCATTTTATATACATGTGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACACGA
JMSF004F14+ TTTTGTACATTTCATTTTATATACATGTGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACACGA
JMSF001J21+ TTTTGTACATTTCATTTTATATACATGTGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACACGA
JMSF018O08+ TTTTGTACATTTCATTTTATATACATGTGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACACGA
JMFS076B05+ TTTTGTACATTTCATTTTATATACATGTGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACACGA
JMFS164B02+ TTTTGTACATTTCATTTTATATACATGTGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACACGA
JMFS140B09+ TTTTGTACATTTCATTTTATATACATGTGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACACGA
JMFS124F08+ TTTTGTACATTTCATTTTATATACATGTGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACACGA
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consensus TTTTGTACATTTCATTTTATATACATGTGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACACGA

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JMSF028G21+ AGACCCAGCTGCTTCCTTCTTCCTCGCCCTCTACCTATCTGCAATTTTACCAGTTGCTGC
JMSF004F14+ AGACCCAGCTGCTTCCTTCTTCCTCGCCCTCTACCTATCTGCAATTTTACCAGTTGCTGC
JMSF001J21+ AGACCCAGCTGCTTCCTTCTTCCTCGCCCTCTACCTATCTGCAATTTTACCAGTTGCTGC
JMSF018O08+ AGACCCAGCTGCTTCCTTCTTCCTCGCCCTCTACCTATCTGCAATTTTACCAGTTGCTGC
JMFS076B05+ AGACCCAGCTGCTTCCTTCTTCCTCGCCCTCTACCTATCTGCAATTTTACCAGTTGCTGC
JMFS164B02+ AGACCCAGCTGCTTCCTTCTTCCTCGCCCTCTACCTATCTGCAATTTTACCAGTTGCTGC
JMFS140B09+ AGACCCAGCTGCTTCCTTCTTCCTCGCCCTCTACCTATCTGCAATTTTACCAGTTGCTGC
JMFS124F08+ AGACCCAGCTGCTTCCTTCTTCCTCGCCCTCTACCTATCTGCAATTTTACCAGTTGCTGC
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consensus AGACCCAGCTGCTTCCTTCTTCCTCGCCCTCTACCTATCTGCAATTTTACCAGTTGCTGC

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JMSF028G21+ TTGTGAAGTGAATTGATCACAAAGATTTGGAATCAAGTGAAGAGACTGAAATTCAGGGCT
JMSF004F14+ TTGTGAAGTGAATTGATCACAAAGATTTGGAATCAAGTGAAGAGACTGAAATTCAGGGCT
JMSF001J21+ TTGTGAAGTGAATTGATCACAAAGATTTGGAATCAAGTGAAGAGACT
JMSF018O08+ TTGTGAAGTGAATTGATCACAAAGATTTGGAATCAAGTGAAGAGACTGAAATTCAGGGCT
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JMFS164B02+ TTGTGAAGTGAATTGATCACAAAGATTTGGAATCAAGTGAAGAGACTGAAATTCAGGGCT
JMFS140B09+ TTGTGAAGTGAATTGATCACAAAGATTTGGAATCAAGTGAAGAGACTGAAATTCAGGGCT
JMFS124F08+ TTGTGAAGTGAATTGATCACAAAGATTTGGAATCAAGTGAAGAGACTGAAATTCAGGGCT
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consensus TTGTGAAGTGAATTGATCACAAAGATTTGGAATCAAGTGAAGAGACTGAAATTCAGGGCT

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JMSF028G21+ GCAAAAATGGGTTCTGATAAGCAGTCAGCTGGTTTACTAGATACCCTTAATATGCAGAAA
JMSF004F14+ GCAAAAATGGGTTCTGATAAGCAGTCAGCTGGTTTACTAGATACCCTTAATATGCAGAAA
JMSF018O08+ GCAAAAATGGGTTCTGATAAGCAGTCAGCTGGTTTACTAGATACCCTTAATATGCAGAAA
JMFS076B05+ GCAAAAATGGGTTCTGATAAGCAGTCAGCTGGTTTACTAGATACCCTTAATATGCAGAAA
JMFS164B02+ GCAAAAATGGGTTCTGATAAGCAGTCAGCTGGTTTACTAGATACCCTTAATATGCAGAAA
JMFS140B09+ GCAAAAATGGGTTCTGATAAGCAGTCAGCTGGTTTACTAGATACCCTTAATATGCAGAAA
JMFS124F08+ GCAAAAATGGGTTCTGATAAGCAGTCAGCTGGTTTACTAGATACCCTTAATATGCAGAAA
JMFS082F11+ TCTGATAAGCAATCCACTGGTTTGCTTGATACCCTTAATATGGATACA
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consensus GCAAAAATGGGTTCTGATAAGCAGTCAGCTGGTTTACTAGATACCCTTAATATGCAGAAA

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JMSF028G21+ GTCAGGACAATTTTAACTCATCCATACCCTTACCCACACGAGCACTCACGGCATCTTTTC
JMSF004F14+ GTCAGGACAATTTTAACTCATCCATACC
JMSF018O08+ GTCAGGACAATTTTAACTCATCCATACCCTTACCCACACGAGCACTCACGGCATCTTTTC
JMFS076B05+ GTCAGGACAATTTTAACTCATCCATACCCTTACCCACACGAGCACTCACGGCATCTTTTC
JMFS164B02+ GTCAGGACAATTTTAACTCATCCATACCCTTACCCACACGAGCACTCACGGCATCTTTTC
JMFS140B09+ GTCAGGACAATTTTAACTCATCCATACCCTTACCCACACGAGCACTCACGGCATCTTTTC
JMFS124F08+ GTCAGGACAATTTTAACTCATCCATACCCTTACCCACACGAGCACTCACGGCATCTTTTC
JMFS082F11+ GTTAGGACAATCCTAACGCATCCATACCCCTATCCACATGAGCATTCACGGCACTTTGTC
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consensus GTCAGGACAATTTTAACTCATCCATACCCTTACCCACACGAGCACTCACGGCATCTTTTC

. : . : . : . : . : . :
JMSF028G21+ ATTGCTGTGGTTGTGGGTTGCCTATTTTTCATATCATCAGATAATATGCACACTCTTATC
JMSF018O08+ ATTGCTGTGGNTGTGGGTTGCCTATTTTTCATATCATCAGATAATATGCACA
JMFS076B05+ ATTGCTGTGGTTGTGGGTTGCCTATTTTTCATATCATCAGATAATATGCACACTCTTATC
JMFS164B02+ ATTGCTGTGGTTGTGGGTTGCCTATTTTTCATATCATCAGATAATATGCACACTCTTATC
JMFS140B09+ ATTGCTGTGGTTGTGGGTTGCCTATTTTTCATATCATCAGATAATATGCACACTCTTATC
JMFS124F08+ ATTGCTGTGGTTGTGGGTTGCCTATTTTTCATATCATCAGATAATATGCACACTCTTATC
JMFS082F11+ ATTACTGTGGTCGTGGGATGCCTGTTTTTCATATCATCTGATAATATGCACACTCTTATT
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consensus ATTGCTGTGGTTGTGGGTTGCCTATTTTTCATATCATCAGATAATATGCACACTCTTATC

. : . : . : . : . : . :
JMSF028G21+ CAGAAGTTAGATACCAACATTAAATGGTGGTCAATGTATGGTTGTTTGCTAGGATTCTTT
JMFS076B05+ CAGAAGTTAGATACCAACATTAAATGGTGGTCAATGTATGGTTGTTTGCTAGGATTCTTT
JMFS164B02+ CAGAAGTTAGATACCAACATTAAATGGTGGTCAATGTATGGTTGTTTGCTAGGATTCTTT
JMFS140B09+ CAGAAGTTAGATACCAACATTAAATGGTGGTCAATGTATGGTTGTTTGCTAGGATTCTTT
JMFS124F08+ CAGAAGTTAGATACCAACATTAAATGGTGGTCAATGTATGGTTGTTTGCTAGGATTCTTT
JMFS082F11+ CAGAAGTTGGATAGCAATATTAAATGGTGGTCAATCTATGCTTGTTTACTAGAATTCTTT
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consensus CAGAAGTTAGATACCAACATTAAATGGTGGTCAATGTATGGTTGTTTGCTAGGATTCTTT

. : . : . : . : . : . :
JMSF028G21+ TACTTCTTTTCATCTCCATTTATTGGGAAAACAATTAGGCC
JMFS076B05+ TACTTCTTTTCATCTCCATTTATTGGGAAAACAATTAGGCCAAGTTATTCANATTTCAGC
JMFS164B02+ TACTTCTTTTCATCTCCATTTA
JMFS140B09+ TACTTCTTTTCATCTCCATTTATTGGGAAAACAATTAGGCCAAGTTATTCAAATTTCAGC
JMFS124F08+ TACTTCTTTTCATCTCCATTTATTGGGAAAACAATTAGGCCAAGTTATTCAAATTTCAGC
JMFS082F11+ TACTTCTTTTCATCTCCATTTATAGGGAAAACAATTAAGCCTAGTTATTCAAATTTCAGC
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consensus TACTTCTTTTCATCTCCATTTATTGGGAAAACAATTAGGCCAAGTTATTCAAATTTCAGC

. : . : . : . : . : . :
JMFS076B05+ CGCTGG
JMFS140B09+ CGCTGG
JMFS124F08+ CGCTGGTA
JMFS082F11+ CGCTGGTAAGTTTTTAGTTTCTTTTATGGCACAAACTCAGTTTTTCCATCTAATGGAACT
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consensus CGCTGGTAAGTTTTTAGTTTCTTTTATGGCACAAACTCAGTTTTTCCATCTAATGGAACT

. : . : . : . : . : . :
JMFS082F11+ CATGGAAATTGCTATTGCATAATTTTCATTTTATAGGTATATAGTTTGGATATTTGTTGC
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consensus CATGGAAATTGCTATTGCATAATTTTCATTTTATAGGTATATAGTTTGGATATTTGTTGC

. : . : . : . : . : . :
JMFS082F11+ AGCTCTTTATCATCTTCCCAGTTTTCAGTCAATGGGAGTAGATTTAAGGATGAACCTATC
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consensus AGCTCTTTATCATCTTCCCAGTTTTCAGTCAATGGGAGTAGATTTAAGGATGAACCTATC

. : . : . : . : . : . :
JMFS082F11+ TTTGTTTTTGACTATATATGTCTCATCCATCTCCTTCCTGCTTGTTTTCCATGTTA
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consensus TTTGTTTTTGACTATATATGTCTCATCCATCTCCTTCCTGCTTGTTTTCCATGTTA