Alignment Contig 10340

                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :

JMFF050O07+ GGTTGTGCCATTTCCATTGTTTCTCCGCTGTTCATAGATCGTCGGTTTTAGGTTAAAAAA
JMFF026D08+ GTTGTGCCATTTCCATTGTTTCTCCGCTGTTCATAGATCGTCGGTTTTAGGTTAAAAAA
JMFF051M02+ GTTGCGCCATTTCCATTGTTTCTCCGCTGTTCATAGATCGTCGGTTTTAGGTTAAAAAA
JMFF028D16+ GTTGTGCCATTTCCATTGTTTCTCCGCTGTTCATAGATCGTCGGTTTTAGGTTAAAAAA
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consensus GGTTGTGCCATTTCCATTGTTTCTCCGCTGTTCATAGATCGTCGGTTTTAGGTTAAAAAA

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JMFF050O07+ ATCAAATCGCTGTTGTCTTCTAAGCCTGGGT----GAATATGCCTCGTTACGATGATCGG
JMFF018F16+ GGT----GAATATGCCTCGTTACGATGATCGG
JMFF026D08+ ATCAAATCGCTGTTGTCTTCTAAGCCTGGGTAGGTGAATATGCCTCGTTACGATGATCGG
JMFF051M02+ ATCAAATCGCTGTTGTCTTCTAAGCCTGGGT----GAATATGCCTCGTTACGATGATCGG
JMFF028D16+ ATCAAATCGCTGTTGTCTTCTAAGCCTGGGT----GAATATGCCTCGTTACGATGATCGG
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consensus ATCAAATCGCTGTTGTCTTCTAAGCCTGGGT----GAATATGCCTCGTTACGATGATCGG

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JMFF050O07+ TATGGTAGTGCGACCCGTCTCTATGTGGGTCATTTGTCTTCTCGTACCCGTTCTCGTGAT
JMFF018F16+ TATGGTAGTGCGACCCGTCTCTATGTGGGTCATTTGTCTTCTCGTACCCGTTCTCGTGAT
JMFF026D08+ TATGGTAGTGCGACCCGTCTCTATGTGGGTCATTTGTCTTCTCGTACCCGTTCTCGTGAT
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consensus TATGGTAGTGCGACCCGTCTCTATGTGGGTCATTTGTCTTCTCGTACCCGTTCTCGTGAT

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JMFF050O07+ TTGGAGCGCTTGTTCTGCAAATACGGGAGAGTACGAGATGTGGACATGAAGCGTGACTAT
JMFF018F16+ TTGGAGCGCTTGTTCTGCAAATACGGGAGAGTACGAGATGTGGACATGAAGCGTGACTAT
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consensus TTGGAGCGCTTGTTCTGCAAATACGGGAGAGTACGAGATGTGGACATGAAGCGTGACTAT

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JMFF050O07+ GCCTTCATTGATTTTAGTGACCCTCGGGATGCTGATGATGCAAGACGTTATTATGATGGG
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consensus GCCTTCATTGATTTTAGTGACCCTCGGGATGCTGATGATGCAAGACGTTATTATGATGGG

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JMFF050O07+ CGTGAAGTTGATGGACGCCGTATAATTGTGGAATTTGCTAAGGGAGTGCCACGGGGTCCA
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consensus GGTGGTTCCCGAGATTATCTTGGTCGTGGGCCCCCTCCTGGTTCAGGTCGTTGCTTCAAC

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JMFF050O07+ TGTGGAATTGAAGGTCATTGGGCCCGTGATTGCAAAGCTGGTGATTGGAAAAACAAGTGC
JMFF018F16+ TGTGGAATTGAAGGTCATTGGGCCCGTGATTGCAAAGCTGGTGATTGGAAAA
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consensus TGTGGAATTGAAGGTCATTGGGCCCGTGATTGCAAAGCTGGTGATTGGAAAAACAAGTGC

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JMFF050O07+ TATAGGTGTGGAGAAAGAGGTCATATAGAANAGAAATGTCCAAATAGTCCACAGAAGCTC
JMFF028D16+ TATAGGTG
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consensus TATAGGTGTGGAGAAAGAGGTCATATAGAANAGAAATGTCCAAATAGTCCACAGAAGCTC

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JMFF050O07+ ANACGTGGAAGGAGTTTCTCAAGGACACCTGAGAGATCACGTTCTCCTCCCCGTGGCCGG
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consensus ANACGTGGAAGGAGTTTCTCAAGGACACCTGAGAGATCACGTTCTCCTCCCCGTGGCCGG

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JMFF050O07+ AGGCATAGTCGAAGTTACAGCCCAAGCCGC
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consensus AGGCATAGTCGAAGTTACAGCCCAAGCCGC