Alignment Contig 12108

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMSF038G01+ GACTGACCGCTGGTCCCCAGTCTCGTCTTCAGCTGAACTTCATCTTCCTCCCTCTCTCTC
JMFF006C18+ GGTCCCCAGTCTCGTCTTCAGCTGAACTTCATCTTCCTCCCTCTCTCTC
JMFF029K18+ GGTCCCCAGTCTCGTCTTCAGCTGAACTTCATCTTCCTCCCTCTCTCTC
JMSF013M23+ GGTCCCCAGTCTCGTCTTCAGCTGAACTTCATCTTCCTCCCTCTCTCTC
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consensus GACTGACCGCTGGTCCCCAGTCTCGTCTTCAGCTGAACTTCATCTTCCTCCCTCTCTCTC

. : . : . : . : . : . :
JMSF038G01+ TCTCTCTCTCTATCTCCTAAGCTCTAAACTGTTCTTCAACAGTAGAGAATGGTGGCCTGT
JMFF006C18+ TCTCTCTCTCTATCTCCTAAGCTCTAAACTGTTCTTCAACAGTAGAGAATGGTGGCCTGT
JMFF029K18+ TCTCTCTCTCTATCTCCTAAGCTCTAAACTGTTCTTCANCAGTAGAGAATGGTGGCCTGT
JMSF013M23+ TCTCTCTCTCTATCTCCTAAGCTCTAAACTGTTCTTCAACAGTAGAGAATGGTGGCCTGT
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consensus TCTCTCTCTCTATCTCCTAAGCTCTAAACTGTTCTTCAACAGTAGAGAATGGTGGCCTGT

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JMSF038G01+ TGTAGTCTATAATTCAGTCTCTTAATCTCTCATTAATTACTTATTGGTAACGCTTTTTGG
JMFF006C18+ TGTAGTCTATAATTCAGTCTCTTAATCTCTCATTAATTACTTATTGGTAACGCTTTTTGG
JMFF029K18+ TGTAGTCTATAATTCANTCTCTTAATCTCTCATTAATTACTTATTGGTAACGCTTTTTGG
JMSF013M23+ TGTAGTCTATAATTCAGTCTCTTAATCTCTCATTAATTACTTATTGGTAACGCTTTTTGG
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consensus TGTAGTCTATAATTCAGTCTCTTAATCTCTCATTAATTACTTATTGGTAACGCTTTTTGG

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JMSF038G01+ CGATTGTATAATACAGGATATCGGTTTGATAAATTCGATCGGTTTTCTTAGGGGAAAGAG
JMFF006C18+ CGATTGTATAATACAGGATATCGGTTTGATAAATTCGATCGGTTTTCTTAGGGGAAAGAG
JMFF029K18+ CGATTGTATAATACAGGATATCGGTTTGATAAATTCGATCGGTTTTCTTAGGGGAAAGAG
JMSF013M23+ CGATTGTATAATACAGGATATCGGTTTGATAAATTCGATCGGTTTTCTTAGGGGAAAGAG
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consensus CGATTGTATAATACAGGATATCGGTTTGATAAATTCGATCGGTTTTCTTAGGGGAAAGAG

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JMSF038G01+ GGATTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTCTGTTGTGAATTGAGGAAATGCCGGGAA
JMFF006C18+ GGATTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTCTGTTGTGAATTGAGGAAATGCCGGGAA
JMFF029K18+ GGATTTTTTTGTTTTG
JMSF013M23+ GGATTTTTTTGNTTTG
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consensus GGATTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTCTGTTGTGAATTGAGGAAATGCCGGGAA

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JMSF038G01+ TAGTTTCAGTTAAAACGCCGCCGGAAGCTACGCCATTGAGAATCACAGTTCCAGACGAGA
JMFF006C18+ TAGTTTCAGTTAAAACGCCGCCGGAAGCTACGCCATTGAGAATCACAGTTCCAGACGAGA
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consensus TAGTTTCAGTTAAAACGCCGCCGGAAGCTACGCCATTGAGAATCACAGTTCCAGACGAGA

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JMSF038G01+ GTCAAGGCCAGATCGGAGCTAATTCGAGTAGATCCGAGAATGTTAACACGAAGCCCAGCT
JMFF006C18+ GTCANGGCCAGATCGGAGCTAATTCGAGTAGATCCGAGAATGTTAACACGAAGCCCAGCT
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consensus GTCAAGGCCAGATCGGAGCTAATTCGAGTAGATCCGAGAATGTTAACACGAAGCCCAGCT

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JMSF038G01+ CGCCAGCTCCACGGCGTCCTCCCTCTCCTTCCCCGTCCACCTCACGAGCCAAGCCGTCGC
JMFF006C18+ CGCCAGCTCCACGGCGTCCTCCCTCTCCTTCCCCGTCCACCTCACGAGCCAAGCCGTCGC
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consensus CGCCAGCTCCACGGCGTCCTCCCTCTCCTTCCCCGTCCACCTCACGAGCCAAGCCGTCGC

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JMSF038G01+ CGGATCGGGGCTCCGGAAAGAAGAAATCGCCGCCGGAGAAGGCTGTTATCGACGAATCGT
JMFF006C18+ CGGATCGGGGCTCCGGAAA
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consensus CGGATCGGGGCTCCGGAAAGAAGAAATCGCCGCCGGAGAAGGCTGTTATCGACGAATCGT

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JMSF038G01+ CGCTTGACAACCCGGATCTCGGGCCATTCCTGTTGAAGCTCGCTCGGGACACGATTGCGT
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consensus CGCTTGACAACCCGGATCTCGGGCCATTCCTGTTGAAGCTCGCTCGGGACACGATTGCGT

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JMSF038G01+ CCGGTGAGGGT
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consensus CCGGTGAGGGT