Alignment Contig 13251

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMSF008J17+ GATGGCACTTTCCTTCCCCAGTCCCCTCTCCATCTCTAAAACCCATAATGCACCAAATTT
JMSF016P07+ AGTCCCCTCTCCATCTCTAAAACCCATAATGCACCAAATTT
____________________________________________________________
consensus GATGGCACTTTCCTTCCCCAGTCCCCTCTCCATCTCTAAAACCCATAATGCACCAAATTT

. : . : . : . : . : . :
JMSF008J17+ CTAAAAAATTTGTTTCATTTTAAAATAAAGATTCAATTTTTATTTGTTTGTTTCTCATTC
JMSF016P07+ CTAAAAAATTTGTTTCATTTTAAAATAAAGATTCAATTTTTATTTGTTTGTTTCTCATTC
JMSF009C03+ GTTTCATTTTAAAATAAAGATTCAATTTTTATTTGTTTGTTTCTCATTC
____________________________________________________________
consensus CTAAAAAATTTGTTTCATTTTAAAATAAAGATTCAATTTTTATTTGTTTGTTTCTCATTC

. : . : . : . : . : . :
JMSF008J17+ CAAGTATACAACTTGTTCCTCTCTTTATCCTTTATTTTAAAGTCTCTTTAAACCTTACCC
JMSF016P07+ CAAGTATACAACTTGTTCCTCTCTTTATCCTTTATTTTAAAGTCTCTTTAAACCTTACCC
JMSF009C03+ CAAGTATACAACTTGTTCCTCTCTTTATCCTTTATTTTAAAGTCTCTTTAAACCTTACCC
JMSF045L01+ AAAGTCTCTTTAAACCTTACCC
JMSF036E03+ AAAGTCTCTTTAAACCTTACCC
____________________________________________________________
consensus CAAGTATACAACTTGTTCCTCTCTTTATCCTTTATTTTAAAGTCTCTTTAAACCTTACCC

. : . : . : . : . : . :
JMSF008J17+ TCCAATGGCAAGTTTGGCAGCAAGCAAGCCATGTGTTTTGGTGTTTTTTTCTTTTCCCCT
JMSF016P07+ TCCAATGGCAAGTTTGGCAGCAAGCAAGCCATGTGTTTTGGTGTTTTTTTCTTTTCCCCT
JMSF009C03+ TCCAATGGCAAGTTTGGCAGCAAGCAAGCCATGTGTTTTGGTGTTTTTTTCTTTTCCCCT
JMSF045L01+ TCCAATGGCAAGTTTGGCAGCAAGCAAGCCATGTGTTTTGGTGTTTTTTTCTTTTCCCCT
JMSF036E03+ TCCAATGGCAAGTTTGGCAGCAAGCAAGCCATGTGTTTTGGTGTTTTTTTCTTTTCCCCT
____________________________________________________________
consensus TCCAATGGCAAGTTTGGCAGCAAGCAAGCCATGTGTTTTGGTGTTTTTTTCTTTTCCCCT

. : . : . : . : . : . :
JMSF008J17+ TACTACTAGTGCCGCATAAATAGATCTGTGTAGATCTTGGGCTTCTTGGGTCAAGTTCCC
JMSF016P07+ TACTACTAGTGCCGCATAAATAGATCTGTGTAGATCTTGGGCTTCTTGGGTCAAGTTCCC
JMSF009C03+ TACTACTAGTGCCGCATAAATAGATCTGTGTAGATCTTGGGCTTCTTGGGTCAAGTTCCC
JMSF045L01+ TACTACTAGTGCCGCATAAATAGATCTGTGTAGATCTTGGGCTTCTTGGGTCAAGTTCCC
JMSF036E03+ TACTACTAGTGCCGCATAAATAGATCTGTGTAGATCTTGGGCTTCTTGGGTCAAGTTCCC
JMFF048D22+ AGTTCCC
JMFF027N13+ GGGTCAAGTTCCC
JMFF024B15+ GGGTTAAGTTCCC
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consensus TACTACTAGTGCCGCATAAATAGATCTGTGTAGATCTTGGGCTTCTTGGGTCAAGTTCCC

. : . : . : . : . : . :
JMSF008J17+ ACAATGGGTCATTCATGGTTTTTGCAAATGAGGTTGTGGATATTGGTTTTGGGGGTGTTC
JMSF016P07+ ACAATGGGTCATTCATGGTTTTTGCAAATGAGGTTGTGGATATTGGTTTTGGGGGTGTTC
JMSF009C03+ ACAATGGGTCATTCATGGTTTTTGCAAATGAGGTTGTGGATATTGGTTTTGGGGGTGTTC
JMSF045L01+ ACAATGGGTCATTCATGGTTTTTGCAAATGAGGTTGTGGATATTGGTTTTGGGGGTGTTC
JMSF036E03+ ACAATGGGTCATTCATGGTTTTTGCAAATGAGGTTGTGGATATTGGTTTTGGGGGTGTTC
JMFF048D22+ ACAATGGGTCATTCATGGTTTTTGCAAATGAGGTTGTGGATATTGGTTTTGGGGGTGTTC
JMFF027N13+ ACAATGGGTCATTCATGGTTTTTGCAAATGAGGTTGTGGATATTGGTTTTGGGGGTGTTC
JMFF024B15+ ACAATGGGTCATTCATGGTTTTTGCAAATGAGGTTGTGGATATTGGTTTTGGGGGTGTTC
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consensus ACAATGGGTCATTCATGGTTTTTGCAAATGAGGTTGTGGATATTGGTTTTGGGGGTGTTC

. : . : . : . : . : . :
JMSF008J17+ AATGTGAGCTTGANTTCTGGGTCT
JMSF016P07+ AATGTGAGCTTGATTTCTGGGTCTGAAACTCTTGGTGATAAAGGTAGTGTATATGTGGAT
JMSF009C03+ AATGTGAGCTTGATTTCTGGGTCTGAAAC
JMSF045L01+ AATGTGAGCTTGATTTCTGGGTCTGAAACTCTTGGTGATAAAGGTAGTGTATATGTGGAT
JMSF036E03+ AATGTGAGCTTGATTTCTGGGTCTGAAACTCTTGGTGATAAAGGTAGTGTATATGTGGAT
JMFF048D22+ AATGTGAGCTTGATTTCTGGGTCTGAAACTCTTGGTGATAAAGGTAGTGTATATGTGGAT
JMFF027N13+ AATGTGAGCTTGATTTCTGGGTCTGAA-CTCTTGGTGATAAAGGTAGTGTATATGTGGAT
JMFF024B15+ AATGTGAGCTTGATTTCTGGGTCTGAAACTCTTGGTGATAAAGGTAGTGTATATGTGGAT
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consensus AATGTGAGCTTGATTTCTGGGTCTGAAACTCTTGGTGATAAAGGTAGTGTATATGTGGAT

. : . : . : . : . : . :
JMSF016P07+ GGGAAAAGTAGGA
JMSF045L01+ GGGAAAAGTAGGATTGGGAGGACAGACAGTGATTTCATATGTGCTACCTTGGATTGGTGG
JMSF036E03+ GGGAAAAGTAGGATTGGGAGGACAGACAGTGATTTCATATGTGCTACCTTGGATTGGTGG
JMFF048D22+ GGGAAAAGTAGGATTGGGAGGACAGACAGTGATTTCATATGTGCTACCTTGGATTGGTGG
JMFF027N13+ GGGAAAAGTAGGATTGGGAGGACAGACAGTGATTTCATATGTGCTACCTTGGATTGGTGG
JMFF024B15+ GGGAAAAGTAGGATTGGGAGGACAGACAGTGATTTCATATGTGCTACCTTGGATTGGTGG
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consensus GGGAAAAGTAGGATTGGGAGGACAGACAGTGATTTCATATGTGCTACCTTGGATTGGTGG

. : . : . : . : . : . :
JMSF045L01+ CCACCTGAGAAGTGTGACTATGGAACCTGTGCTTGGGGCCATGCTTCTCTGCTAAATTTG
JMSF036E03+ CCACCTGAGAAGTGTGACTATGGAACCTGTGCTTGGGGCCATGCTTCTCTGCTAAATTTG
JMFF048D22+ CCACCTGAGAAGTGTGACTATGGAACCTGTGCTTGGGGCCATGCTTCTCTGCTAAATTTG
JMFF027N13+ CCACCTGAGAAGTGTGACTATGGAACCTGTGCTTGGGGCCATGCTTCTCTGCTAAATTTG
JMFF024B15+ CCACCTGAGAAGTGTGACTATGGAACCTGTGCTTGGGGCCATGCTTCTCTGCTAAATTTG
____________________________________________________________
consensus CCACCTGAGAAGTGTGACTATGGAACCTGTGCTTGGGGCCATGCTTCTCTGCTAAATTTG

. : . : . : . : . : . :
JMSF045L01+ GATCTTAGTAACATTATTTTTTTAAATGCAATAAAAGCATTCTCACCTTTAAAAATTCGG
JMSF036E03+ GATCTTAGTAACATTATTTTTTTAAATGCAATAAAAGCATTCTCACCTTTAAAAATTCGG
JMFF048D22+ GATCTTAGTAACATTATTTTTTTAAATGCAATAAAAGCATTCTCACCTTTAAAAATTCGG
JMFF027N13+ GATCTTAGTAACATTATTTTTTTAAATGCAATAAAAGCATTCTCACCTTTAAAAATTCGG
JMFF024B15+ GATCTTAGTAACATTATTTTTTTAAATGCAATAAAAGCATTCTCACCTTTAAAAATTCGG
JMFS119G11+ ACCTTTAAAAATTCGG
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consensus GATCTTAGTAACATTATTTTTTTAAATGCAATAAAAGCATTCTCACCTTTAAAAATTCGG

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JMSF045L01+ TTGGGTGGCACTTTGCAAGATAAGGTCGTCTACCAAACTAAAGATGATCGTGTACCTTGC
JMSF036E03+ TTGGGTGGCACTTTGCAAGATAAGGTCGTCTACCAAACTAAAGATGATCGTGTACCTTGC
JMFF048D22+ TTGGGTGGCACTTTGCAAGATAAGGTCGTCTACCAA-CTAAAGATGATCGTGTACCTTGC
JMFF027N13+ TTGGGTGGCACTTTGCAAGATAAGGTCGTCTACCNAACTAAAGATGATCGTGTACCTTGC
JMFF024B15+ TTGGGTGGCACTTTGCAAGATAAGGTCGTCTACCAAACTAAAGATGATCGTGTACCTTGC
JMFS119G11+ TTGGGTGGCACTTTGCAAGATAAGGTCGTCTACCAAACTAAAGATGATCGTGTACCTTGC
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consensus TTGGGTGGCACTTTGCAAGATAAGGTCGTCTACCAAACTAAAGATGATCGTGTACCTTGC

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JMSF045L01+ ACTTCATTTGTTTCAAACACATCAGAAATATTTTCTTTCAGTCAAGGGTGTTTGCCGTTG
JMSF036E03+ ACTTCATTTGTTTCAAACACATCAGAAATATTTTCTTTCAGTCAAGGGTGTTTGCCGTTG
JMFF048D22+ ACTTCATTTGTTTCAAACACATCAGAAATATTTTCTTT
JMFF027N13+ ACTTCATTTGTTTCAAACACATCAGAAATATTTTCTTTCA
JMFF024B15+ ACTTCATTTGTTTCAAACACATCAGAAATATTTTCTTTCAGTCAAGGGTGTTTGCCGTTG
JMFS119G11+ ACTTCATTTGTTTCAAACACATCAGAAATATTTTCTTTCAGTCAAGGGTGTTTGCCGTTG
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consensus ACTTCATTTGTTTCAAACACATCAGAAATATTTTCTTTCAGTCAAGGGTGTTTGCCGTTG

. : . : . : . : . : . :
JMSF045L01+ TCTAGATGGGACGAGCTAAATGTGTTCTTTAATAAATCCGG
JMSF036E03+ TCTAGATGGGACGAGCTAAATGTGTTCTTTAATAAATCCGG
JMFF024B15+ TCTAGATGGGACGAGCTAAATGTGTTCTTTAATAAATCCGG
JMFS119G11+ TCTAGATGGGACGAGCTAAATGTGTTCTTTAATAAATCCGGGTAACCAACGAGATTCATT
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consensus TCTAGATGGGACGAGCTAAATGTGTTCTTTAATAAATCCGGGTAACCAACGAGATTCATT

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JMFS119G11+ CCTTGTCCAGCTTATATATGTCAGCACTCCTAACTGTATGTATCATCTTTGCGTGTTCTA
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consensus CCTTGTCCAGCTTATATATGTCAGCACTCCTAACTGTATGTATCATCTTTGCGTGTTCTA

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JMFS119G11+ CTCAGAGCTGTTATCATTTTTGGCTTGAACGCTCTCACGGGAAGATCTATACGGTCCGAT
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consensus CTCAGAGCTGTTATCATTTTTGGCTTGAACGCTCTCACGGGAAGATCTATACGGTCCGAT

. : . : . : . : . : . :
JMFS119G11+ GCTTCTGCTGTTGGAGCCTGGGATTCAACAAACGCTGAATCTCTTATGAAATATACTGTC
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consensus GCTTCTGCTGTTGGAGCCTGGGATTCAACAAACGCTGAATCTCTTATGAAATATACTGTC

. : . : . : . : . : . :
JMFS119G11+ GAAAAGGGTTACACTATCCACGGGTGGGAGTTGGGTAAGATCAGAGAAGTCGCTATTTCT
____________________________________________________________
consensus GAAAAGGGTTACACTATCCACGGGTGGGAGTTGGGTAAGATCAGAGAAGTCGCTATTTCT

. : . : . : . : . : . :
JMFS119G11+ TAGCACTGCAACATTTTGTATATTGTGTATATTCCAAACATCAGCATCTATCTTTGATTC
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consensus TAGCACTGCAACATTTTGTATATTGTGTATATTCCAAACATCAGCATCTATCTTTGATTC

. : . : . : . : . : . :
JMFS119G11+ TCTGCTTTAAGTAAAACTATTTGTTAGGCGAAGCCTGNGAAAGGCCAAGTCTAGCACCCG
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consensus TCTGCTTTAAGTAAAACTATTTGTTAGGCGAAGCCTGNGAAAGGCCAAGTCTAGCACCCG

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JMFS119G11+ GTGGTGTCTGGGGGTTGTTGGGCAGTGGCCGATAAAGGGCTTAAAAGGGCCATGTCCACC
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consensus GTGGTGTCTGGGGGTTGTTGGGCAGTGGCCGATAAAGGGCTTAAAAGGGCCATGTCCACC

. : . : . : . : . : . :
JMFS119G11+ ACCCAGTGTCT
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consensus ACCCAGTGTCT