Previous Contig 005398:  Sequence
BLAST Hits against nr-aa DB Show

clone5'-sequence3'-sequence
Seq.lengthcontigBestHitEvaluedescriptionlengthcontigBestHitEvaluedescription
JMFS086E09Sequence635005398 (4)
JMSF007P12Sequence251005398 (4)745011410 (2)
JMSF009C10Sequence308005398 (4)761011488 (2)
JMSF013F17Sequence473005398 (4)687011488 (2)

Alignment

This contig is upended


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JMFS086E09+ TTCATAATTATTGAACTCTATGTTCATAATATAAAACTCTATGTTCATAATTT
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consensus TTCATAATTATTGAACTCTATGTTCATAATATAAAACTCTATGTTCATAATTT
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS086E09+ NTGAACTTCATATTCACAATTATTGAACTCTATATTCACAATTACAGAACTCTATTATTA
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consensus NTGAACTTCATATTCACAATTATTGAACTCTATATTCACAATTACAGAACTCTATTATTA
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS086E09+ TAATTATAGAACTCTATTTTCATAATTTTTAAACTCCATATTCACAATTATGAACAGTTT
                      ____________________________________________________________
consensus TAATTATAGAACTCTATTTTCATAATTTTTAAACTCCATATTCACAATTATGAACAGTTT
 
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JMFS086E09+ TGGAACCGTGTCAGAGGTTCCAGATAGACACGGTTCCACAGCATAATTTGCCCCTTGGAT
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consensus TGGAACCGTGTCAGAGGTTCCAGATAGACACGGTTCCACAGCATAATTTGCCCCTTGGAT
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS086E09+ TATTAGGGGTAACACTTGAGACCTGGGTCGGATCTTTGGTTAGTGGATCCGGTCTTTGGT
                      ____________________________________________________________
consensus TATTAGGGGTAACACTTGAGACCTGGGTCGGATCTTTGGTTAGTGGATCCGGTCTTTGGT
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS086E09+ TAATGAATCGGCATTATTAATTAAAGATCCGACCCATCTTACAGATTTAGATTCGTGAGA
JMSF013F17+ TCGGCATTATTAATTAAAGATCCGACCCATCTTACAGATTTAGATTCGTGAGA
                      ____________________________________________________________
consensus TAATGAATCGGCATTATTAATTAAAGATCCGACCCATCTTACAGATTTAGATTCGTGAGA
 
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JMFS086E09+ TGGTCTCACACAAGTTTTTGTAGATTATTAAATTTAACCAATACAATCTAGTGAACGCAC
JMSF013F17+ TGGTCTCACACAAGTTTTTGTAGATTATTAAATTTAACCAATACAATCTAGTGAACGCAC
                      ____________________________________________________________
consensus TGGTCTCACACAAGTTTTTGTAGATTATTAAATTTAACCAATACAATCTAGTGAACGCAC
 
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JMFS086E09+ AATCAAAAAGAGATAAACATTTCGGAGTATAAAAAGGTAAAGGAATTGAGTGATGTTGGA
JMSF009C10+ CGGAGTATAAAAAGGTAAAGGAATTGAGTGATGTTGGA
JMSF013F17+ AATCAAAAAGAGATAAACATTTCGGAGTATAAAAAGGTAAAGGAATTGAGTGATGTTGGA
                      ____________________________________________________________
consensus AATCAAAAAGAGATAAACATTTCGGAGTATAAAAAGGTAAAGGAATTGAGTGATGTTGGA
 
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JMFS086E09+ GAAGTAGGAAACATACCTTAAATTAGGTTGGTGAAGATGGATCGGAAATGGAGTTAGTGA
JMSF009C10+ GAAGTAGGAAACATACCTTAAATTAGGTTGGTGAAGATGGATCGGAAATGGAGTTAGTGA
JMSF007P12+ ATGGAGTTAGCGA
JMSF013F17+ GAAGTAGGAAACATACCTTAAATTAGGTTGGTGAAGATGGATCGGAAATGGAGTTAGTGA
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consensus GAAGTAGGAAACATACCTTAAATTAGGTTGGTGAAGATGGATCGGAAATGGAGTTAGTGA
 
. : . : . : . : . : . :
JMFS086E09+ ATTGGGTTTGGGTAATATCAGATGAGAGATTGAAGGTCTGAGTTAGTTGT
JMSF009C10+ ATTGGGTTTGGGTAATATCAGATGAGAGATTGAAGGTCTGAGTTAGTTGTACTGTTGAAA
JMSF007P12+ ATTGGGTTTGGGTAATATCAGATAAGAGATTGAAGGTCTGAGTTTGTTGT
JMSF013F17+ ATTGGGTTTGGGTAATATCAGATGAGAGATTGAAGGTCTGAGTTAGTTGTACTGTTGAAA
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consensus ATTGGGTTTGGGTAATATCAGATGAGAGATTGAAGGTCTGAGTTAGTTGTACTGTTGAAA
 
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JMSF009C10+ TTATGAAGTAGAGTAGATTAGAGTCTCTGAATTGAAACTCAGATCAGATGAGAGTTATTG
JMSF013F17+ TTATGAAGTAGAGTAGATTAGAGTCTCTGAATTGAAACTCAGATCAGATGAGAGTTATTG
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consensus TTATGAAGTAGAGTAGATTAGAGTCTCTGAATTGAAACTCAGATCAGATGAGAGTTATTG
 
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JMSF009C10+ AAATGAGTATACTGGTATAGCAGAGATGGGATAAGATCTGGTGAATGAATTATTGATGGG
JMSF013F17+ AAATGAGTATACTGGTATAGCAGAGATGGGATAAGATCTGGTGAATGAATTATTGATGGG
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consensus AAATGAGTATACTGGTATAGCAGAGATGGGATAAGATCTGGTGAATGAATTATTGATGGG
 
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JMSF009C10+ ATATTGGGATGAGTAATTCTATACTTCC
JMSF013F17+ ATATTGGGATGAGTAATTCTATACTTCCTATGATTTGGTATGAATACATGTGAATATACC
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consensus ATATTGGGATGAGTAATTCTATACTTCCTATGATTTGGTATGAATACATGTGAATATACC