Contig 013753:  Sequence
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JMFF033L09-                                                    ATCAATACATTTATCCCGA
                      ____________________________________________________________
consensus                                                      ATCAATACATTTATCCCGA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF018A07-                                                           ACTAGAATGGCA
JMFF033L09-           TGAGATGATGAGTTGCTTAAATCCTCCCTCACTGTTTTGACTAACTTTACTAGAATGGCA
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                      ____________________________________________________________
consensus             TGAGATGATGAGTTGCTTAAATCCTCCCTCACTGTTTTGACTAACTTTACTAGAATGGCA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF018A07-           ACCTTCTCGTTTGCCCTATCCAACCATCTCAACGGCCTGCCGGAGCCCCGCCCGGAAAAA
JMFF033L09-           ACCTTCTCGTTTGCCCTATCCAACCATCTCAACGGCCTGCCGGAGCCCCGCCCGGAAAAA
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                      ____________________________________________________________
consensus             ACCTTCTCGTTTGCCCTATCCAACCATCTCAACGGCCTGCCGGAGCCCCGCCCGGAAAAA
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF018A07-           CAGTCCACCTTCATCTCCGAGGAGGAGCTCCGCTCCGAATTCTCCCACCATGACCCCGCC
JMFF033L09-           CAGTCCACCTTCATCTCCGAGGAGGAGCTCCGCTCCGAATTCTCCCACCATGACCCCGCC
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF018A07-           GTCGCCCGCATCAATAACGGCAGCTTCGGCTCCTGCCCGGCATCCATTCTCGCCGACCAG
JMFF033L09-           GTCGCCCGCATCAATAACGGCAGCTTCGGCTCCTGCCCGGCATCCATTCTCGCCGACCAG
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                      ____________________________________________________________
consensus             GTCGCCCGCATCAATAACGGCAGCTTCGGCTCCTGCCCGGCATCCATTCTCGCCGACCAG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF018A07-           GAACGCTGGCGCCTCCGCTTCCTTGAGCAACCCGATAATTTCTGCCTCAACGTCCTCAAA
JMFF033L09-           GAACGCTGGCGCCTCCGCTTCCTTGAGCAACCCGATAATTTCTGCCTCAACGTCCTCAAA
rJMSF018A07+          GAACGCTGGCGCCTCCGCTTCCTTGAGCAACCCGATAATTTCTGCCTCAACGTCCTCAAA
                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
JMSF018A07-           CCCTCCATTTTGGAGTCCCGTTCC                                    
JMFF033L09-           CCCTCCATTTTGGAGTCCCGTTCC                                    
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                      ____________________________________________________________
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                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF018A07+          AGAGATTGTTTTCGTGTTGAGGTGCCTATATATTATAGGCCACCATTGGAAGGTGATGGG
rJMFF033L09+          AGAGATTGTTTTCGTGTTGAGGTGCCTATATATTATAGGCCACCATTGGAAGGTGATGGG
                      ____________________________________________________________
consensus             AGAGATTGTTTTCGTGTTGAGGTGCCTATATATTATAGGCCACCATTGGAAGGTGATGGG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF018A07+          GATGTTAATCCAATTACAGGGTATGCCAGGATCTCTCACCAAGTGTATAATAAAGTTGAG
rJMFF033L09+          GATGTTAATCCAATTACAGGGTATGCCAGGATCTCTCACCAAGTGTATAATAAAGTTGAG
                      ____________________________________________________________
consensus             GATGTTAATCCAATTACAGGGTATGCCAGGATCTCTCACCAAGTGTATAATAAAGTTGAG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF018A07+          GACTACTATCACTTCAGAGATGCCGTTAACAAGCTCGTAAATGATGGTTTCTCCTGCTCC
rJMFF033L09+          GACTACTATCACTTCAGAGATGCCGTTAACAAGCTCGTAAATGATGGTTTCTCCTGCTCC
                      ____________________________________________________________
consensus             GACTACTATCACTTCAGAGATGCCGTTAACAAGCTCGTAAATGATGGTTTCTCCTGCTCC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF018A07+          CTTCTCCCCAACTAACATGTACGTTCTCCCTAGCTTTAATTTTCCATAGAATAAACAGAT
rJMFF033L09+          CTTCTCCCCAACTAACATGTACGTTCTCCCTAGCTTTAATTTTCCATAGAATAAACAGAT
                      ____________________________________________________________
consensus             CTTCTCCCCAACTAACATGTACGTTCTCCCTAGCTTTAATTTTCCATAGAATAAACAGAT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF018A07+          TTTACCTCTTTCAGTTGATTGTCAACGTTGCTAGGATAGTTGTTCCTTCTATCCAAAATG
rJMFF033L09+          TTTACCTCTTTCAGTTGATTGTCAACGTTGCTAGGATAGTTGTTCCTTCTATCCAAAATG
                      ____________________________________________________________
consensus             TTTACCTCTTTCAGTTGATTGTCAACGTTGCTAGGATAGTTGTTCCTTCTATCCAAAATG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMSF018A07+          TTGCTATCTGTGTTGTGAAGCCTAGTAATTTACT                          
rJMFF033L09+          TTGCTATCTGTGTTGTGAAGCCTAGTAATTTACTTGTCAATTATGGATTATGGAGTCATC
                      ____________________________________________________________
consensus             TTGCTATCTGTGTTGTGAAGCCTAGTAATTTACTTGTCAATTATGGATTATGGAGTCATC
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF033L09+          AGATTGTCATTGTTTCCATAATTGTTCCTTCTGTCCAATAATTTTACTCTCCTCTCCTTT
                      ____________________________________________________________
consensus             AGATTGTCATTGTTTCCATAATTGTTCCTTCTGTCCAATAATTTTACTCTCCTCTCCTTT
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF033L09+          GTTCTCATACAGAACCATGGCTCTCGAAAATGTATGGCGGTTTGTAAGGAAATAAAGTTG
                      ____________________________________________________________
consensus             GTTCTCATACAGAACCATGGCTCTCGAAAATGTATGGCGGTTTGTAAGGAAATAAAGTTG
 
                          .    :    .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
rJMFF033L09+          TGCCTTCGCTACTAGCTATAGTTTTTAACGTAGTGGTAAACGCTTGATCCTAATAGCTAC
                      ____________________________________________________________
consensus             TGCCTTCGCTACTAGCTATAGTTTTTAACGTAGTGGTAAACGCTTGATCCTAATAGCTAC