Alignment Contig 11961

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMSF015J12+ GACCGATTTCTCTCTCTAAAGCGCTTCTCTATGTTCGACTTTCTCTCTCTCTAGTTCTCT
JMFF003E09+ CTCTCTAAAGCGCTTCTCTATGTTCGACTTTCTCTCTCTCTAGTTCTCT
JMFF025I08+ CTCTCTAAAGCGCTTCTCTATGTTCGACTTTCTCTCTCTCTAGTTCTCT
JMFS066F03+ AGCGCTTCTCTATGTTCGACTTTCTCTCTCTCTAGTTCTCT
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consensus GACCGATTTCTCTCTCTAAAGCGCTTCTCTATGTTCGACTTTCTCTCTCTCTAGTTCTCT

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JMSF015J12+ CTCTCTCGTGAATGGCCGTTATCTCTCCCACTTGGAAATTAGGGCTCGGAATTGTTGTGA
JMFF003E09+ CTCTCTCGTGAATGGCCGTTATCTCTCCCACTTGGAAATTAGGGCTCGGAATTGTTGTGA
JMFF025I08+ CTCTCTCGTGAATGGCCGTTATCTCTCCCACTTGGAAATTAGGGCTCGGAATTGTTGTGA
JMFS066F03+ CTCTCTCGTGAATGGCCGTTATCTCTCCCACTTGGAAATTAGGGCTCGGAATTGTTGTGA
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consensus CTCTCTCGTGAATGGCCGTTATCTCTCCCACTTGGAAATTAGGGCTCGGAATTGTTGTGA

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JMSF015J12+ TCCCCCGGGGAAACTACGCCGCGAACAAGATGTGATTTCCCTAGAGCTTAGCGGTTAATT
JMFF003E09+ TCCCCCGGGGAAACTACGCCGCGAACAAGATGTGATTTCCCTAGAGCTTAGCGGTTAATT
JMFF025I08+ TCCCCCGGGGAAACTACGCCGCGAACAAGATGTGATTTCCCTAGAGCTTAGCGGTTAATT
JMFS066F03+ TCCCCCGGGGAAACTACGCCGCGAACAAGATGTGATTTCCCTAGAGCTTAGCGGTTAATT
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consensus TCCCCCGGGGAAACTACGCCGCGAACAAGATGTGATTTCCCTAGAGCTTAGCGGTTAATT

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JMSF015J12+ TTGTGCGAAATTCGTTTTTTACCCCCCCGGTTAATGTTTTGTGGTTTGCCTAGGGTTTCT
JMFF003E09+ TTGTGCGAAATTCGTTTTTTACCCCCCCGGTTAATGTTTTGTGGTTTGCCTAGGGTTTCT
JMFF025I08+ TTGTGCGAAATTCGTTTTTTACCCCCCCGGTTAATGTTTTGTGGTTTGCCTAGGGTTTCT
JMFS066F03+ TTGTGCGAAATTCGTTTTTTACCCCCCCGGTTAATGTTTTGTGGTTTGCCTAGGGTTTCT
JMFF042P13+ GGTTTCT
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consensus TTGTGCGAAATTCGTTTTTTACCCCCCCGGTTAATGTTTTGTGGTTTGCCTAGGGTTTCT

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JMSF015J12+ GAGCTGTAAGTGTTGTTGCGCATGAAGGGCCCGTTAGATCGAACGAAGATTGTGCTGCGG
JMFF003E09+ GAGCTGTAAGTGTTGTTGCGCATGAAGGGCCCGTTAGATCGAACGAAGATTGTGCTGCGG
JMFF025I08+ GAGCTGTAAGTGTTGTTGCGCATGAAGGGCCCGTTAGATCGAACGAAGATTGTGCTGCGG
JMFS066F03+ GAGCTGTAAGTGTTGTTGCGCATGAAGGGCCCGTTAGATCGAACGAAGATTGTGCTGCGG
JMFF042P13+ GAGCTGTAAGTGTTGTTGCGCATGAAGGGCCCGTTAGATCGAACGAAGATTGTGCTGCGG
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consensus GAGCTGTAAGTGTTGTTGCGCATGAAGGGCCCGTTAGATCGAACGAAGATTGTGCTGCGG

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JMSF015J12+ CACTTGCCGCCGGCGCTTCCCCGTTCTACGCTGTCTGAGCAAATTGATTCTCGCTTTTCT
JMFF003E09+ CACTTGCCGCCGGCGCTTCCCCGTTCTACGCTGTCTGAGCAAATTGATTCTCGCTTTTCT
JMFF025I08+ CACTTGCCGCCGGCGCTTCCCCGTTCTACGCTGTCTGAGCAAATTGATTCTCGCTTTTCT
JMFS066F03+ CACTTGCCGCCGGCGCTTCCCCGTTCTACGCTGTCTGAGCAAATTGATTCTCGCTTTTCT
JMFF042P13+ CACTTGCCGCCGGCGCTTCCCCGTTCTACGCTGTCTGAGCAAATTGATTCTCGCTTTTCT
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consensus CACTTGCCGCCGGCGCTTCCCCGTTCTACGCTGTCTGAGCAAATTGATTCTCGCTTTTCT

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JMSF015J12+ GGTCGCTACCACTGGCTCTCCTTTCGGCCTGGGAAAACCAGCCAAAAACATCAACCTTAT
JMFF003E09+ GGTCGCTACCACTGGCTCTCCTTTCGGCCTGGGAAAACCAGCCAAAAACATCAACCTTAT
JMFF025I08+ GGTCGCTACCACTGGCTCTCCTTTCGGCCTGGGAAAACCAGCCAAAAACATCAACCTTAT
JMFS066F03+ GGTCGCTACCACTGGCTCTCCTTTCGGCCTGGGAAAACCAGCCAAAAACATCAACCTTAT
JMFF042P13+ GGTCGCTACCACTGGCTCTCCTTTCGGCCTGGGAAAACCAGCCAAAAACATCAACCTTAT
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consensus GGTCGCTACCACTGGCTCTCCTTTCGGCCTGGGAAAACCAGCCAAAAACATCAACCTTAT

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JMSF015J12+ TCAAGAGCATATATTAACTTTAAGACACCTGAAGATGTTGTTGAGTTTGCAGAGTTCTTT
JMFF003E09+ TCAAGAGCATATATTAACTTTAAGACACCTGAAGATGTTGTTGAGTTTGCAGAGTTCTTT
JMFF025I08+ TCAAGAGCATATATTAACTTTAAGACACCTGAAGATGTTGTTGAGTTTGCAGAGTTCTTT
JMFS066F03+ TCAAGAGCATATATTAACTTTAAGACACCTGAAGATGTTGTTGAGTTTGCAGAGTTCTTT
JMFF042P13+ TCAAGAGCATATATTAACTTTAAGACACCTGAAGATGTTGTTGAGTTTGCAGAGTTCTTT
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consensus TCAAGAGCATATATTAACTTTAAGACACCTGAAGATGTTGTTGAGTTTGCAGAGTTCTTT

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JMSF015J12+ AATGGACAT
JMFF003E09+ AATGGACATGTCTTTGTTAACGAGAAAGGGTCTCAGTTCAAAACAATTGTTGAGTATGCC
JMFF025I08+ AATGGACATGTCTTTGTTAACGAGAAAGGGTCTCAGTTCAAAACAATTGTTGAGTATGCC
JMFS066F03+ AATGGACATGTCTTTGTTAACGAGAAAGGGTCTCAGTTCAAAACAATTGTTGAGTATGCC
JMFF042P13+ AATGGACATGTCTTTGTTAACGAGAAAGGGTCTCAGTTCAAAACAATTGTTGAGTATGCC
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consensus AATGGACATGTCTTTGTTAACGAGAAAGGGTCTCAGTTCAAAACAATTGTTGAGTATGCC

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JMFF003E09+ CCTTTACAGCGTGCTCCAAGGCAGTGGTCTAA
JMFF025I08+ CCTTTACAGCGT
JMFS066F03+ CCTTTACAGCGTGCTCCAAGGCAGTGGTCTAAGAAAGATGGCCGTGAAGGGGCTATCTTG
JMFF042P13+ CCTTTACAGCGTGCTCCAAGGCAGTGGTCTAAGAAAGATGGCCGTGAAGGGGCTATCTTG
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consensus CCTTTACAGCGTGCTCCAAGGCAGTGGTCTAAGAAAGATGGCCGTGAAGGGGCTATCTTG

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JMFS066F03+ AAAGATCCTGAATATCTGGAGTTCCTAGAATTTATTGGAAAGCCTG
JMFF042P13+ ANAGATCCTGAATATCTGGAGTTCCTAGAATTTATTGGAAAGCCTGTTGTGTATCTTCCT
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consensus AAAGATCCTGAATATCTGGAGTTCCTAGAATTTATTGGAAAGCCTGTTGTGTATCTTCCT

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JMFF042P13+ A
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consensus A