Alignment Contig 13431

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMSF032B01+ GGGGGTAATAGCCTCATATTTCTGTCTTTCTCGTCGCCGGTGCTTCAAAGCCCTAGCTTG
JMSF051F17+ AGCCTCATATTTCTGTCTTTCTCGTCGCCGGTGCTTCAAAGCCCTAGCTTG
JMFF036H01+ AGCCTCATATTTCTGTCTTTCTCGTCGCCGGTGCTTCAAAGCCCTAGCTTG
JMFS140F06+ GCCCTAGCTTG
JMSF036H19+ AGCTTG
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consensus GGGGGTAATAGCCTCATATTTCTGTCTTTCTCGTCGCCGGTGCTTCAAAGCCCTAGCTTG

. : . : . : . : . : . :
JMSF032B01+ CCTTGTCTCTCTTCATACTTCACAGACACACATGTAATAGTACAAACAGATACAAGCATA
JMSF051F17+ CCTTGTCTCTCTTCATACTTCACAGACACACATGTAATAGTACAAACAGATACAAGCATA
JMFF036H01+ CCTTGTCTCTCTTCATACTTCACAGACACACATGTAATAGTACAAACAGATACAAGCATA
JMFS140F06+ CCTTGTCTCTCTTCATACTTCACAGACACACATGTAATAGTACAAACAGATACAAGCATA
JMSF036H19+ CCTTGTCTCTCTTCATACTTCACAGACACACATGTAATAGTACAAACAGATACNAGCATA
JMFS118B06+ ACACATGTAATAGTACAAACAGATACAAGCATA
____________________________________________________________
consensus CCTTGTCTCTCTTCATACTTCACAGACACACATGTAATAGTACAAACAGATACAAGCATA

. : . : . : . : . : . :
JMSF032B01+ CGTTTCACTCTCCAGGAATTGTTGTGCTGCTCCTTTGATAATCGAATCGAAAAGGATGAT
JMSF051F17+ CGTTTCACTCTCCAGGAATTGTTGTGCTGCTCCTTTGATAATCGAATCGAAAAGGATGAT
JMFF036H01+ CGTTTCACTCTCCAGGAATTGTTGTGCTGCTCCTTTGATAATCGAATCGAAAAGGATGAT
JMFS140F06+ CGTTTCACTCTCCAGGAATTGTTGTGCTGCTCCTTTGATAATCGAATCGAAAAGGATGAT
JMSF036H19+ NGTTTCACTCNCCAGGAATTGTTGNGCTGCTCCTTTGATAATCGAATCGAAAAGGATGAT
JMFS118B06+ CGTTTCACTCTCCAGGAATTGTTGTGCTGCTCCTTTGATAATCGAATCGAAAAGGATGAT
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consensus CGTTTCACTCTCCAGGAATTGTTGTGCTGCTCCTTTGATAATCGAATCGAAAAGGATGAT

. : . : . : . : . : . :
JMSF032B01+ TATTTGTCATGGTATGGTAACAAAGATTGTGAGTTTGCCTATGTTTTTCATCGGGTCCCC
JMSF051F17+ TATTTGTCATGGTATGGTAACAAAGATTGTGAGTTTGCCTATGTTTTTCATCGGGTCCCC
JMFF036H01+ TATTTGTCATGGTATGGTAACAAAGATTGTGAGTTTGCCTATGTTTTTCATCGGGTCCCC
JMFS140F06+ TATTTGTCATGGTATGGTAACAAAGATTGTGAGTTTGCCTATGTTTTTCATCGGGTCCCC
JMSF036H19+ TATTTGTCATGGCATGGTAACAAAGATTGTGAGTTTGCCTATGTTTTTCATCGGGTCCCC
JMFS118B06+ TATTTGTCATGGTATGGTAACAAAGATTGTGAGTTTGCCTATGTTTTTCATCGGGTCCCC
____________________________________________________________
consensus TATTTGTCATGGTATGGTAACAAAGATTGTGAGTTTGCCTATGTTTTTCATCGGGTCCCC

. : . : . : . : . : . :
JMSF032B01+ GTATTGATCACTAGAATTTGGGATTAAGTTTCCACAGCAAATGGATCGGAAAGATACTTC
JMSF051F17+ GTATTGATCACTAGAATTTGGGATTAAGTTTCCACAGCAAATGGATCGGAAAGATACTTC
JMFF036H01+ GTATTGATCACTAGAATTTGGGATTAAGTTTCCACAGCAAATGGATCGGAAAGATACTTC
JMFS140F06+ GTATTGATCACTAGAATTTGGGATTAAGTTTCCACAGCAAATGGATCGGAAAGATACTTC
JMSF036H19+ GTATTGATCACTAGAATTTGGGATTAAGTTTCC
JMFS118B06+ GTATTGATCACTAGAATTTGGGATTAAGTTTCCACAGCAAATGGATCGGAAAGATACTTC
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consensus GTATTGATCACTAGAATTTGGGATTAAGTTTCCACAGCAAATGGATCGGAAAGATACTTC

. : . : . : . : . : . :
JMSF032B01+ GGGGTTTGTAAGTGGGGGTGGGGTGAACTAGCCCAAAGACATCTAACCATAGTTTTGTTA
JMSF051F17+ GGGGTTTGTAAGTGGGGGTGGGGTGAACTAGCCCAAAGACATCTAACCATAGTTTTGTTA
JMFF036H01+ GGGGTTTGTAAGTGGGGGTGGGGTGAACTAGCCCAAAGACATCTAACCATAGTTTTGTTA
JMFS140F06+ GGGGTTTGTAAGTGGGGGTGGGGTGAACTAGCCCAAAGACATCTAACCATAGTTTTGTTA
JMFS118B06+ GGGGTTTGTAAGTGGGGGTGGGGTGAACTAGCCCAAAGACATCTAACCATAGTTTTGTTA
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consensus GGGGTTTGTAAGTGGGGGTGGGGTGAACTAGCCCAAAGACATCTAACCATAGTTTTGTTA

. : . : . : . : . : . :
JMSF032B01+ CTAACTTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA
JMSF051F17+ CTAACTTANAAAAAAAACAAAAAAAAAA
JMFF036H01+ CTAACTTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA
JMFS140F06+ CTAACTTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAACCGGAAGTCAGGCTGATTGTTCTTTTTGC
JMFS118B06+ CTAACTTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAACCGGAAGTCAGGCTGATTGTTCTTTTTGC
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consensus CTAACTTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAACCGGAAGTCAGGCTGATTGTTCTTTTTGC

. : . : . : . : . : . :
JMFS140F06+ CCTTGAGATTTGGTCAAGAGTGTAGAATCTTGGCCAACCTGTTATGGACCCCATTTTCCA
JMFS118B06+ CCTTGAGATTTGGTCAAGAGTGTAGAATCTTGGCCAACCTGTTATGGACCCCATTTTCCA
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consensus CCTTGAGATTTGGTCAAGAGTGTAGAATCTTGGCCAACCTGTTATGGACCCCATTTTCCA

. : . : . : . : . : . :
JMFS140F06+ TGGTTTAGGTTATGCTGCAAACCTGTCCTCAAATGCATTTAAGAATCTGGGCAATCCAAT
JMFS118B06+ TGGTTTAGGTTATGCTGCAAACCTGTCCTCAAATGCATTTAAGAATCTGGGCAATCCAAT
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consensus TGGTTTAGGTTATGCTGCAAACCTGTCCTCAAATGCATTTAAGAATCTGGGCAATCCAAT

. : . : . : . : . : . :
JMFS140F06+ TCAATTTGGAGGGGCTGAAGGTGTAGGCGTAGGCGGTAATTGTGCAGATACCACCTTGCG
JMFS118B06+ TCAATTTGGAGGGGCTGAAGGTGTAGGCGTAGGCGGTAATTGTGCAGATACCACCTTGCG
____________________________________________________________
consensus TCAATTTGGAGGGGCTGAAGGTGTAGGCGTAGGCGGTAATTGTGCAGATACCACCTTGCG

. : . : . : . : . : . :
JMFS140F06+ ACTTGATTCCTTTAGTTCTTCAGCCCTTTCTATTCCTTCTTCAAAGGGAATCAAAAGACA
JMFS118B06+ ACTTGATTCCTTTAGTTCTTCAGCCCTTTCTATTCCTTCTTCAAAGGGAATCAAAAGAAA
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consensus ACTTGATTCCTTTAGTTCTTCAGCCCTTTCTATTCCTTCTTCAAAGGGAATCAAAAGAAA

. : . : . : . : . : . :
JMFS140F06+ ATGGAGCTCCATTGATGGATCTAT
JMFS118B06+ ATGGAGCTCCATTGATGGATCTATNAAATCAGCAGCTGGGTCCT
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consensus ATGGAGCTCCATTGATGGATCTATNAAATCAGCAGCTGGGTCCT