Alignment Contig 5035

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMSF016M02+ GGGAATAAAATTAGGGAGTATTATTTGGGTTGTGATTTATCGTTGCGATGAAGGGTGGGG
JMFF031K13+ ATTTGGGTTGTGATTTATCGTTGCGATGAAGGGTGGGG
JMFF047E24+ ATTTGGGTTGTGATTTATCGTTGCGATGAAGGGTGGGG
JMSF017E01+ ATCGTTGCGATGAAGGGTGGGG
JMSF005J07+ ATCGTTGCGATGAAGGGTGGGG
JMSF051G24+ ATTTGGGTTGTGATTTATCGTTGCGATGAAGGGTGGGG
JMSF044B11+ ATTTGGGTTGTGATTTATCGTTGCGATGAAGGGTGGGG
JMSF049F09+ GGGTTGTGATTTATCGTTGCGATGAAGGGTGGGG
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consensus GGGAATAAAATTAGGGAGTATTATTTGGGTTGTGATTTATCGTTGCGATGAAGGGTGGGG

. : . : . : . : . : . :
JMSF016M02+ GTTCGTCGGAGACGAAGATCTTGCAGGAATTGGTGTTGTACGCCGCCAGCGCCGCTATTA
JMFF031K13+ GTTCGTCGGAGACGAAGATCTTGCAGGAATTGGTGTTGTACGCCGCCAGCGCCGCTATTA
JMFF047E24+ GTTCGTCGGAGACGAAGATCTTGCAGGAATTGGTGTTGTACGCCGCCAGCGCCGCTATTA
JMSF017E01+ GTTCGTCGGAGACGAAGATCTTGCAGGAATTGGTGTTGTACGCCGCCAGCGCCGCTATTA
JMSF005J07+ GTTCGTCGGAGACGAAGATCTTGCAGGAATTGGTGTTGTACGCCGCCAGCGCCGCTATTA
JMSF051G24+ GTTCGTCGGAGACGAAGATCTTGCAGGAATTGGTGTTGTACGCCGCCAGCGCGGCTATTA
JMSF044B11+ GTTCGTCGGAGACGAAGATCTTGCAGGAATTGGTGTTGTACGCCGCCAGCGCCGCTATTA
JMSF049F09+ GTTCGTCGGAGACGAAGATCTTGCAGGAATTGGTGTTGTACGCCGCCAGCGCCGCTATTA
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consensus GTTCGTCGGAGACGAAGATCTTGCAGGAATTGGTGTTGTACGCCGCCAGCGCCGCTATTA

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JMSF016M02+ GCTGCTTGGTGTTGTTTGTGGGGCTCCGACATCTCGACCCGAACCGTGAAGCCTCCAAGA
JMFF031K13+ GCTGCTTGGTGTTGTTTGTGGGGCTCCGACATCTCGACCCGAACCGTGAAGCCTCCAAGA
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consensus GCTGCTTGGTGTTGTTTGTGGGGCTCCGACATCTCGACCCGAACCGTGAAGCCTCCAAGA

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JMSF016M02+ AAGCCCTCGAGAACAAGAAGG
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JMSF005J07+ AAGCCCTCGAGAACAAGAAGGAAATCGCCAAGCGTCTTGGCCGTCCGCTTATTCAGACCA
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consensus AAGCCCTCGAGAACAAGAAGGAAATCGCCAAGCGTCTTGGCCGTCCGCTTATTCAGACCA

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JMFF031K13+ ATACCTACGAGGATGTAATTGCATGTGATGTAATTAATCCTGATCATATTGATGTGGAGT
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consensus ATACCTACGAGGATGTAATTGCATGTGATGTAATTAATCCTGATCATATTGATGTGGAGT

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JMFF031K13+ TCAATTCTATTGGTGGACTGGAAGCTATAAAACAAGCATTGTATGAATTGGTGATTCTTC
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JMSF005J07+ TCAATTCTATTGGTGGACTGGAAGCTATAAAACAAGCATTGTATGAATTGGTGATTCTTC
JMSF051G24+ TCAATTCTATTGGTGGACTGGAAGCTATAAAACAAGCATTGTATGAATTGGTGATTCTTC
JMSF044B11+ TCAATTCTATTGGTGGACTGGAAGCTATAAAACAAGCATTGTATGAATTGGTGATTCTTC
JMSF049F09+ TCAATTCTATTGGTGGACTGGAAGCTATAAAACAAGCATTGTATGAATTGGTGATTCTTC
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consensus TCAATTCTATTGGTGGACTGGAAGCTATAAAACAAGCATTGTATGAATTGGTGATTCTTC

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JMFF031K13+ CTCTACAAAGACCAGAGCTATTTTCTCATGGAAAACTTCTTGGTCCTCAAAAGGGTGTAT
JMFF047E24+ CTCTACAAAGACCAGAGCTATTTTCTCATGGAAAACTTCTTGGTCCTNCAAAGGGTGTAT
JMSF005J07+ CTCTACAAAGACC
JMSF051G24+ CTCTACAAAGACCAGAGCTATTTTCTCATGGAAAACTTCTTGGTCCTCAAAAGGGTGTAT
JMSF044B11+ CTCTACAAAGACCAGAGCTATTTTCTCATGGAAAACTTCTTGGTCCTCAAAAGGGTGTAT
JMSF049F09+ CTCTACAAAGACCAGAGCTATTTTCTCATGGAAAACTTCTTGGTCCTCAAAAGGGTGTAT
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consensus CTCTACAAAGACCAGAGCTATTTTCTCATGGAAAACTTCTTGGTCCTCAAAAGGGTGTAT

. : . : . : . : . : . :
JMFF031K13+ TGCTATATGGACCACCTGGCACTGGCAAGACTATGCTTGCCAAAGCAATTGCAAAAGAAT
JMFF047E24+ TGCTATATGGAC
JMSF051G24+ TGCTATATGGACCACCTGGCACTGGCAAGACTATGCTTGCCAAAGCAATTGCAAAAGAAT
JMSF044B11+ TGCTATATGGACCACCTGGCACTGGCAAGACTATGCTTGCCAAAGCAATTGCAAAAGAAT
JMSF049F09+ TGCTATATGGACCACCTGGCACTGGCAAGACTATGCTTGCCAAAGCAATTGCAAAAGAAT
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consensus TGCTATATGGACCACCTGGCACTGGCAAGACTATGCTTGCCAAAGCAATTGCAAAAGAAT

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JMFF031K13+ CAAGGGCTGTTTTCATCAATGTAAAGATTTCCAATCTTATGAGCAAGTGGTTTGGTGATG
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consensus CAAGGGCTGTTTTCATCAATGTAAAGATTTCCAATCTTATGAGCAAGTGGTTTGGTGATG

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JMFF031K13+ CTCAAAAACTAGTGGCTGCTGTATTTAGCCTGGCATATAAACTCCA
JMSF051G24+ CTCAAAAACTAGTGGCTGCTGTATTTAGCCTGGCATATAAACTCCAGCCAGCGATTATAT
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consensus CTCAAAAACTAGTGGCTGCTGTATTTAGCCTGGCATATAAACTCCAGCCAGCGATTATAT

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JMSF051G24+ TTATTGATGAGGTGGATAGTTTTTTGGGTCAACGGAAGTCTACTGACCATGAAGCATTAA
JMSF044B11+ TTATTGATGAGGTGGATAGTTTTTTGGGTCAACGGAAGTCTACTGACCATGAAGCATTAA
JMSF049F09+ TTATTGATGAGGTGGATAGTTTTTTGGGTCAACGGAAGTCTACTGACCATGAAGCATTAA
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consensus TTATTGATGAGGTGGATAGTTTTTTGGGTCAACGGAAGTCTACTGACCATGAAGCATTAA

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JMSF051G24+ CTAATATGAAGACTGAATTCATGG
JMSF044B11+ CTAATATGAAGACTGAATTCATGG
JMSF049F09+ CTAATATGAAGACTGAATTCATGGCTTTGTGGGATGGTTTCACCACTGATCA
____________________________________________________________
consensus CTAATATGAAGACTGAATTCATGGCTTTGTGGGATGGTTTCACCACTGATCA