Alignment Contig 2283

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMSF027N15+ GACCGTATTACTGATTTGCAGTCCAATTTACTTCAATGGAGCAACAACCGCCGCCGCCAA
JMSF033G20+ GACCGTATTACTGATTTGCAGTCCAATTTACTTCAATGGAGCAACAACCGCCGCCGCCAA
JMSF034G20+ GACCGNATTANTGATTTGCAGTCCAANTTACTTCAATGGAGCAACAANCGCCGNCGCCNA
JMSF016D06+ CGTATTACTGATTTGCAGTCCAATTTACTTCAATGGAGCAACAACCGCCGCCGCCAA
JMSF024B20+ GACCGTATTACTGATTTGCAGTCCAATTTACTTCAATGGAGCAACAACCGCCGCCGCCAA
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consensus GACCGTATTACTGATTTGCAGTCCAATTTACTTCAATGGAGCAACAACCGCCGCCGCCAA

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JMSF027N15+ GCGAACGGTCGTCACCGCCGCAACAACAACCGCCACCTCCATCACTAACACCTACTCCTT
JMSF033G20+ GCGAACGGTCGTCACCGCCGCAACAACAACCGCCACCTCCATCACTAACACCTACTCCTT
JMSF034G20+ GCGAACGGTCGTCACCGCCGCAACAACAACCGCCACCTCCATCACTAACACCTACTCCTT
JMSF016D06+ GCGAACGGTCGTCACCGCCGCAACAACAACCGCCACCTCCATCACTAACACCTACTCCTT
JMSF024B20+ GCGAACGGTCGTCACCGCCGCAACAACAACCGCCACCTCCATCACTAACACCTACTCCTT
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consensus GCGAACGGTCGTCACCGCCGCAACAACAACCGCCACCTCCATCACTAACACCTACTCCTT

. : . : . : . : . : . :
JMSF027N15+ CACCTTCTGCCGCATCTACCTCCTCAGCACCATCCCTTACTTCCTCACTCCCTCCTCCTT
JMSF033G20+ CACCTTCTGCCGCATCTACCTCCTCAGCACCATCCCTTACTTCCTCACTCCCTCCTCCTT
JMSF034G20+ CACCTTCTGCCGCATCTANCTCCTCAGCACCATCCCTTANTTCCTCACTCCCTCCTCCTT
JMSF016D06+ CACCTTCTGCCGCATCTACCTCCTCAGCACCATCCCTTACTTCCTCACTCCCTCCTCCTT
JMSF024B20+ CACCTTCTGCCGCATCTACCTCCTCAGCACCATCCCTTACTTCCTCACTCCCTCCTCCTT
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consensus CACCTTCTGCCGCATCTACCTCCTCAGCACCATCCCTTACTTCCTCACTCCCTCCTCCTT

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JMSF027N15+ CGACGCCAGCATCTTCTACGAAACCAACCCTAAACCCCTCTGCTTCTACATCCGTGACCC
JMSF033G20+ CGACGCCAGCATCTTCTACGAAACCAACCCTAAACCCCTCTGCTTCTACATCCGTGACCC
JMSF034G20+ CGAAGCCAGNATCTTCTACGAAACCAACCCTAAACCCCTCTGCTTCTACATCCNTGACCC
JMSF016D06+ CGACGCCAGCATCTTCTACGAAACCAACCCTAAACCCCTCTGCTTCTACATCCGTGACCC
JMSF024B20+ CGACGCCAGCATCTTCTACGAAACCAACCCTAAACCCCTCTGCTTCTACATCCGTGACCC
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consensus CGACGCCAGCATCTTCTACGAAACCAACCCTAAACCCCTCTGCTTCTACATCCGTGACCC

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JMSF027N15+ CAGCCTCGCAAAACCCTCAATCAAGGCCAGC-TTCAGAGCCCCCGTCCTCTTTCGCTAGC
JMSF033G20+ CAGCCTCGCAAAACCCTCAATCAAGGCCAGC-TTCAGAGCCCCCGTCCTCTTTCGCTAGC
JMSF034G20+ CAGCCTCGGAAAACCCTCAATNNAGGGCAGCATTCAGAGCCCCCGTCCTCTTTCGCTAGC
JMSF016D06+ CAGCCTCGCAAAACCCTCAATCAAGGCCAGC-TTCAGAGCCCCCGTCCTCTTTCGCTAGC
JMSF024B20+ CAGCCTCGCAAAACCCTCAATCAAGGCCAGC-TTCAGAGCCCCCGTCCTCTTTCGCTAGC
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consensus CAGCCTCGCAAAACCCTCAATCAAGGCCAGC-TTCAGAGCCCCCGTCCTCTTTCGCTAGC

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JMSF027N15+ TCCCGCCAAC---CCTCGCCTTTCCAGCACTTGACTCATCCTCCTTCTTCGCTAACCGTG
JMSF033G20+ TCCCGCCAACAACCCTCGCCTTTCCAGCACTTGACTCATCCTCCTTCTTCGCTAACCGTG
JMSF034G20+ TCCCGCCAANAACCCTNGNCTTTNCAGCACTTGACTCATCCTCCTTCTTCGCTAACNGTG
JMSF016D06+ TCCCGCCAACAACCCTCGCCTTTCCAGCACTTGACTCATCCTCCTTCTTCGCTAACCGTG
JMSF024B20+ TCCCGCCAACAACCCTCGCCTTTCCAGCACTTGACTCATCCTCCTTCTTCGCTAACCGTG
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consensus TCCCGCCAACAACCCTCGCCTTTCCAGCACTTGACTCATCCTCCTTCTTCGCTAACCGTG

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JMSF027N15+ CCGCCGCCTGCTAGAGGTGGGTTGGCAATTGGGGTCCCTGCCCACCAGCCTGGCCCTTCT
JMSF033G20+ CCGCCGCCTGCTAGAGGTGGGTTGGCAATTGGGGTCCCTGCCCACCAGCCTGGCCCTTCT
JMSF034G20+ CCGCCGNCTGCTAGAGGTGGGTTGGCAATTGGGGTCCCTGCCCACCAGCCTGGANCTTCT
JMSF016D06+ CCGCCGCCTGCTAGAGGTGGGTTGGCAATTGGGGTCCCTGCCCACCAGCCTGGCCCTTCT
JMSF024B20+ CCGCCGCCTGCTAGAGGTGGGTTGGCAATTGGGGTCCCTGCCCACCAGCCTGGCCCTTCT
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consensus CCGCCGCCTGCTAGAGGTGGGTTGGCAATTGGGGTCCCTGCCCACCAGCCTGGCCCTTCT

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JMSF027N15+ CCGCCGCCTGCCTCCTTTTCATCATTGGCTCCGCCTTCTTTTGGGCAGCAATTTGGTGGG
JMSF033G20+ CCGCCGCCTGCCTCCTTTTCATCATTGGCTCCGCCTTCTTTTGGGCAGCAATTTGGTGGG
JMSF034G20+ CCGCCGCCTGCGTCCTTTTCATCATTGGNNNCGNCTTCTTTTGGGCAGNAATTTGGTGGG
JMSF016D06+ CCGCCGCCTGCCTCCTTTTCATCATTGGCTCCGCCTTCTTTTGGGCAGCAATTTGGTGGG
JMSF024B20+ CCGCCGCCTGCCTCCTTTTCATCATTGGCTCCGCCTTCTTTTGGGCAGCAATTTGGTGGG
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consensus CCGCCGCCTGCCTCCTTTTCATCATTGGCTCCGCCTTCTTTTGGGCAGCAATTTGGTGGG

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JMSF027N15+ TTGGGTCGCGGTGTGCCTGATTCTCTGCCTAGTTCGAGTTCAGCCCAGGGGAGACCTGTA
JMSF033G20+ TTGGGTCGCGGTGTGCCTGATTCTCTGCCTAGTTCGAGTTCAGCCCAGGGGAGACCTGTA
JMSF034G20+ TTGGGTCGCGGTGTGCCTGATTCTCTGCCTAGTTC
JMSF016D06+ TTGGGTCGCGGTGTGCCTGANTCTCTGCC
JMSF024B20+ TTGGGTCGCGGTGTGCCTGATTCTCTGCCTAGTTCGAGTTCAGCCCAGGGGAGACCTGTA
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consensus TTGGGTCGCGGTGTGCCTGATTCTCTGCCTAGTTCGAGTTCAGCCCAGGGGAGACCTGTA

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JMSF027N15+ CAAGGAATGCAAGGGATTGGAATTACAGGGTCGCTTGGTTCGAGTATGCCAATGCGACCA
JMSF033G20+ CAAGGAATGCAAGGGATTGGAATTACAGGGTCGCTTGGTTCGAGTATGCCAATGCGACCA
JMSF024B20+ CAAGGAATGCAAGGGATTGGAATTACAGGGTCGCTTGGTTCGAGTATGCCAATGCGACCA
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consensus CAAGGAATGCAAGGGATTGGAATTACAGGGTCGCTTGGTTCGAGTATGCCAATGCGACCA

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JMSF027N15+ GCTGGGGTTCCTCCTCAGCCAGTGAGATCTATTACGACATCATCAATTAGA
JMSF033G20+ GCTGGGGTTCCTCCTCAGCCAGTGAGATCTATTACGACATCATCAATTAGACAGCAGAGT
JMSF024B20+ GCTGGGGTTCCTCCTCAGCCAGTGAGATCTATTACGACATCATCAATTAGACAGCAGAGT
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consensus GCTGGGGTTCCTCCTCAGCCAGTGAGATCTATTACGACATCATCAATTAGACAGCAGAGT

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JMSF024B20+ G
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consensus G