Alignment Contig 3179

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMFF025H15+ CACTCCTCAAGACTGAGCCAAAACTACAAAGCTTTTTAGCTAAGCTCGATAACCTTACCT
JMFF005M08+ CACTCCTCAAGACTGAGCCANAACTACNAAGCTTTTTAGCTAAGCTCGATAACCTTACCT
JMFF020K13+ CACTCCTCAAGACTGAGCCAAAACTACAAAGCTTTTTAGCTAAGCTCGATAACCTTACCT
JMFF005N08+ CACTCCTCAAGACTGAGCCAAAACTACAAAGCTTTTTAGCTAAGCTCGATAACCTTACCT
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consensus CACTCCTCAAGACTGAGCCAAAACTACAAAGCTTTTTAGCTAAGCTCGATAACCTTACCT

. : . : . : . : . : . :
JMFF025H15+ TCAATGGCTTCTCTGCTCAACACTGTGCCCTCCATAAGATTATCAAGTTTTAAATGTAAT
JMFF005M08+ TCAATGGCTTCTCTGCTCAACACTGTGCCCTCCATAANATTATCAAGTTTTAAATGTAAT
JMFF020K13+ TCAATGGCTTCTCTGCTCAACACTGTGCCCTCCATAAGATTATCAAGTTTTAAATGTAAT
JMFF005N08+ TCAATGGCTTCTCTGCTCAACACTGTGCCCTCCATAAGATTATCAAGTTTTAAATGTAAT
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consensus TCAATGGCTTCTCTGCTCAACACTGTGCCCTCCATAAGATTATCAAGTTTTAAATGTAAT

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JMFF025H15+ CCCCTTCGAGCTCCGCACCTCTCATATCCTATCTCTCTGACTCCCTCAAGGAGCAGGTTT
JMFF005M08+ CCCCTTCGAGCTCCGCACCTCTCATATCCTATCTCTCTGACTCCCTCAAGGAGCAGGTTT
JMFF020K13+ CCCCTTCGAGCTCCGCACCTCTCATATCCTATCTCTCTGACTCCCTCAAGGAGCAGGTTT
JMFF005N08+ CCCCTTCGAGCTCCGCACCTCTCATATCCTATCTCTCTGACTCCCTCAAGGAGCAGGTTT
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consensus CCCCTTCGAGCTCCGCACCTCTCATATCCTATCTCTCTGACTCCCTCAAGGAGCAGGTTT

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JMFF025H15+ GTGGTGAGGGCCGCCGAGACTGACAGTGAAGTTAAAGCTACGGTACCGGATAAGGCGCCG
JMFF005M08+ GTGGTGAGGGCCGCCGAGACTGACAGTGAAGTTAAAGCTACGGTACCGGATAAGGCGCCG
JMFF020K13+ GTGGTGAGGGCCGCCGAGACTGACAGTGAAGTTAAAGCTACGGTACCGGATAAGGCGCCG
JMFF005N08+ GTGGTGAGGGCCGCCGAGACTGACAGTGAAGTTAAAGCTACGGTACCGGATAAGGCGCCG
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consensus GTGGTGAGGGCCGCCGAGACTGACAGTGAAGTTAAAGCTACGGTACCGGATAAGGCGCCG

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JMFF025H15+ CCGGCTTCTGGTTCCAGCATTAATCAAATTCTTGGTATCAAAGGAGCCAAGCAAGAAACG
JMFF005M08+ CCGGCTTCTGGTTCCAGCATTAATCAAATTCTTGGTATCAAAGGAGCCAAGCAAGAAACG
JMFF020K13+ CCGGCTTCTGGTTCCAGCATTAATCAAATTCTTGGTATCAAAGGAGCCAAGCAAGAAACG
JMFF005N08+ CCGGCTTCTGGTTCCAGCATTAATCAAATTCTTGGTATCAAAGGAGCCAAGCAAGAAACG
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consensus CCGGCTTCTGGTTCCAGCATTAATCAAATTCTTGGTATCAAAGGAGCCAAGCAAGAAACG

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JMFF025H15+ GACAAATGGAAGATTCGTGTTCAGCTAACAAAGCCTGTTACTTGGCCTCCCCTTGTCTGG
JMFF005M08+ GACAAATGGAAGATTCGTGTTCAGCTAACAAAGCCTGTTACTTGGCCTCCCCTTGTCTGG
JMFF020K13+ GACAAATGGAAGATTCGTGTTCAGCTAACAAAGCCTGTTACTTGGCCTCCCCTTGTCTGG
JMFF005N08+ GACAAATGGAAGATTCGTGTTCAGCTAACAAAGCCTGTTACTTGGCCTCCCCTTGTCTGG
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consensus GACAAATGGAAGATTCGTGTTCAGCTAACAAAGCCTGTTACTTGGCCTCCCCTTGTCTGG

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JMFF025H15+ GGTGTGGTCTGTGGAGCTGCTGCTTCAGGGAACTTCCACTGGACTCCCGAAGATGTGGCT
JMFF005M08+ GGTGTGGTCTGTGGAGCTGCTGCTTCAGGGAACTTCCACTGGACTCCCGAAGATGTGGCT
JMFF020K13+ GGTGTGGTCTGTGGAGCTGCTGCTTCAGGGAACTTCCACTGGACTCCCGAAGATGTGGCT
JMFF005N08+ GGTGTGGTCTGTGGAGCTGCTGCTTCAGGGAACTTCCACTGGACTCCCGAAGATGTGGCT
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consensus GGTGTGGTCTGTGGAGCTGCTGCTTCAGGGAACTTCCACTGGACTCCCGAAGATGTGGCT

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JMFF025H15+ AAATCAATTGTTTGTATGCTAATGTCTGGTCCTTTCCTTACGGGCTACACTCAGACAATT
JMFF005M08+ AAATCAATTGTTTGTATGCTAATGTCTGGTCCTTTCCTTACGGGCTACACTCAGACAATT
JMFF020K13+ AAATCAATTGTTTGTATGCTAATGTCTGGTCCTTTCCTTACGGGCTACACTCAGACAATT
JMFF005N08+ AAATCAATTGTTTGTATGCTAATGTCTGGTCCTTTCCTTACGGGCTACACTCAGACAATT
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consensus AAATCAATTGTTTGTATGCTAATGTCTGGTCCTTTCCTTACGGGCTACACTCAGACAATT

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JMFF025H15+ AATGACTGGTATGATC-GAGAAATTGATGCTATTAATGAACCTTACCGTCCAATTCCCTC
JMFF005M08+ AATGACTGGTAT
JMFF020K13+ AATGACTGGTATGATCCGAGAAATTGATGCTATTAATGAACCTTACCGTCCAATTCCCTC
JMFF005N08+ AATGACTGGTATGATC-GAGAAATTGATGCTATTAATGAACCTTACCGTCCAATTCCCTC
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consensus AATGACTGGTATGATC-GAGAAATTGATGCTATTAATGAACCTTACCGTCCAATTCCCTC

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JMFF025H15+ TGGAGCTATATCTGAGAAT
JMFF020K13+ TGGAGCTATATCTG
JMFF005N08+ TGGAGCTATATCTG
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consensus TGGAGCTATATCTGAGAAT