Alignment Contig 438

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMFS065C05+ GGATTTGATCATACCCGTAACGTGTCAAGTTCTGGAAAACGAAGTTTAATGCGGGTCAAA
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consensus GGATTTGATCATACCCGTAACGTGTCAAGTTCTGGAAAACGAAGTTTAATGCGGGTCAAA

. : . : . : . : . : . :
JMFS065C05+ AGGTCTTGATCTTACGATCAAACGGCGGAGGTGTCATCTCCGTTGCTAACTAGGGTTTCT
____________________________________________________________
consensus AGGTCTTGATCTTACGATCAAACGGCGGAGGTGTCATCTCCGTTGCTAACTAGGGTTTCT

. : . : . : . : . : . :
JMFS065C05+ AGAATAGCCGCCGTACCTGGGGTCAGTATATAAACCTCACAGTGTCCAGCTCGCCGGTTC
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consensus AGAATAGCCGCCGTACCTGGGGTCAGTATATAAACCTCACAGTGTCCAGCTCGCCGGTTC

. : . : . : . : . : . :
JMFS065C05+ GCGGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
rJMSF018N19- TGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMSF025G04+ GCGGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMSF017P15+ GCGGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAAATATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMSF033J19+ GGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMSF018N19+ TGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFF014G04+ GGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFF007M08+ GCGGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFF015I15+ GCGGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFF012A06+ GCGGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFF005F14+ GCGGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFF009O22+ GCGGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFF017P20+ GCGGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMSF043A15+ GGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFF033B17+ GGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFF041B06+ GGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFS003F05+ AA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFS015D08+ TTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFS053E11+ TTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
JMFN010O06+ TTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT
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consensus GCGGTGCAGTTTTCCCTGCGCTCCCCCCAAAAAA-TATTATTCTTCATTCCCAGCCCTCT

. : . : . : . : . : . :
JMFS065C05+ TTCTATCGGATCTCCGACGATTTCTATCCCCGTTTTACCCTTCCCTCTCCTCTCTTATTA
rJMSF018N19- TTNTATCGGATCTCCGACGATTTCTATCCCCGTTTTACCCTTCCCTCTCCTCTCTTATTA
JMSF025G04+ TTCTATCGGATCTCCGACGATTTCTATCCCCGTTTTACCCTTCCCTCTCCTCTCTTATTA
JMSF017P15+ TTCTATCGGATCTCCGACGATTTCTATCCCCGTTTTACCCTTCCCTCTCCTCTCTTATTA
JMSF033J19+ TTCTATCGGATCTCCGACGATTTCTATCCCCGTTTTACCCTTCCCTCTCCTCTCTTATTA
JMSF018N19+ TTCTATCGGATCTCCGACGATTTCTATCCCCGTTTTACCCTTCCCTCTCCTCTCTTATTA
JMFF014G04+ TTCTATCGGATCTCCGACGATTTCTATCCCCGTTTTACCCTTCCCTCTCCTCTCTTATTA
JMFF007M08+ TTCTATCGGATCTCCGACGATTTCTATCCCCGTTTTACCCTTCCCTCTCCTCTCTTATTA
JMFF015I15+ TTCTATCGGATCTCCGACGATTTCTATCCCCGTTTTACCCTTCCCTCTCCTCTCTTATTA
JMFF012A06+ TTCTATCGGATCTCCGACGATTTCTATCCCCGTTTTACCCTTCCCTCTCCTCTCTTATTA
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JMFN010O06+ TTCTATCGGATCTCCGACGATTTCTATCCCCGTTTTACCCTTCCCTCTCCTCTCTTATTA
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consensus TTCTATCGGATCTCCGACGATTTCTATCCCCGTTTTACCCTTCCCTCTCCTCTCTTATTA

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JMFS065C05+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
rJMSF018N19- CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMSF025G04+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMSF017P15+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMSF033J19+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMSF018N19+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMFF014G04+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMFF007M08+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMFF015I15+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMFF012A06+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMFF005F14+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMFF009O22+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMFF017P20+ CATCTATCTAAAAAAAAACCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMSF043A15+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMFF033B17+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMFF041B06+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMFS003F05+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTGGGTTCCTGCTTCCATAAC
JMFS015D08+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMFS053E11+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
JMFN010O06+ CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC
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consensus CATCTATCTAAAAAAAA-CCCAAAAAATCTCCGCCTGCGCTCGCTTCCTGCTTCCATAAC

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JMFS065C05+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
rJMSF018N19- CTAACC
JMSF025G04+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
JMSF017P15+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
JMSF033J19+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTTCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
JMSF018N19+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
JMFF014G04+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
JMFF007M08+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
JMFF015I15+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
JMFF012A06+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
JMFF005F14+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
JMFF009O22+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
JMFF017P20+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCANAGGAGAGGGAA
JMSF043A15+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
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JMFS053E11+ CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA
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consensus CTAACCGTCGGTGGTAGCTTGCATTCTCTGCTGCCAATAAAAATATCAGAGGAGAGGGAA

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JMFS065C05+ TTAAAAAGT
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JMSF017P15+ TTAAAAAGTAAAAAAAAAA
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JMFF005F14+ TTAAAAAGTAAAAAAAAAA
JMFF009O22+ TTAAAAAGTAAAAAAAAAA
JMFF017P20+ TTANAAAGTAAAAAAAAAA
JMSF043A15+ TTAAAAAGTAAAAAAAAAA
JMFF033B17+ TTAAAAAGTAAAAAAAAAA
JMFF041B06+ TTAAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAA-GTAGAAGTGAATTTGTTTGTTAGTGTTTGAGAG
JMFS003F05+ TTAAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAA-GTAGAAGTGAATTTGTTTGTTAGTGTTTGAGAG
JMFS015D08+ TTAAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGAAGTGAATTTGTTTGTTAGTGTTTGAGAG
JMFS053E11+ TTAAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAA-GTAGAAGTGAATTTGTTTGTTAGTGTTTGAGAG
JMFN010O06+ TTAAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAA-GTAGAAGTGAATTTGTTTGTTAGTGTTTGAGAG
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consensus TTAAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAA-GTAGAAGTGAATTTGTTTGTTAGTGTTTGAGAG

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JMFF041B06+ TATAGATTGGAAATAATGGCTCAGATTCAGGTGCAGCA------TCAGAGTCCGGTGGCG
JMFS003F05+ TATAGATTGGAAATAATGGCTCAGATTCTGATGCTGCACCTGAATCTGAGTCCGGTGGCG
JMFS015D08+ TATAGATTGGAAATAATGGCTCAGATTCAGGTGCAGCA------TCAGAGTCCGGTGGCG
JMFS053E11+ TATAGATTGGAAATAATGGCTCAGATTCAGGTGCAGCA------TCAGAGTCCGGTGGCG
JMFN010O06+ TATAGATTGGAAATAATGGCTCAGATTCAGGTGCAGCA------TCAGAGTCCGGTGGCG
____________________________________________________________
consensus TATAGATTGGAAATAATGGCTCAGATTCAGGTGCAGCA------TCAGAGTCCGGTGGCG

. : . : . : . : . : . :
JMFF041B06+ CTAGCAAATGGAGTTCCGCCGCCGGGTGCTGTCGGCCTCCCTGCTCCCCAGTCCGCCGCC
JMFS003F05+ CTAGCAAATGGAGTTCCGCCGCCGGGTGCTGTCGGCCTCCCTGCTCCCCAGTCCGCCGCC
JMFS015D08+ CTAGCAAATGGAGTTCCGCCGCCGGGTGCTGTCGGCCTCCCTGCTCCCCAGTCCGCCGCC
JMFS053E11+ CTAGCAAATGGAGTTCCGCCGCCGGGTGCTGTCGGCCTCCCTGCTCCCCAGTCCGCCGCC
JMFN010O06+ CTAGCAAATGGAGTTCCGCCGCCGGGTGCTGTCGGCCTCCCTGCTCCCCAGTCCGCCGCC
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consensus CTAGCAAATGGAGTTCCGCCGCCGGGTGCTGTCGGCCTCCCTGCTCCCCAGTCCGCCGCC

. : . : . : . : . : . :
JMFF041B06+ GGGGCTGGAAACCAGTTATCCACCACGTCTTTGTACGTTGGGGACCTGGACCCTACCGTC
JMFS003F05+ GGGGCTGGAAACCAGTTATCCACCACGTCTTTGTACGTTGGGGACCTGGACCCTACCGTC
JMFS015D08+ GGGGCTGGAAACCAGTTATCCACCACGTCTTTGTACGTTGGGGACCTGGACCCTACCGTC
JMFS053E11+ GGGGCTGGAAACCAGTTATCCACCACGTCTTTGTACGTTGGGGACCTGGACCCTACCGTC
JMFN010O06+ GGGGCTGGAAACCAGTTATCCACCACGTCTTTGTACGTTGGGGACCTGGACCCTACCGTC
____________________________________________________________
consensus GGGGCTGGAAACCAGTTATCCACCACGTCTTTGTACGTTGGGGACCTGGACCCTACCGTC

. : . : . : . : . : . :
JMFF041B06+ ACTGACTCGCAGCTCTACGATCTGTTTAACCAGGTGGGCCAGGTGGTATCAGTTAGGGTC
JMFS003F05+ ACTGACTCGCAGCTCTACGATCTGTTTAACCAGGTGGGCCAGGTGGTATCAGTTAGGGTC
JMFS015D08+ ACTGACTCGCAGCTCTACGATCTGTTTAACCAGGTGGGCCAGGTGGTATCAGTTAGGGTC
JMFS053E11+ ACTGACTCGCAGCTCTACGATCTGTTTAACCAGGTGGGCCAGGTGGTATCAGATAAGGTC
JMFN010O06+ ACTGACTCGCAGCTCTACGATCTGTTTAACCAGGTGGGCCAGGTGGTATCAGTTAGGGTC
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consensus ACTGACTCGCAGCTCTACGATCTGTTTAACCAGGTGGGCCAGGTGGTATCAGTTAGGGTC

. : . : . : . : . : . :
JMFF041B06+ TGTCGGGACATCAGCTCTCGCCGATCTCTCGGCTATGGCTACGTCAACTATAGCAGTCCT
JMFS003F05+ TGTCGGGACATCAGCTCTCGCCGATCTCTCGGCTATGGCTACGTCAACTATAGCAGT
JMFS015D08+ TGTCGGGACATCAGCTCTCGCCGATCTCTCGGCTATGGCTACGTCAACT
JMFS053E11+ TGTCGGGACATCAACTATCGCCGATCTCTCGGCTATGGCTACGTCAACTATAGCAGAACT
JMFN010O06+ TGTCGGGACATCAGCTCTCGCCGATCTCTCGGCTATGGCTACGTCAACTATAGCAGTCCT
____________________________________________________________
consensus TGTCGGGACATCAGCTCTCGCCGATCTCTCGGCTATGGCTACGTCAACTATAGCAGTCCT

. : . : . : . : . : . :
JMFF041B06+ CAGGATGCTGCAAGAGCAATGGAAGTATTGAACTTCACTCCTGTCAATAGCAAGTCTATT
JMFS053E11+ CAAGATGCTGCNAGAGC
JMFN010O06+ CAGGATGCTGCAAGAGCAATGGAAGTATTGAACTTCACTCCTG
____________________________________________________________
consensus CAGGATGCTGCAAGAGCAATGGAAGTATTGAACTTCACTCCTGTCAATAGCAAGTCTATT

. : . : . : . : . : . :
JMFF041B06+ AGGA
____________________________________________________________
consensus AGGA